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研究室のフナコさん
オススメ
No.6972/152020
p.31
マイクロバイオーム・次世代シークエンス ▼ p.03
p.24
p.26
マウスモノクローナル抗体作製受託サービスヒトES/iPS細胞分化抑制物質
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号 No.697
マイクロバイオーム・ 次世代シークエンス特集
オススメメーカーのご紹介 次世代シークエンス用ライブラリー調製
そのほか
マイクロバイオーム研究やメタゲノム解析を 総合的にサポートする
p.3
マイクロバイオーム スタンダード
試料の保存・核酸精製
様々な試料中の核酸を室温保存できる試薬 p.7
環境試料からの核酸抽出キット p.8~9
真核生物試料から微生物由来 DNA を精製するキット p.10
土壌試料からゲノム DNA を精製するキット p.10
糞便試料からゲノム DNA を精製するキット p.10
様々な試料から長鎖 DNA を精製するキット NEW p.11
マイクロバイオームのスタンダード p.4
マイクロバイオームの絶対定量用スタンダード p.5
ロングリードシークエンシング用の DNA スタンダード p.6
キャピラリー電気泳動装置 p.21
クロマチン/DNA せん断などに使用できる破砕装置 p.21
次世代シークエンサーを使用した受託サービス p.22~23
rRNA を含まない RNA ライブラリーを調製できるキット NEW p.12
わずか 1.5 時間で 16S rRNA ライブラリーを調製できるキット p.13
DNA 増幅・断片化・タグ標識を一度の反応で行えるキット p.14
Illumina シークエンサー用ポジティブコントロール ライブラリー p.15
DNA ライブラリー調製キット p.16
small RNA ライブラリー調製に有用な逆転写酵素 p.16
3’ 末端構造解析に特化した RNA-Seq ライブラリー調製キット p.17
メーカーインタビュー「リボソーム解析の最先端へ」 p.18
活性型リボソームの分離/Ribo-Seq ライブラリーの調製キット p.19
Oxford Nanopore シークエンサー用 短鎖 RNA ライブラリー調製キット p.20 NEW
マウスモノクローナル抗体作製受託サービス p.24
イムノクロマトグラフィー作製受託サービス p.24
ペプチドシークエンス受託サービス p.25
ヒト腫瘍組織アレイ p.25
ヒト ES/iPS 細胞分化抑制物質 NEW p.26
ルシフェラーゼ活性測定キット p.27
HDL および LDL/VLDL のコレステロール量を定量するキット NEW p.27
NGAL(急性腎障害マーカー)測定キット p.28
NIST 規格に準拠した較正用標準ビーズ p.28
組織透明化試薬 p.29
レンチウイルスによる形質導入を促進する試薬 NEW p.29
RNA 電気泳動用バッファーと RNA 分子量マーカーのセット p.30
着色済み RNA 分子量マーカー p.30
リン酸化タンパク質に対する抗体のアレイ NEW p.31
研究室のフナコさん p.31
実施中のキャンペーン p.31
新製品・オススメ製品
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi newsCONTENTS
2
NOTE※本紙に記載されている価格は,2020 年 2 月 15 日現在です。表示価格に,消費税等は含まれていません。一部価格が予告なく変更される場合がありますので,あらかじめご了承下さい。
※本紙に掲載されている製品は研究用です。医薬品,診断用医薬品,食品,食品検査等の用途には使用できません。
※ 印の製品は,「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律(通称:カルタヘナ法)」使用規制対象となりますので,ご使用に際しては規制に則し,適切にお取り扱い下さい。
※ 印の製品は,取り扱いに厳重な注意を要する製品であり,ご購入時に「使用目的確約書」が必要になります。ご注文の際は,「使用目的確約書」に直筆でご記入の上,販売店経由で当社までお送り下さい。確約書受領後に製品を発送させていただきます。また,これらの製品をご購入後は,鍵の掛かる場所での保管をお願いいたします。
※ 印の製品は,「毒物及び劇物取締法」に基づく医薬用外毒劇物です。法規制に従って,保管,廃棄等して下さい。
※ 印の製品は,毒性があるため,取り扱いに注意または厳重な注意が必要です。製品は,鍵の掛かる場所に保管して下さい。添付されているデータシートや商品ラベルをよくお読み下さい。
※ 印の製品には安全にご利用いただくための警告ラベルが貼られています。表示に従って安全対策を実施して下さい。
※ 印は,液体窒素中での保存を要する製品です。ドライアイス包装で配送していますが,製品到着後,直ちに液体窒素中で保存して下さい。
※ 印は,-80℃ での保存を要する製品です。ドライアイス包装で配送していますが,製品到着後,直ちに-80℃ のフリーザー等に保存して下さい。
※#以下の英数字は,商品コードを示します。※外観・仕様は改善のため,予告なく変更することがあります。※R&D Systems はテクネ コーポレイションの登録商標です。使用に当たっては同社の許可が必要な場合があります。
※© 2020 American Type Cluture Collection. The ATCC trademark and trade name, and any other trademarks listed in this publication are trademarks owned by the American Type Cluture Collection unless indicated otherwise.
