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Stichwortverzeichnis – 146

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H.-J. Müller, D. R. Prange, PCR – Polymerase-Kettenreaktion, DOI 10.1007/978-3-662-48236-0, © Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2016

Stichwortverzeichnis

1 Sekunden PCR 107, 1083’→5’ Exonucleaseaktivität 4, 183’-Adenylierungsaktivität 4, 305'-Phosphat 23ß-Actin 62

AAberration 122Adenosin 6Aerosole 11Agarose 23Agarosegelelektrophorese 23ALEXA 67Allel 118Allelspezifisch 119Allgemeines Troubleshooting 11Alu 94Alu-Element 94Alu-PCR 94Alu-Sequenz 95Amplicon 66Amplification Refractory Mutation-

System 119Amplifikation 2AMV 50, 51Anker-Oligonucleotid 56, 59Annealing 2, 6Annealing-Optimierung 100Annealing-Temperatur 2Anode 23Arbitrarily Primed 116Arbitrary Primer 126ARMS-PCR 119ASP 119A-Überhang 30Avian Myeloblastosis Virus 51Avidin-Alkalische Phosphatase 130Avidin-AP Konjugat 130Avidin-Partikel 128

BBakterien 25Bakterienklon 27Basenpaarverhältnis 6BEAMing 134Beschleuniger 5BHQ 67Biotin 127Biotin-Markierung 126Blau/Weiß-Selektion 27

Blocker Molekül 71Block-Lösung 130Blockuniformität 8Blotting-Analyse 130Blunt End 22Blunt End-Ligation 25

CCaCl₂ 26Calf Intestine Alkalic Phosphatase 23CascadeBlue 67cDNA-Population 126cDNA-Synthese 128CIP 23Cofaktor 5Colony PCR 77, 78Cyanin 67Cycle-Sequencing 112Cytidin 6

DDABCYL 66, 67DD-PCR 126Deep Vent Pol 19Degenerate Oligonucleotid Primer 90Deletion 122Denaturierung 2Dephosphorylierung 23Desoxynucleosid-Triphosphat 5Desoxy-Ribonucleic Acid 2Desoxy-Ribonukleinsäure 2Detektionslimit 24Detektions-PCR 14Differential-Display 126Differential Display PCR 126Dimer 7Dimethylformamid 26Dimethylsulfoxid 5, 6, 26, 101DNA 2, 116DNA-Kontamination 11DNA-Polymerase 3, 4, 14DNA-Polymorphismus 116DNA-Transfer 25DNA-Verunreinigung 7DNS 2dNTPs 2, 5DOP-PCR 90, 116Dot-Blot-Analyse 118DP 118DQ 118

DQA1 118DR 118dsDNA 2dUMP 38dUracil 38dUTP 38

EE.coli DNA-Polymerase I 3EDTA 5, 6Elongation 3Elongationszeit 3Emission 66, 67Emissionsignal 66Emissionsparameter 67Emissionsspektrum 67Emulsions-PCR 133Enzyminaktivierung 23Ethidiumbromid 24, 74Exon 123Exonuclease 34Exonucleaseaktivität 4, 68Expressionsmuster 126Extensionsschritt 3Extinktion 66, 67

FFAM 67Fast-Violett B Salt 130Fehlbasenpaarung 19Fehlersuche 11Fehlpaarung 98Filterpapier 130Filtertip 11Fingerprint-Analyse 116Fingerprinting 117FISH 90Flow Cell 140Fluorescence In Situ Hybridisation 90Fluorescence Resonance Energy Trans-

fer 73Fluoreszenzintensität 66Fluoreszenzlöschung 66Fluoreszenzmolekül 66Fluoreszenzsignal 73Fluorophor 66Flüssigkultur 26Flüssigstickstoff 26Formamid 5, 6, 101Formel für Oligonucleotid 6

146

FRET 73Full Length 56Fusionsprotein 4

GGAPDH 62Gendefekt 123Genexpressionsdetektion 50Genom 94Genomtypisierung 116Genom-Veränderung 123Genotyp 82Gerichtsmedizin 118glattes Ende 22Glutathion-Aldehyd-Phosphat-Dehyd-

rogenase 62Glycerin 6Glycerinbakterienstock 26Glycosylase 38Gradienten-PCR 100, 104Gradienten-Thermocycler 7, 100Guanosin 6

