Die Zelle – ein komplexes Ding

RNA-Polymerasen

PM

MM

FeatureProbe Pair

Wilcoxon test• nicht-parametrisch• gepaart • Testet PM > MM

Gesättigter Wert

Berechnung eines repräsentativen Expressionswertes und einer Signifikanz

75% Perzentil der PM-Intensitäten

Expressionsanalyse in der Krebsforschung

GenexpressionProteinexpression

Phänotyp

DifferenzielleGenexpression

DifferenzielleProteinexpression

Kandidatengen: differenziell exprimiert in Tumorzellenfür Diagnostik und Therapie

Am Beispiel des Bronchialkarzinoms

Oligo-Array-Experiment

Extraktion der poly-A-RNA

Fragmentierung Hybridisierung

Färbung

Amplifikation und Markierung

der RNA

cDNA-Array Technology

Microarray

1. Microarray preparation

PCR-Amplificationof the genes of interest(one gene - one tube)

Spotting of each cDNAon a defined place

3. Hybridization

2. Sample preparation

4. Image and data analysis

Cell collection

mRNA extraction, amplification

FlourecenceLabeling

Red/Green-ratiobackground corrected intensity