※記載されている会社および商品名は,各社の商標または登録商標です。※本紙には各メーカーから提供された画像・図表が掲載されています。なお,画像・図表の著作権は各メーカーが保有しています。
※ご注文の際は,[品名,メーカー,商品コード,包装,数量]をお知らせ下さい。
マイクロバイオーム研究やメタゲノム解析を総合的にサポート
Zymo Research 社は 1994 年に米国カリフォルニア州で創業されたメーカーで,DNA/RNA 精製キットやエピジェネティクス研究用製品を開発・販売しています。遺伝子工学の手法を用いた細菌叢(Microbiota)の研究・解析は Microbiomics と呼ばれます。この一連の 操作は,試料の採取,核酸抽出,シークエンシングおよび解析のステップより構成されますが,この過程において様々なエラーや偏りが発生し,最終的に誤った細菌叢プロファイルとなるリスクがあります。Zymo Research 社では,ZymoBIOMICS と呼ばれる Microbiomics 専用の製品群を開発し,各ステップにおける様々なリスクの排除に有効な製品を提供しています。また Quick-DNA/RNA Kit は,様々な環境試料から PCR や RT-PCR などに直接使用できる高品質な核酸を精製するキットです。
Validated, Non-Biased Workflows from Collection to AnalysisMicrobiome
StandardsSample
CollectionDNA/RNA Extraction
Library Preparation
p.4~6 p.7 p.8~11 p.22p.12~13● Microbial Community Standard● Spike-in Control● HMW DNA Standard
● DNA/RNA Shield ● ZymoBIOMICS DNA/RNA Kit ● ZymoBIOMICS 96 MagBead
DNA/RNA Kit● Quick-Fecal/Soil Microbe Kit● HostZERO Microbial DNA Kit● Quick-DNA HMW MagBead Kit
● RiboFree Total RNA Library Kit● Quick-16S NGS Library Prep Kit
● メタゲノム解析● DNA メチル化解析● ChIP 解析
NGS Analysis
使いやすく高品質なのはもちろん,そのほかに…
特長のあるカラムデザイン!精製用のカラムには Clean-Spin 技術を使用。バッファー類の溶液が残存しないデザインで,純度に優れた核酸を精製できます。
構成品の 単 品 購入が可能!キット構成品は,単品でも購入できるため,不足したコンポーネントの補充が可能です。カラムを追加購入することで,余ったバッファーも無駄なく使用することもできます。※一部,単品購入できない製品もあります。製品データシートまたはフナコシ Web をご確認下さい。
Zymo Research 核酸精製キットの特長オススメポイント
VS.2~3 μl
Contamination0 μlCarryover
ZYMO RESEARCH 他社製品
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
試薬 TEL 03 -5684 -1620
FAX 03 -5684 -1775
reagent@funako
shi.co.jp
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
3
マイクロバイオーム(微生物叢,細菌叢)のスタンダード
ZymoBIOMICS Microbial Community Standard
Webページ番号検索65367
次世代シークエンス(NGS)を用いたマイクロバイオームおよびメタゲノミクス研究において,標準品として有用な微生物混合物/DNA 混合物です。
製品に含まれる微生物試料(10 種類)
グラム陰性菌(3種類) グラム陽性菌(5種類) 酵母(2種類)
Pseudomonas aeruginosa
Escherichia coli
Salmonella enterica
Lactobacillus fermentum
Enterococcus faecalis
Staphylococcus aureus
Listeria monocytogenes
Bacillus subtilis
Saccharomyces cerevisiae
Cryptococcus neoformans
微生物構成比の異なる 2 種類のスタンダードがあります
Community Standard
種 類理論上の構成比(%)
ゲノム DNA
16S rRNA
16S & 18S rRNA
ゲノム コピー数 細胞数
P. aeruginosa 12 4.2 3.6 6.1 6.1
E. coli 12 10.1 8.9 8.5 8.5
S. enterica 12 10.4 9.1 8.7 8.7
L. fermentum 12 18.4 16.1 21.6 21.4
E. faecalis 12 9.9 8.7 14.6 14.5
S. aureus 12 15.5 13.6 15.2 15.1
L. monocytogenes 12 14.1 12.4 13.9 13.8
B. subtilis 12 17.4 15.3 10.3 10.2
S. cerevisiae 2 NA 9.3 0.57 1.13
C. neoformans 2 NA 3.3 0.37 0.73
Ⅰ Community Standard
種 類理論上の構成比(%)
ゲノム DNA
16S rRNA
16S & 18S rRNA
ゲノム コピー数 細胞数
L. monocytogenes 89.1 95.9 91.9 94.8 94.9
P. aeruginosa 8.9 2.8 2.7 4.2 4.2
B. subtilis 0.89 1.2 1.1 0.7 0.7
S. cerevisiae 0.89 NA 4.1 0.23 0.12
E. coli 0.089 0.069 0.066 0.058 0.058
S. enterica 0.089 0.07 0.067 0.059 0.059
L. fermentum 0.0089 0.012 0.012 0.015 0.015
E. faecalis 0.00089 0.00067 0.00064 0.001 0.001
C. neoformans 0.00089 NA 0.0014 0.00015 0.00007
S. aureus 0.000089 0.0001 0.0001 0.0001 0.0001
Ⅱ
ZymoBIOMICS Microbial Community DNA Standard の使用例 (16S rRNA シークエンシング法のコントロールとして使用)
16S V3-4 領域に対するプライマーを用いて,16S rRNA-Seq 法の最適化を検討した。左側の円グラフで見られるノイズは,主に PCR によるアーティファクトやコンタミネーションによるもので,最適化されたワークフロー(右側)ではこれらの増幅が抑制された。
従来法本製品を使用
・Ultra-clean reagents・Ultra-clean processes・Limit PCR cycles・Good MiSeq run・Uchime filtration・Others
最適化ワークフロー
[メーカー:ZYR]
品 名 タイプ 商品コード 包 装 価格(¥)
ZYR336300 ZymoBIOMICS Microbial Community Standard10 種類の不活性化した微生物の混合物
(グラム陰性菌 3 種類,グラム陽性菌 5 種類,酵母 2 種類)
Ⅰ D6300 0.75 ml 49,000
ZYR336310 Ⅱ D6310 1 kit(0.75 ml) 59,000
ZYR336305ZymoBIOMICS Microbial Community DNA Standard