HHairpin 69HEG 71Heizdeckel 7Heparin 5, 6HEX 67Hexethylene Glycol 71High Fidelity 18High-Fidelity 18HLA-Gene 117HLA-Klasse 117HLA-Klasse II-Loci 118HLA-Klasse II Typisierung 117HLA-Loci 82HLA-Locus 118HLA-Polymorphisms 118HLA-System 118Hotstart 99Hotstart DNA-Polymerase 100Hotstart-Enzyme 99Hotstart-PCR 98Housekeeping Gene 62Human Leucocyte Antigen 117Hydrolyse 22

IIllumina Sequenzierung 140Immunantwort 117Inhibitor 5

Insert 27Insertion 122Inserts 22Interkalator 24, 74interkalierende Substanz 24interkaliert 24Interspersed Repetitive Sequence 94Ion Torrent Sequenzierung 141IPTG 26IRS 94

JJM109 26JOE 67

KKapillarblot 130klebriges Ende 22Klenow Fragment 3Klonierung 18Knochenmarktransplantation 118kompetent 26Kondensation 8Kontamination 7Kontaminationsquelle 11Kühlrate 8

LL1-Element 94L1-Familie 94Lambda-DNA 109LB/Amp-Platte 26LB-Medium 26LD-PCR 112Lesegenauigkeit 18, 112LIC 34Ligase Independent Cloning 34Ligase-unabhängige Klonierung 34Ligation 24Long Distance-PCR 111, 112

MMagnesiumchlorid 5Magnesiumsulfat 5Matrix 23Matrize 6, 7Maxam-Gilbert 140Megaprime-PCR 45, 46Megaprimer 108Membranstück 130

mesophilen 3Methylierung 5Methylrot 66, 67Mg²+-Ion 5Mg₂SO₄ 5MgCl₂ 5Mg-Konzentration 5MgSO₄ 5Migration 23Mikrotiterplatte 7Minipräp 27Minipräp-Methode 27Mismatch 126MMLV 50, 51Molecular Beacon 69Moloney Murine Leukemia Virus 51mRNA-Bindungspuffer 128mRNA-Population 126Multiplex-PCR 122Mutation 82Mutationsanalyse 81, 82, 116

NNaphtol-AS-Phosphat 130Natriumdodecylsulfat 6Negativ-Kontrolle 11Nested PCR 85, 86Next-Generation-Sequencing 140NGS 140Nonidet P40 6Northern-Blotting 62Nucleotid 5Nylonmembran 130

OOD 7Öl-freie PCR 7Oligo 6OligodT-Primer 126Oligonucleotid 6Oligonucleotid-Anlagerung 6Oligonucleotidkonzentration 6Oligonucleotid-Verlängerung 3Ölschicht 8

PParaffin 98PASA 119PCR-Artefakt 126PCR-Beschleuniger 5PCR-Effizienz 2PCR-Enhancer 5

147Stichwortverzeichnis

A–P

PCR-Hemmstoff 5PCR-Komponent 102PCR-Kontamination 11PCR-Kontrolle 11PCR-Matrize 7PCR-Optimierung 97, 98PCR-Parameter 10PCR-Profil 108PCR-Programm 10PCR-Puffer 4PCR-Sensitivität 2PCR-Strip 7PCR-System 11PCR-Zyklus 3Peltierelement 108Peltiertechnologie 8Peltier-Thermocycler 108Petroleumharz 98Pfu Pol 4P.furiosus 4Phagen-DNA 109Phosphatase 23Phosphatrückrad 23Phosphodiesterbindung 25Phusion 19Plasmidpräparation 27Polyacrylamid 23polyA-RNA 128Poly(dG) 59Poly(dG)-Anker-Primer 59Poly(dT)-Anker-Primer 59Poly(dT)-Linker 59Polyethylenglycol 6000 6Polymerase 3Polymerase Chain Reaction 2Polymerase-Kettenreaktion 2Polymorphisme 118Polystyrene-Partikel 127Positiv-Kontroll-PCR 11Primärklonierung 26Primer 4, 6Primer-Dimer 98Primer-Dimer-Struktur 76Prinzip der PCR 2Programmprofile 10Proofreading 18, 112Proofreading-Aktivität 4Proofreading Polymerase 18Propidiumjodid 24Prozessivität 3, 112Pseudoge 76Pufferoptimierung 102Pulsfeld-Gelelektrophorese 94Punktmutation 82, 122Pwo-Pol 4P.woseii 4

