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Biochemie 05 – Nukleotide – 1
Inhalt der Vorlesung Nucleinsäuren, DNA und Co
Lipide Einteilung und Funktion, zusammengesetzte und nicht-hydrolysierbare Fette, Terpene, Steroide, Vorkommen und Bedeutung, Membranen
Nukleotide und Nukleinsäuren- Struktur, Vorkommen und Bedeutung- DNA & RNA, ATP, NAD+ & NADP+
- DNA-Helixstruktur,- von der DNA zum Chromosomen - DNA-Protein Wechselwirkungen- DNA-Analytik- Historische Fakten
KohlenhydrateEinteilung und Funktion von Kohlenhydraten, Reaktionen, Modifizierungen, Herstellung und Analytik
Biochemie 05 – Nukleotide – 2
DNA der Bakterien ist häufig zirkulär
Von der DNA zum Chromosom
Biochemie 05 – Nukleotide – 3
Elektronenmikroskopische Aufnahme von DNA:Variation der Superstruktur
Von der DNA zum Chromosom
entspannter RingZunahme des Supercoils
Biochemie 05 – Nukleotide – 4
Von der DNA zum Chromosom
Biochemie 05 – Nukleotide – 5
Eukaryonten: DNA ist um Proteine (Histone) gewickelt!
Von der DNA zum Chromosom
Biochemie 05 – Nukleotide – 6
Von der DNA zum Chromosom
+ Histon H1
Biochemie 05 – Nukleotide – 7
Von der DNA zum Chromosom
Biochemie 05 – Nukleotide – 8
Von der DNA zum Chromosom
Biochemie 05 – Nukleotide – 9
Von der DNA zum Chromosom
Biochemie 05 – Nukleotide – 10
Von der DNA zum Chromosom
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Von der DNA zum Chromosom
Chromatin
Chromosom
Chromatinfiber
Nukleosomen
Histone
DNA
Durchmesser: 20ÅLänge (total): 1.80m
Spaghetti:Durchmesser: 1mmLänge: 900km!!!
Packungsdichte:>10.000-fach!
Biochemie 05 – Nukleotide – 12
Von der DNA zum Chromosom
DNA im Kern Proteine im Cytoplasma
Biochemie 05 – Nukleotide – 13
Von der DNA zum Chromosom
Biochemie 05 – Nukleotide – 14
Von der DNA zum Chromosom
Biochemie 05 – Nukleotide – 15
Von der DNA zum Chromosom
Proteine binden an DNA:
� Histone� Enzyme (Gyrasen, Restriktionsenzyme, Polymerasen)� Transkriptionsfaktoren� Regulatoren
DNA-bindende Protein-Motive:
� Helix-Turn-Helix� Zink-Finger� Leucine Zipper
Biochemie 05 – Nukleotide – 16
DNA-Protein-Wechselwirkungen
• Genregulation• DNA-Struktur• Transport (Zellteilung)
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
N
NN
N
NO
N
N
N
O
H H
H
HH
G
C
N
N
H
His
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
N
NN
N
NO
N
N
N
O
H H
H
HH
G
C
NN
N
H
HH
H
Arg
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
Helix-Turn-Helix-Motif
große Furche
Erkennung
Fixierung
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
Helix-Turn-Helix-Motif
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
Biochemie 05 – Nukleotide – 23
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Helix-Turn-Helix-Motif in Homeodomain-Proteinen
Biochemie 05 – Nukleotide – 24
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Helix-Turn-Helix-Motif in Homeodomain-Proteinen
Biochemie 05 – Nukleotide – 25
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Helix-Turn-Helix-Motif in Homeodomain-Proteinen
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
Zink-Finger-Motiv
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
Zink-Finger-Motiv
Transactivation
Dimerization interface,HSP90 binding,inhibtory functiontransactivation
Transactivation DNA binding
Biochemie 05 – Nukleotide – 28
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Zink-Finger-Motiv
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
Zink-Finger-Motiv: DNA-Bindung
Biochemie 05 – Nukleotide – 30
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Zink-Finger-Motiv
Biochemie 05 – Nukleotide – 31
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Zink-Finger-Motiv in Steroid-Rezeptoren
Biochemie 05 – Nukleotide – 32
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Zerstörung des Zink-Finger-Motivs in der Chemotherapie
Biochemie 05 – Nukleotide – 33
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Zerstörung des Zink-Finger-Motivs in der Chemotherapie
Biochemie 05 – Nukleotide – 34
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Leucine Zipper Motiv
Biochemie 05 – Nukleotide – 35
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Leucine Zipper Motiv
Biochemie 05 – Nukleotide – 36
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Leucine Zipper Motiv
Biochemie 05 – Nukleotide – 37
DNA-Protein-Wechselwirkungen
Helix-Loop-Helix Motiv
Leucine Zipper
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
Helix-Turn-Helix(Homeo Domain)
Zink Finger
Leucine Zipper
Helix-Loop-Helix
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DNA-Protein-Wechselwirkungen
DNA-Erkennung mittels β-Faltblätter
met Repressor mit gebundenem S-Adenosyl-Methionin
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DNA Analytik
Biochemie 05 – Nukleotide – 41
DNA Analytik
Restriktionsenzyme: DNA-spaltende Enzyme mit hoher Spezifität
Biochemie 05 – Nukleotide – 42
DNA Analytik
Restriktionsanalyse:
Gelelektrophorese:
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DNA Analytik
Ethidiumbromid
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DNA Analytik
Biochemie 05 – Nukleotide – 45
DNA Analytik
?
Biochemie 05 – Nukleotide – 46
DNA Analytik
DNA
Edwin M. Southern
Sonde
Sonde
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DNA Analytik