10 種類の微生物から抽出・精製したゲノム DNA の混合物
ⅠD6305 200 ng 20,000
ZYR336306 D6306 2,000 ng 39,000
ZYR336311 Ⅱ D6311 1 kit(200 ng/20μl) 30,000
微生物ゲノムDNAの構成比が,10倍希釈系列となっています。より高感度な解析や,マイクロバイオーム解析ワークフローの検出限界を調べる場合に有用です。
✓ショットガン・メタゲノミクスシークエンシングを用いてロット毎の微生物構成を確認しています。
✓外来 DNA 含有量は<0.01% で,不純物はほとんど含まれていません。
製品の 特長
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
試薬 TEL 03- 5684-1620 FAX 03-5684- 1775
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
4
マイクロバイオーム(微生物叢,細菌叢)の絶対定量ができるスタンダード
ZymoBIOMICS Spike-in Control
Webページ番号検索68731
細胞数,16S rRNA コピー数,DNA 量が既知の微生物スタンダードです。次世代シークエンシングで試料に添加すると,試料中の微生物を絶対定量できます。
製品の種類 Control Ⅰ(High Microbial Load)
ControlⅡ(Low Microbial Load)
微生物の種類 細胞数 16S rRNA の コピー数*1 total DNA*2 細胞数 16S rRNA の
コピー数*1 total DNA*2
Allobacillus halotolerans 2×107 1.4×108 58.2 ng 1.0×103 7.0×103 0.0029 ng
Imtechella halotolerans 2×107 6.0×107 67.2 ng 1.0×104 3.0×104 0.034 ng
Truepera radiovictrix ─ ─ ─ 1.0×105 2.0×105 0.35 ng
*1 16S copies=cells×16S copy number per cell/genome*2 Total genomic DNA (ng)=cells×genome size (bp/genome)×DNA unit conversion constant (ng/bp)
DNA unit conversion constant (ng/bp)=1.079×10-12
ControlⅠを用いた糞便試料中のマイクロバイオーム解析例
ControlⅠを添加した糞便試料から Zymo-BIOMICS DNA Miniprep Kit(p.8 参照)を用いて全 DNA を抽出し,16S rRNA 遺伝子ライブラリーを調製した。調製したライブラリーを次世代シークエンシングで解析し,得ら れ た 結 果 か ら 全 試 料 中 の Imtechella halotolerans および Allobacillus halotol-erans の割合を算出した。添加した微生物の細胞数と試料中の組成比に基づいて各微生物の絶対量を決定した。
保存温度: [メーカー:ZYR]
品 名 対象試料 用 途含まれる微生物
商品コード 包 装 価格(¥)種 類 存在量
Control Ⅰ(High Microbial Load)
糞便など (微生物含有量が多い試料) 各微生物の絶対定量 2 種類 等量
D6320 0.5 ml 19,000 ZYR336320
D6320-10 10×0.5 ml 97,000 ZYR336321
ControlⅡ(Low Microbial Load)
唾液など (微生物含有量が少ない試料)
・各微生物の絶対定量・検出限界の評価・病原体の存在量試験
3 種類 対数量D6321 0.5 ml 19,000 ZYR363210
D6321-10 10×0.5 ml 97,000 ZYR363211
Faecalibacterium sp34558
Blautia wexlerae
Bacteroides dorei
A. halotolerans 5.63%
I. halotolerans 2.67%
A. halotolerans 5.63%I. halotolerans 2.67%
Unfiltered SequencingResults
Filter SequencingResults
Calculated absoluteabundance of microbes
Bioinformatically removespiked-in microbes
1.8×109 total microbial cells
1.2×107Faecalibacterium sp34558
4.7×107Blautia wexlerae
8.4×106Bacteroides dorei
無 料 サ ン プ ル 品 で お 試 し 下 さ い! フナコシWeb 専用フォーム
Webページ番号検索7845
核酸精製 こんなお悩みありませんか?
高濃度!エンドトキシンフリーの プラスミドDNA抽出キット
クロロホルム不使用!溶解液をそのまま カラム精製!
細胞も組織も生体液も このキットでまとめてDNA抽出!
プラスミドの濃度が薄い! 試料の種類ごとにキットを買わなきゃいけないの!?
フェノール抽出が面倒…
ZymoPURE Kit 検索65412 Quick-DNA Plus Kit 検索65494 Direct-zol RNA Kit 検索5429
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
試薬 TEL 03 -5684 -1620
FAX 03 -5684 -1775
reagent@funako
shi.co.jp
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
5
第 3 世代シークエンシング用の信頼性高い DNA スタンダード
ZymoBIOMICS HMW DNA Standard
Webページ番号検索68135
ロングリードシークエンシング(Pacific Biosciences 社および Oxford Nanopore Technologies 社装置)によるDNA シークエンシングおよびメタゲノム解析に使用できる信頼性の高いスタンダードです。8 種類の微生物由来 DNA が含まれています。
HMW DNA Standard に含まれる>50 kb の高分子量 DNA についてHMW DNA Standard(STD),および Standard に含まれる 8 種類の微生物由来 DNAそれぞれを Agilent 2200 TapeStation で解析した。
PA:Pseudomonas aeruginosaEC:Escherichia coliSE:Salmonella entericaEF:Enterococcus faecalisSA:Staphylococcus aureusLM:Listeria monocytogenesBS:Bacillus subtilisSC:Saccharomyces cerevisiae
特 長
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
ZymoBIOMICS HMW DNA StandardZYR D6322 0.75 ml / 77,000 ZYR363220
● >50 kb の 高 分 子 量(HMW:High Molecular Weight)DNA で構成されています。
● 幅広い GC 含量の DNA を混合しているため,GC 含量起因のバイアス確認に有用です。
● ショットガン・メタゲノミクスシークエンシングを用いてロット毎の微生物構成を確認しています。
● 外来 DNA 含有量は<0.01% で,不純物はほとんど含まれていません。