Pyrococcus furiosus 4Pyrococcus woseii 4Pyrophosphat 5

QQPCR 62QPCR-Standard 62Quantifizierung 62, 66Quantitative PCR 61, 62Quencher 66Quencher-Molekül 66

RRACE-PCR 55, 56Random Amplified Polymorphic

DNA 116Random Hexamer 90RAPD-PCR 116Rapid Amplification of cDNA Ends 56rare cutter 42Reaktionsansatz 10Reaktionspuffer 5Real-Time PCR 66Real-Time-PCR-Matrize 67Real-Time-PCR-Quencher 67Real-Time System 67Re-Ligation 23Restriktionsenzym 22Restriktionsverdau 22Reversen Transcriptase-PCR 50Reverse-Transkriptase 50Reverse Transkription 50Rhodamin 67RNA-Matrize 50RNase A 27RNAse H 50ROX 67RTasen 50RT-PCR 49, 50

SSanger 140Saturierungseffekt 64Schmelzwert 2Scorpion 71SDS 5, 6Sekundärstruktur 50Sensitivität 14Single Nucleotide Polymorphism 82SNP 82SNP-Mutante 83

Spezifität 5Stammbaumuntersuchung 116Standard-Klonierung 22Startmolekül 4Sterilität 11Sticky End 22Sticky End-Ligation 25Stocklösung 10Substrat 5supercoiled 26Surf-Klonierung 41, 42SYBRGreen 67SYBRGreen™ Detektion 74

TT4-DNA-Ligase 24T4 DNA-Polymerase 34T4 Phagen 24T/A-Cloning 30TAMRA 67Taq-DNA-Polymerase 3, 4TaqMan 68Taq-Pol 4Taq/Pwo-Mix 19Temperaturerhöhung 108Temperaturgenauigkeit 8Temperaturgradient 100Temperaturoptimum 3TET 67Texas Rot 67Tfl Pol 4Thermatoga neopolitana 4Thermococcus litoralis 4Thermocycler 7Thermocycler-Profil 10Thermostabile DNA-Polymerase 4Thermotoga maritima 4Thermus aquaticus 3, 4Thermus flavis 4Thermus thermophilus 4Th.flavis IXThymidin 6Tli-Pol 4Tm 6Tma-Pol 4Tm-Wert 2, 6Tne-Pol 4TouchDown 100TouchDown-PCR 100Transfektion 25Transformant 26Transformation 25Transformationseffizienz 23, 26Transilluminator 24Transkriptaseaktivität 4

148 Stichwortverzeichnis

Transkriptmuster 126Transkriptom 127Triton X-100 6Troubleshooting 11Tth-Pol 4T-Überhang 30T-Vektor 30TWEEN-20 6Typisierung 117

UÜbernachtkultur 26UDG 38UlTma 4Ultrafast-Minipräp-Methode 27UNG 38UNG-Klonierung 37, 38Uracil 38Uracil-DNA Glycosylase 38UV-Anregung 24UV-Licht 24

VVaterschaftstest 116Vektor 26Vent 4Verunreinigung 7, 11Vervielfältigung 2Viskosität 25

WWachs 99Wachskugel 98Wanderungsverhalten 23Wildtyp 82Wobble Primer 19Wobble-Struktur 6

XX-Gal 26

YYAC 94Yeast Artificial Chromosomes 94

ZZeitverkürzung 108Ziel-DNA 6Zinkfingergen 101Zyklus 10Zyklusanzah 3

149Stichwortverzeichnis

P–Z