Zu den bisherigen Themen/Abgabeaufgaben Recherchestrategien Allgemeines zu SciFinder Stand : 7.7....

Zu den bisherigen Themen/Abgabeaufgaben

Recherchestrategien

Allgemeines zu SciFinder

Stand : 7.7. 2008

Dr. Ina Weiß,Biologisch-Pharmazeutische Fakultät, Wissenschaftliche Informationsstelle am Lehrstuhl für Bioinformatik

Dieses Material im Internet

http://pinguin.biologie.uni-jena.de/ pub2/ SciFinderClientBiochemie2008.ppt

Mit Hinweisen - zu den bisherigen Themen- zu SciFinder Client /Web und den Datenbanken in

SciFinder- zur Komplexaufgabe

Zur Vorlesung / AbgabeaufgabenSoll: 2 Semesterwochenstunden, Vorlesungszeit bis 18.7.Ist: Alle 14 Tage 2 h pro Woche, Ende bereits am

1.7. bzw. 8.7.!Fazit: Abgabeaufgaben sind locker im Rahmen der 2

Semesterwochenstunden lösbar, d.h. keinerlei Mehraufwand! 14 Stunden Zeit für die Aufgaben, an denen eigentlich VL/Übung wäre

Stand bisher: 35 Studenten haben sich bisher schon mit Abgabeaufgaben befaßt, davon:

29 fertig (davon 1 x die Zusatzaufgabe, 1 Komplexaufgabe, 1x mit nur 2 Teilaufgaben 6 haben bereits 2 Aufgaben gelöst - nur 4 haben noch gar keine Aufgaben abgegeben

SciFinder Client /Webversion

• SciFinder Client ist im URZ, SR 6 und in der IVS der Chemisch-Geowissenschaftlichen Fakultät installiert

• Ansonsten überall über die ThULB nutzbar!• Auch mit der Client-Version kann man

Strukturrecherchen machen (keine Plugin-Installation erforderlich!)

• Wenn man nicht in die Webversion von SciFinder kommt, dann kann man aber bei der Client-Version Glück haben (oder umgekehrt!)

Zu den bisherigen Themen…

• Zeitschriftendatenbank (ZDB)

- Hierbei handelt es sich um eine Datenbank zur Suche nach Zeitschriftenstandorten (analog Standorte von Büchern)

- Subito ist ein Lieferdienst, keine Lieferbibliothek

- Zum Subito-Lieferdienst gehören verschiedene Lieferbibliotheken

Suche in der Zeitschriftendatenbank

„Suche nach Stichwort “geranyl caffeate” oder Geranylkaffeat ergibt keine Treffer.“

Stichwort bezieht sich in der Zeitschriftendatenbank auf den Zeitschriftentitel bzw. das Dokument in der ZDB. Man könnte feststellen, ob es eine Zeitschrift mit diesem Titel gibt….

Elektronische Fachinformationen

für Biochemiker: Folie/Seite 31!

Suche nach IR-Spektrum von 99-66-1

„IR-Spektrum

Zunächst habe ich unter Research Topic nach „IR spectrum 99-66-1“ gesucht“

Suche nach IR-Spektrum von 99-66-1 (2)

„Dann habe ich das erste Ergebnis gewählt und auf Get References geklickt“

Wenn man schon eine RN hat (oder einen chemischen Namen oder eine Struktur) kann man auch gleich nach der

Substanz in Registry, also bei Substances suchen!

Synthesevorschriften zu Valproinsäure

• CAS Registry Number: 99-66-1 • C8 H16 O2• Pentanoic acid, 2-propyl-• Valeric acid, 2-propyl- (6CI,7CI,8CI); 2-Propylpentanoic acid; 2-

Propylvaleric acid; 4-Heptanecarboxylic acid; 44089; Acetic acid, dipropyl-; DPA; Depakine; Dipropylacetic acid; Ergenyl; Mylproin; NSC 93819; Valproic acid; n-Dipropylacetic acid

Valeric acid hat die RN 109-52-4!

Registry Number: 109-52-4

C5 H10 O2

Pentanoic acid

Valeric acid (8CI);

1-Butanecarboxylic acid;

NSC 406833; Propylacetic acid;

n-Pentanoic acid; n-Valeric acid

Suche nach synthesis valeric acid im Web of Science…

Komplexe thematische Suche

1. Suchen Sie nach Publikationen zum Thema: Valproinsäure als Mittel gegen Krebs.

Welche Suchstrategie(n) verwenden Sie, welche Topic Candidates wählen Sie aus und wie viele Treffer bekommen Sie mit welcher Suchstrategie/Topic Candidates?