● DNA 濃度:100 ng/μl● 平均相対存在度偏差:<15%
本製品を試料として Ligation Sequencing Kit(Oxford Nanopore Technolo-gies 社)でライブラリーを調製し,MinION(Oxford Nanopore Technologies社)でロングリードシークエンシングを行った。上段:累積スループット量は 15.71 Gb(36 時間読み取り)となった。中段:読み取り長さは,最長>125 kb を記録し,平均は約 24 kb を示した。下段:読み取り回数のベースコール品質は,全体的に良好な q スコア 11 を示した。
1.2 M
1M
800 K
600 KReads
400 K
200 K
03h 20m 6h 40m 13h 20m 16h 40m 23h 20m 1d 2h 1d 6h 1d 9h 1d 12h20h
Time10h
Cumulative Throughput
650MB
600 MB
550 MB
500 MB
450 MB
400 MB
350 MB
300 MB
250 MB
200 MB
150 MB
100 MB
50MB
0 B0 B 16.2 KB 32.4 KB 48.6 KB 64.8 KB
Estimated Reas Length in Bases
Total Estimated Bases
81 KB 97.2 KB 113.4 KB 129.6 KB
Read Length Histogram
5,000
10,000
40,00030,00020,000
6 8 10 12
Quality Score[4,20]
Base Read(bases)[0,70000]
14 16 18 20
50,000
100,000
15,000
25,000
30,000
35,000
20,000
Basecalling Quality
48500150007000
4000
300025002000
15001200900
600
400
250
100
STD PA EC SE EF SA LM BS SC
PacBio
Oxford Nanopore
使用例
フナコシニュース2020年 1月合併号
キレイに磨き上げます
核酸精製特集
ご希望の方は当社営業担当 までお問い合わせ下さい。
営業担当
FAX 03-5684-1634
こちらもオススメ
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
試薬 TEL 03- 5684-1620 FAX 03-5684- 1775
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
6
様々な試料中の核酸を室温で採取・輸送できる!
DNA/RNA Shield無料サンプル品あります
Webページ番号検索65363
微生物の増殖を抑制し,核酸を室温下でも安定的に保存できる試薬です。試薬が充填済みのチューブタイプもあります。
アメリカ航空宇宙局(NASA)で採用された製品です!
✓経費のかかるドライアイス輸送は不要。 ✓保存後の実験のための試薬除去不要。
✓多くの微生物やウイルスを不活化し,試料を経時変化から保護。 ✓マイクロバイオームのプロファイルを維持。
特 長
● 細胞を効果的に溶解し,またヌクレアーゼやウイルスなどの感染因子を不活性化します。
● バイアスのない正確な遺伝情報および発現プロファイルを,室温で長時間保存できます。
● 室温下(4~25℃)で DNA は 2 年以上,RNA は 1 ヶ月まで保存可能です。-20℃/-80℃ では,より長期間の保存が可能です。
● 保存した DNA および RNA は,試薬の除去を行わず,様々な核酸精製キットを用いて直接単離できます*1。
*1 Zymo Research 社の各種核酸精製キットの使用を推奨します。
製品ラインナップ
[メーカー:ZYR]
適用試料 品 名 タイプ DNA/RNA Shield 量 試料量 商品コード 包 装 価格(¥)
❶ 全種類 DNA/RNA Shield サンプル 試薬(溶液)のみ50 ml 試料により
異なるR1100-50 50 ml 13,000 ZYR171123
250 ml R1100-250 250 ml 45,000 ZYR171125
❷ 液体試料(血液などを除く)DNA/RNA Shield (2×concentrate) 試薬(溶液)のみ
25 ml 試料により異なる
R1200-25 25 ml 13,000 ZYR172025
125 ml R1200-125 125 ml 45,000 ZYR172125
❸ 全種類 DNA/RNA Shield Collection Tube 2 ml チューブ入り 1 ml ≦100 μl R1102 50 pieces 39,000 ZYR371195
❹ 微生物 Microbe Lysis Tube, DNA/RNA Shield 2 ml チューブ入り (Lysis 用ビーズを含む) 1 ml ≦100 μl
R1103 50 pieces 49,000 ZYR371115
R1104*3 50 pieces 59,000 ZYR171104
❺ 組織 Tissue Lysis Tube, DNA/RNA Shield 2 ml チューブ入り (Lysis 用ビーズを含む) 1 ml ≦100 μl R1105 50 pieces 49,000 ZYR371155
❻ 血液 Blood Collection Tube, DNA/RNA Shield 16×100 mm真空チューブ入り 6 ml 3 ml R1150 50 pieces 88,000 ZYR371156
❼ 糞便 Fecal Collection Tube, DNA/RNA Shield 15 ml チューブ入り +採取用スプーン 9 ml 約 1 mg /
1 ml R1101 10 pieces 18,000 ZYR371109
❽ 口腔,鼻腔,喉表面
Collection Tube with Swab, DNA/RNA Shield
12×80 mmチューブ入り+スワブ 1 ml*2 ≦100 μl
R1106 10 pieces 14,000 ZYR571110
R1107 50 pieces 63,000 ZYR571150
❾ 唾液 Saliva Collection Kit, DNA/RNA Shield サンプル
DNA/RNA Shield+唾液採取用チューブ 2 ml 2 ml
R1210 10 kits 15,000 ZYR172110
R1210 50 kits 70,000 ZYR172150
*2 DNA/RNA Shield が 2 ml 入りのタイプ(#R1108,#R1109)もあります。詳細はフナコシ Web をご覧下さい。 *3 #R1104:スワブ付属
❼❶❷
❻
❺
❸❹
❽ ❾
使用例
DNA/RNA Shield を使用し,室温下で 1 か月間保存した試料の細菌叢の推移を解析した。上図に示した経過日数の試料から DNA を ZymoBIOMICS DNA Mini Kit
(#D4300,p.8 参照) を用いて抽出し,16S rRNA 遺伝子に対する細菌叢構成のプロファイリングを行った(Genus Composition)。DNA/RNA Shield を用いた場合(右図),試料は安定的に保存され,細菌叢構成に変化は見られなかった。
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
試薬 TEL 03 -5684 -1620
FAX 03 -5684 -1775
reagent@funako
shi.co.jp
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
7
網羅的な解析(NGS など)にはこちらの ZymoBIOMICS 核酸抽出キット, 特定の微生物の検出(PCR など)には Quick Kit(p.9)がオススメです。
様々な環境試料からの核酸抽出に対応!
