View
0
Download
0
Category
Preview:
Citation preview
09.07.2017 | Maria J.G.T. Vehreschild| Klinik I für Innere Medizin
Das menschliche Mykobiom – Mehr als nur ein Modewort?
Priv.-Doz. Dr. med. Maria J.G.T. Vehreschild
Klinik I für Innere Medizin
Klinisches Studienzentrum 2 für Infektiologie
AG Klinische Mikrobiomforschung
Definitionen
• Die Mikrobiota (Singular!): Gesamtmenge aller den
Menschen kolonisierenden Lebewesen (Bacteria,
Archaea, Eukaryota)
• Das Mikrobiom: Gesamtheit aller mikrobiellen Gene im
menschlichen Organismus (bezieht sich aber in der
Praxis meist auf bakterielle Analysen)
• Das Mykobiom: Gesamtheit aller fungalen Gene im
menschlichen Organismus
• Das Metabolom: Gesamtheit der niedermolekularen
(unter 1500 Da) stoffwechselaktiven Bestandteile bzw.
Metabolite eines biologischen Systems
ED Green et al. Nature 470, 204-213 (2011)
Molekularbiologische Methoden - Sequenzierung
Human Microbiome Project
• Interdisziplinäres
Forschungsprojekt der
National Institutes of
Health
• Charakterisierung der
Flora verschiedener
Organe
• Rolle der Mikroben für
menschliche
Gesundheit und
Krankheiten
Analysemethoden
Stewart, 2013, New England Biolabs Inc.
Grundlagen Mikro/Mykobiomanalyse
18s rDNA
ITS
rDNA
Huseyin et al. Front Microbiol. 2017 Jul 31;8:1432.
Methoden-
vergleich
Die Darm-Hirn-Achse
Bild aus Stallmach, Vehreschild (Hrsg.) Mikrobiom 2016, de Gruyter
Grundlagen Metabolomanalyse
Organtypische Standortflora
Marsland, Nature Reviews Immunology 14, 827–835 (2014)
Die Hauptachsen
Gut-Brain Axis
Gut-Immune Axis
Gut-Liver Axis
Gut-Lung Axis
Bild aus Stallmach, Vehreschild (Hrsg.) Mikrobiom 2016, de Gruyter
Tamburini. Nat Med. 2016 Jul 7;22(7):713-22.
Mycobiome = Neuland
Pubmed Hits:
• Microbiome: 35.135
• Virome: 394
• Mycobiome: 130 (erste Erwähnung 2010)
Mykobiom des Menschen - Fakten
• 180 Spezies
• Nur 2% des Mikrobioms im Vergleich zu
bakteriellen Vertretern
• 10fach größere Zellmasse als Bakterien
• Relevante Metabolitenproduktion vorhanden
Mykobiom Hauptvertreter
Hof et al. Z Gastroenterol. 2017 Aug;55(8):772-778.
Mykobiom und Regulation
Limon et al. Cell Host Microbe. 2017 Aug 9;22(2):156-165.
Alkohol und Mykobiom
Yang et al. J Clin Invest. 2017 Jun 30;127(7):2829-2841.
Alkohol und Mykobiom
Yang et al. J Clin Invest. 2017 Jun 30;127(7):2829-2841.
Interaktionen Pilze-Bakterien
Sam et al. Int J Mol Sci. 2017 Feb 4;18(2).
Ghannoum et al. mBio 2016; doi:10.1128/mBio.01951-16
Interaktionen Pilze-Bakterien
El-Jurdi et al. Microbiol Spectr. 2017 Jun;5(3).
Interaktionen Pilze-Bakterien
Zusammenfassung
• Definition Mykobiom: Gesamtheit aller fungalen Gene im
menschlichen Organismus
• Aktuell guter Methodenvergleich publiziert
• Verlinkung mit Immunanalysen und Metabolomanalysen
notwendig
• Verlinkung mit bakterieller Mikrobiomforschung sinnvoll
• Fazit: noch wenig Fakten, aber viel Potential
Clinical Microbiome Research Group
Team lead:
Priv.-Doz. Dr. med. Maria J.G.T.
Vehreschild
University Hospital of Cologne
Department I of Internal Medicine
Phone: +49 221 478-88794
Fax: +49 221 478-85504
E-Mail: maria.vehreschild@uk-koeln.de
Physicians:
Lena Biehl
Rebeca Cruz Aguilar
Post-Doc:
Fedja Farowski
Study Nurses:
Larisa Idrizovic
Stefan Körfken
Tatjana Lammertz
Susanna Proske
PhD Student:
Anastasia Tsakmaklis
Doctoral candidates:
Vanessa Bücker
Rafael Hartel
Catharina Hilpert
Alexandra Huth
Rosemarie Petri
Kathrin Peter
Bill Schwieren
Jannik Stemler
Team assistant:
Angelina Lagodny
Finances:
Justine Stanik
Recommended