Übersetzungshilfen im Internet (1)

http://iate.europa.eu/

Übersetzungshilfen im Internet (2)

http://dict.leo.org/

Übersetzungshilfen im Internet (3)

http://www.dict.cc

Komplexe thematische Suche (2)

• Arzneimittel: medicine, medicament, drug, physic, treatment, pharmaceutical, pharmacon, preparation

• Krebs: cancer, tumor• Valproinsäure: valproic acid, 2-propyl-pentanoic

acid

Medizinisches Wörterbuch

Peter Reuter, Christine Reuter

Thieme-Verlag

ISBN 3-13-100491-6

Komplexe thematische Suche (2)

• valproic acid and cancer

→ besser mit natürlichsprachigen

Suchformulierungen arbeiten…

Komplexe thematische Suche (3)

• valproic acid against cancer• valproic acid against tumor

Komplexe thematische Suche (4)

• valproic acid against cancer,tumor

Zur Überprüfung der Ergebnisse unbedingt dieTrefferlisten und die Detailanzeige zu denReferenzen ansehen!!!

Erläuterungen zur Komplexaufgabe

• Vorkommen von bestimmten Fettsäuren in Mikroalgen

• Führen Sie eine Literatur – und Faktenrecherche zum Thema „Vorkommen von Fettsäuren in Mikroalgen“ durch und beschränken Sie sich dabei auf die Jahre 2005-2008. Bei den Fettsäuren sollen nur eicosapentaenoic acid (EPA) und docosahexaenoic acid (DHA) eine Rolle spielen.

Das Thema „Vorkommen von Fettsäuren inMikroalgen“ betrifft die gesamte Komplexaufgabe.Alle Teilfragen haben mit diesem Thema zu tun!

Erläuterungen zur Komplexaufgabe (2)

• Kann man auch nur mit den Ankürzungen EPA und DHA suchen? Begründen Sie Ihre Aussage anhand der Ergebnisse aus der Datenbank Registry.

Wenn hier steht Registry, dann ist auch gemeint, das Sie die Suche mit EPA und DHA in der Datenbank Registry durchführen (und eben nicht im Beilstein!),um diesen Teil der Aufgabe beantworten zu können!

Erläuterungen zur Komplexaufgabe (3)

• Analysieren Sie die Ergebnisse aus beiden Datenbanken hinsichtlich Dokumententyp und Publikationsjahren.

Bei bibliographischen Datenbanken ist mit Dokumententypen gemeint, ob die Dokumente aus Zeitschriften, Patenten, Büchern, Preprints, Reviews etc. stammen…

Weiterführende Literatur zu SciFinder Scholar

• A. Ben Wagner: SciFinder Scholar 2006: An Empirical Analysis of Research Topic Query Processing, J. Chem. Inf. Model. 2006, 46, 767-774http://pubs.acs.org/cgi-bin/sample.cgi/jcisd8/2006/46/i02/pdf/ci050481b.pdf

• Ridley, Damon D. : Information Retrieval : SciFinder® and SciFinder Scholar®. - New York : Wiley, 2002. - 252 S.;(engl.) ISBN 0-470-84351-9

• CAplus Bibliografische Datenbank > 27 Mio. Einträge, ab 1907

und mehr als 44.000 Einträge aus Publikationen vor 1907• MEDLINE Biomedizinische Informationen, > 15 Mio Einträge ab 1950

• CASreact > 13 Mio. Einstufen- und Mehrstufen Reaktionen ab 1840

• Registry - Substanzen ab 1957, - > 31 Mio. organische und anorganische

Verbindungen, außerdem > 59 Mio. Sequenzen

• Chemcats > 8 Mio Käufliche Substanzen > 766 Kataloge, > 655 Produzenten

• Chemlist Regulated CHEMicals LISTing > 245 000, Informationen zu chemischen Substanzen

aus nationalen, US-amerikanischen und internationalen Verzeichnissen und Regelwerken

Die Datenbanken in SciFinder Scholar

Suchdiagramm für die Datenbanken in SciFinder

Chemlist ist derzeit nur in der Client-Version enthalten.

Faktendatenbanken

Bibliographische Datenbanken für die Suche nach Literaturstellen

Datenbanken und Suchmöglichkeiten in

Bibliographische Datenbanken

Nachweise von Zeitschriftenartikeln,

Patenten,Büchern,

Dissertationen,

etc.

Chemische Reaktionen

Reaktionsdatenbank

Chemische Verbindungen

Substanzdatenbank