ZymoBIOMICS 核酸抽出キット無料サンプル品あります
Webページ番号検索65387
土壌・糞便などの試料に含まれる細菌,真菌類,原生動物,藻類,ウイルス,ミトコンドリア および宿主の核酸を,バイアス無く抽出するキットです。PCR 阻害物質を含まない核酸が得られます。
[メーカー:ZYR]
キットの種類
DNA抽出キット※16S rRNA 遺伝子の qPCR によりキットに微生物の混入がほぼ無いこと (溶出液 1 μl 中にバクテリアゲノム
のコピー数が 3 以下)を確認しています。RNA抽出キット
MicroPrep MiniPrep サンプル 96 Kit 96 MagBead Kit MiniPrep
フォーマット スピンカラム 96 ウェルプレート 96 ウェルプレート+磁気ビーズ スピンカラム
試料量
哺乳動物糞便 ≦50 mg ≦200 mg ≦100 mg ≦100 mg ≦200 mg
土 壌 ≦100 mg ≦250 mg ≦100 mg ≦200 mg ≦250 mg
細 胞
湿重量 5~20 mg 50~100 mg 5~20 mg 5~20 mg 50~100 mg
細 菌 2×108 cells 1×109 cells 2×108 cells 2×108 cells 109 cells
酵 母 2×107 cells 1×108 cells 2×107 cells 2×107 cells 108 cells
液体試料 250 μl
ZYR034301 DNA/RNA回収量 ≦5 μg ≦25 μg ≦5 μg ≦10 μg ≦100 μg
ZYR334300 精製核酸サイズ 15~20 kbp ≧17 nt
ZYR034303 溶出液量 10~20 μl 50~100 μl ≧20 μl 37.5~50 μl ≧50 μl
ZYR034309 使用回数 50 preps 50 preps 2×96 preps 2×96 preps 50 preps
ZYR034302 商品コード D4301*3 D4300*3 D4303*4 D4309*3 D4302*4 D4308*3 R2001*3
ZYR034308 包 装 1 kit 1 kit 1 kit 1 kit 1 kit 1 kit 1 kit
ZYR172001 価格(¥) 57,000 57,000 179,000 179,000 182,000 182,000 83,000
従来の核酸精製キットでは 微生物の種類によって DNA 抽出効率にバイアスが生じる可能性がある
10 種類の微生物があらかじめ所定の割合で混合されている マイクロバイオームスタンダード*1 から,4 種類の方法でDNA を抽出し,細菌由来 16S rRNA 遺伝子の解析を行った。
その結果,溶解効率の違いが影響したためか,精製された核酸は理論値と異なる微生物の存在比を示した。
本製品のみ理論値に近い正確なプロファイルが示され,微生物の種類によらず正確に DNA を抽出できた。
*1 ZymoBIOMICS Microbial Community Standard(#D6300,p.4参照)を使用した。
*2 Human Microbiome Project (HMP) fecal DNA extraction protocol
100%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
20%
10%
0%
Mic
rob
ial C
om
po
sitio
n(
16S
Co
un
ts)
理論値 A 社製品 B 社製品本製品(DNA Mini Kit)
HMP Protocol*2
Bacillus subtilis (G+)
Listeria Monocytogenes (G+)
Staphylococcus aureus (G+)
Enterococcus faecalis (G+)
Lactobacillus fermentum (G+)
Salmonella enterica (G-)
E.coli (G-)
Peudomonas aeruginosa (G-)
■
■
■
■
■
■
■
■
破砕方法:Lysis Tube(*3),Lysis Rack(*4)
✓バイアスなく正確な抽出 ✓幅広い種類の試料に対応 ✓短時間操作(20 分)製品の特長
■DNAを抽出するキット,RNAを抽出するキット
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マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
試薬 TEL 03- 5684-1620 FAX 03-5684- 1775
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
8
[メーカー:ZYR]
キットの種類DNA/RNA抽出キット
MiniPrep 96 MagBead Kit
フォーマット スピンカラム 96 ウェルプレート+磁気ビーズ
試料量
哺乳動物糞便 ≦200 mg ≦50 mg
土 壌 ≦250 mg ≦50 mg
細 胞
湿重量 50~100 mg 5~20 mg
細 菌 109 cells 2×108 cells
酵 母 108 cells 2×107 cells
液体試料 250 μl
精製DNA/RNAサイズ ≧17 nt
溶出液量 ≧50 μl
使用回数 50 preps 96 preps 4×96 preps
ZYR172002 商品コード R2002*3 R2135 R2136
ZYR372135 包 装 1 kit 1 kit 1 kit
ZYR372136 価格(¥) 106,000 78,000 249,00040 mg のヒト糞便から,本キットを用いて手動および自動化装置により総核酸
(DNA および RNA)を得た。高い再現性で核酸が得られていることが分かる。
土壌・糞便から核酸を抽出するキット
Quick-Fecal/Soil Microbe Kit糞便,砂,粘土,泥炭などの試料を破砕ビーズで効率的に溶解し,バクテリアや菌類,藻類,原虫などの様々な微生物やウイルスの核酸を抽出するキットです。得られた核酸は PCR や RT-PCR に使用できます。
A他社製品本製品
(Miniprep Kit) B
DNA MiniPrep Kit(#D6010)または他社製品を用いて,ラット糞便試料から抽出した DNA の電気泳動像
1 kb DNALadder Total RNA
250 mg の 汚 泥 か ら RNA MicroPrep Kit(#R2040) を 使用して精製した Arthrobacter 属の total RNA
[メーカー:ZYR]
キットの種類DNA抽出 RNA抽出
96 Kit MicroPrep MiniPrep MidiPrep MicroPrep
フォーマット 96 ウェルプレート スピンカラム スピンカラム
試料量糞 便 ≦80 mg ≦50 mg ≦150 mg ≦375 mg ≦250 mg
土 壌 ≦135 mg ≦250 mg ≦5 g ≦250 mg
DNA/RNA回収量 ≦5 μg ≦5 μg ≦25 μg ≦125 μg 10 μg ZYR036110
精製核酸のサイズ ≦40 kb >17 nt ZYR036120
使用回数 2×96 preps 50 preps 50 preps 25 preps 50 preps ZYR036100
商品コード D6011 D6012 D6010 D6110 R2040 ZYR336100
包装/価格(¥) 1 kit / 125,000 1 kit / 41,000 1 kit / 41,000 1 kit / 88,000 1 kit / 63,000 ZYR172400
Quick-RNA検索4801Webページ番号
Quick-DNA検索496
■DNA/RNAの個別精製または共溶出を行えるキット
Co-Purification Parallel Purification
Total Nucleic Acid DNA RNADNA & RNA in One Fraction DNA & RNA in Separate Fractions
手動 自動
Concentration (ng/μl) Yield (ng×70) Volume (μl)
140
120
100
80
60
40
20
0
破砕方法:Lysis Tube(*3)
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9
真核生物の生体試料から 微生物由来 DNA を精製するキット
HostZERO Microbial DNA Kit
Webページ番号検索68111
真核生物由来の唾液・体液試料から,真核細胞のみを選択的に溶解することで真核生物由来 DNA を除去し,微生物由来 DNA を精製するキットです。
土壌試料からゲノム DNA を精製するキット
FastDNA SPIN Kit for Soil
Webページ番号検索776
特 長
● 土壌中のバクテリア,真菌,動物,植物などからゲノム DNAを迅速に分離・精製するキットです。キットに含まれる試薬と試料を混合し,ビーズ式試料・細胞破砕装置 FastPrep によって破砕した組織から DNA を精製します。
● フェノールやクロロホルムなどの有機溶媒を使用しません。● 精製は 30 分以内に完了します。● 得られた DNA は PCR に使用できます。
様々な土壌試料から精製した DNA の電気泳動結果Lane 1:トマトの鉢植え土壌 Lane 6:庭地Lane 2:汚泥 Lane 7:ユリの鉢植え土壌Lane 3:砂土 Lane 8:芝地Lane 4:マツの下の土壌 Lane 9:ミカンの木Lane 5:ヤシの下の土壌 Lane 10:アボカドの木
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
FastDNA SPIN Kit for Soil(50 preps)GEN 6560-200 1 kit / 31,200 GEN656002
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
FastDNA SPIN Kit for Feces(50 preps)GEN 6570-200 1 kit / 66,000 GEN657020
糞便試料からゲノム DNA を精製するキット
FastDNA SPIN Kit for Feces
Webページ番号検索64261
● ヒトおよび動物の新鮮または凍結した糞便試料からゲノムDNA を迅速に分離・精製するキットです。
● キットに含まれる Lysing matrix を含んだチューブに細胞溶解液と試料を加え,FastPrep によって破砕,抽出します。次いで,DNA binding matrix を含むスピンモジュールを用いて分離,精製することにより,迅速かつ高収率で高品質なゲノム DNA が得られます。
● PCR,次世代シークエンシング(NGS)を含む各種アプリケーションに使用可能な純度の核酸を得ることができます。
● 試料:真核生物由来の唾液・各種体液試料※凍結・融解を行った試料や,微生物菌体の完全性に影響を与える溶液
中で保存した試料から精製を行った場合,微生物由来 DNA が得られない場合があります。また,本製品は組織,血液試料や,DNA/RNA Shield 中で保存した試料からの DNA 精製には適していません。
*Control: 宿主由来 DNA を除去せず,試料中の総 DNA が得られる ZymoBIOMICS DNA Microprep Kit(p.8 参照)で精製した DNA。
特 長
精製した微生物由来 DNA の微生物プロファイルの比較得られた DNA と V3-V4 領域を標的としたプライマーを用いてライブラリー調製後,Illumina MiSeq(2×300 bp)で 16S rRNA 遺伝子の NGS 解析を行った。
得られたDNAは,試料中の微生物組成 プロファイルを最大限維持している
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
HostZERO Microbial DNA Kit(50 preps)ZYR334310 ZYR D4310 1 kit / 97,000
qPCR による精製 DNA の宿主/微生物由来比率の比較
宿主由来DNAを 90%以上除去可能
本製品 B 社製品A 社製品
ヒト由来 DNA
微生物由来 DNA
Control*
本製品 B 社製品A 社製品Control*
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10
様々な試料から 150kb までの高分子量 DNA を精製できます
Quick-DNA HMW MagBead KitNEW
Webページ番号検索68155
✓ 独自の RNA 除去技術により,高収量かつ高純度の DNA が得られます。✓ 血液,糞便など,抽出が困難な試料からも高純度 DNA の精製を行えます。✓ 第 3 世代ロングリードシークエンシングのプラットフォームで検証されています。
(Pacific Biosciences 社装置(SMRT Sequencing)および Oxford Nanopore Technologies 社装置)
製品の特長
※本製品は,血清,血漿,尿試料などからのセルフリー DNA 精製には適していません。Quick-cfDNA Serum & Plasma Kit(Web ページ番号:63486)または Quick-DNA Urine Kit(Web ページ番号:63433)のご使用をお勧めします。
適用試料培養細胞,固形組織,全血,唾液,生体液,口腔細胞,糞便,マイクロバイオーム試料,DNA/RNA Shield(p.7 参照)中に保存した試料など※微生物のゲノムを回収する場合,別途 DNA/RNA Shield(2×concentrate) や酵素が必要となります。
得られるDNAの純度 A260/230:≧1.8
得られたDNAの適用 ロングリードシークエンシング,PCR,エンドヌクレアーゼ消化,サザンブロッティング,ジェノタイピング,NGS,Bisulfite 変換 など
磁気ビーズのDNA結合能 10 μg DNA / 50 μl MagBinding beads
溶出液量 50 μl DNA elution buffer / 33 μl MagBinding beads
様々な試料から精製した高分子量 DNA の評価
本製品を用いて HeLa 細胞(106 cells),マウス筋肉,脳,肝臓組織(各 25 mg),ヒト全血,マウス全血,ヒト唾液(各 200 μl),および DNA/RNA Shield(#R1100)中に保存した唾液スワブからそれぞれ DNA を精製し,Agilent 2200 TapeStationで DNA 鎖長を評価した(n=2)。得られた DNA は>60 kb の高分子量であることが分かる。
ロングリードシークエンシングに適した長鎖 DNA
本製品を用いて E. coli 培養液(グラム陽性菌,~108 cells),L. monocytogenes培 養 液( グ ラ ム 陰 性 菌,~108 cells), ヒ ト 糞 便(50 mg),ZymoBIOMICS Microbial Community Standard(#D6300,75 μl)からそれぞれ DNA を精製し,Femto Pulse System(Agilent 社)で DNA 鎖長を評価した(n=2)。
高収量かつ高純度の DNA が精製できる
本製品および A 社製品を用いて,ヒト血液(200 μl),ヒト糞便(25 mg),マウス腸組織(25 mg),ZymoBIOMICS Microbial Community Standard(#D6300,75 μl)からそれぞれ DNA を精製し,収量(上図)および A260/230(下図)をNanoDrop 2000 で評価した(n=2)。本製品で得られた DNA は A260/230:≧1.8の高純度であることが分かる。
[メーカー:ZYR]
品 名 商品コード 包 装 価格(¥)
Quick-DNA HMW MagBead Kit(96 preps) NEW D6060 1 kit 51,000 ZYR036600
PacBio
Oxford Nanopore
本製品
A 社
※別途,磁気ラックが必要です。
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rRNA を除去した total RNA ライブラリーを調製するキット
Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library KitNEW
Webページ番号検索68149
Illumina
✓ プローブを用いない独自の RiboFree Universal Depletion 技術により,すべての生物種の RNA から,rRNA とグロビン mRNA を酵素的に除去します。
✓ rRNA 除去時のバイアスがなく,正確な RNA ライブラリーを調製できます。
製品の特長
[メーカー:ZYR]
品 名 商品コード 包 装 価格(¥)
ZYR373010 Zymo-Seq RiboFree Total RNA Library Kit(12 preps) NEW R3000 1 kit 193,000
短時間で操作が完了 様々な生物種の試料で本製品を使用できます
ライブラリー調製に使用する試薬の種類・操作ステップ数を最小限化しており,短い時間で操作を完了させることができます。
RNA 試料
逆転写反応30 分
Sequence Stranded Libraries
アダプター付加2 時間
プローブを使用せずに rRNA を除去1 時間
✓ シロイヌナズナ ✓ 末梢白血球✓ ラット ✓ ホルマリン固定パラフィン包埋組織✓ 全血 など
様々な生物由来 RNA からの rRNA の効率的な除去様々な生物由来 RNA からライブラリーを調製し,ペアエンドシークエンシング後,アノテーションを行った。
ヒト
ヒト
マウス
ラット
シロイヌナズナ
大腸菌
rRNA 除去時に影響を受けた遺伝子の数Universal Human Reference RNA に ERCC Spike-In Mix 1(共に Thermo Fisher Scientific 社)を添加したものを試料として,各社のキットで rRNA 除去/未除去試料からライブラリーを調製し,ペアエンドシークエンシング後,比較を行った。rRNA 除去時に影響を受けた遺伝子の数が,本製品は B 社製品の 1/35 であることが示された。
A社
B社
A社 B社
Quantification of colored points in scatterplots right
※別途,磁気スタンドが必要です。※RNA から rRNA を除去して cDNA を調製するキット(#R3001)もあります。詳細は Web ページ番号:68149 をご覧下さい。※法規制情報については,お問い合わせ下さい。
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12
PCR 由来のバイアスやキメラ形成を抑えてライブラリーを調製できます
Quick-16S NGS Library Prep Kit
Webページ番号検索68084
リアルタイム PCR により増幅を行い,わずか 1.5 時間で 16S rRNA 遺伝子ライブラリーを作製することができるキットです。作製したライブラリーは,Illumina 社 MiSeq などの次世代シークエンス解析に使用できます。
Illumina
特 長
● PCR 増幅後,Clean-up は酵素処理で行います。従来の磁性ビーズを用いた場合に比べ,短時間で操作が完了します。
● リアルタイム PCR で増幅を行うため,PCR 産物を直接定量することが可能です。ゲル電気泳動やその他の解析装置を用いた定量を行う必要はありません。
● 最新の 16S リファレンスデータベースに基づいて作製した16S V1-V2 および 16S V3-V4 領域に対するプライマーを使用します。細菌の系統的カバー範囲が増加し,古細菌も含む最良の細菌叢プロファイリングが可能となります。
[メーカー:ZYR]
品 名 使用回数 商品コード 包 装 価格(¥)
ZYR036410 Quick-16S NGS Library Prep Kit
24 tests D6410 1 kit 63,000
ZYR036400 96 tests D6400 1 kit 195,000
本製品 他社製品
操作時間 1.5 時間 ≧4 時間
試料DNA事前のノーマライズ不要
DNA 濃度の範囲: 5~20 ng/μl
事前にノーマライズ および定量が必要
ライブラリーの系統学的カバー範囲
標準的なプライマー よりも極めて広い 狭い
PCR後の精製キットに含まれる酵素での 1 ステップ処理で
迅速かつ簡便
市販の精製キットに よる複数回の精製
バーコード配列の付加に必要なチューブ数
20 本(96 試料あたり)
96 本(96 試料あたり)
PCRキメラ発生の抑制 <2% に抑制 抑制していない
調製したライブラリーの定量
定量的 PCR (キットに試薬が
含まれる)
ゲル電気泳動やBioanalyzer で定量(キットに試薬が
含まれない)
ライブラリー調製時に生じるバイアスについて本製品および細菌叢研究分野における標準的なプロトコル 2 種により,ZymoBIOMICS Microbial Community DNA Standard(p.4 参照)を試料として 16S rRNA ライブラリーを調製した。その後シークエンシングを行い,ライブラリー調製時に生じるバイアスについて比較した。本製品で調製したライブラリーはバイアスが少なく,理論値(Theoretical)に近いことが分かる。
HMP Protocol(米国 NIH の Human Microbiome Project のプロトコル)EMP Protocol(米国 Earth Microbiome Project のプロトコル)
調製したライブラリーの系統学的カバー範囲について本製品に含まれる 2 組のプライマーセット(「Quick-16S primer set V1-V2」と「Quick-16S primer set V3-V4」)と,細菌叢研究分野における標準的なプライマーセットで調製したライブラリーの系統学的カバー範囲について比較した。本製品で調製したライブラリーが,バクテリア・古細菌を系統学的に広くカバーしていることが分かる。
HMP(米国 NIH の Human Microbiome Project のプライマーセット)Loman Lab(英国バーミンガム大学 Loman 研究室のプライマーセット)Klindworth(独国マックス・プランク研究所 Klindworth 氏の文献*に記載のプライマーセット)*Klindworth, A., et al., Nucleic Acids Res., 41 (1), e1 (2013).
100
80
60
40
20
0
Co
vera
ge (
%)
100
80
60
40
20
0
Co
vera
ge (
%)
使用例
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わずか 3 時間の操作で NGS 用ライブラリーを調製できます
AFT Linked-Reads Library Preparation Kit
Webページ番号検索68105
新しい全ゲノムライブラリー調製法(AFT 法)により,標的 DNA の増幅,断片化,タグ標識を一度の反応で行います。Illumina 社シークエンサーに対応したライブラリーを調製できます。※テンプレート DNA の鎖長が 1,000 bp 以上であることが必要です。そのため,FFPE 試料や液体生検試料由来の DNA からのライブラリー調製には
適していません。
Illumina
● 増幅の正確性が高い● 事前の DNA 断片化は不要で,実験操作が簡便
● GC リッチ領域も増幅でき,増幅の偏りが少ない● シングルセルレベルのより少ない DNA(5 pg~)から
ライブラリーを調製できる
ここがすごい
■操作方法概略
(細胞の溶解)ゲノム DNA の変性
~15 分
AFT 反応・精製
80 分
ライブラリー PCR
20~40 分
ライブラリーの精製
~40 分
AFT 法の原理
AFT(Amplification, Fragmentation, and Tagging of target DNA)法は,5’ 末端にタグ配列を有する縮重プライマー
(AFT primer)を使用することにより,1 反応で増幅・断片化・タグ付けを行うことができる技術です。
AFT primer は 5’ 末端にタグ配列を有する縮重プライマーで,標的 DNA鎖中の複数部位にランダムに結合する。鎖置換 DNA ポリメラーゼによりAFT primer から DNA 鎖が伸長される。その際に,鎖置換 DNA ポリメラーゼにより,前方の増幅産物が後方の増幅産物に置換され一本鎖になる。合成された増幅産物(1st amplicon)に対して,反対側の鎖の AFT primer が同様に複数個同時に結合し,更なる増幅が行われる。そのため,同一の 1st amplicon から増幅された産物は,3’ 末端部分が共通の配列になる。この共通配列が天然のバーコード配列として機能し,長鎖解読時の足場となる。また,de novo シークエンシングや,染色体ハプロタイプのアサインを容易にする。
AFT primer
製品ラインナップ
試料の種類に応じた 4 種類の製品ラインナップがあります。シングルセル用/全血用/バクテリア用キットには,細胞溶解のための Lysis Solution と Stop solution が含まれています。※精製用製品および構築ライブラリー定量用製品は,キットに含まれていません。
[メーカー:MTA]
試 料 品 名 操作時間 使用回数 商品コード 包装/価格(¥)
ゲノム DNA(5 pg~10 ng) Whole-Genome Kit 3 時間以内 24 回分 6729001 1 kit / 65,000 MTA290010
シングルセル Single-Cell Whole-Genome Kit 3 時間以内 24 回分 6729002 1 kit / 87,000 MTA290020
全血(0.1 μl) Raw Blood WGS Kit 3 時間以内 24 回分 6729003 1 kit / 87,000 MTA290030
フィルターろ過したバクテリア Raw Sample Metagenomics Kit 3 時間以内 24 回分 6729004 1 kit / 87,000 MTA290040
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14
Illumina シークエンサー用 ポジティブコントロールライブラリー
TailorMix Dual Indexed PhiX Control Library
Webページ番号検索65458
Illumina
Illumina 社 PhiX V3 コントロール用ライブラリーに代わるライブラリーです。より鮮明な生データが取得できます。
● PhiX リードのコンタミネーションを低減することでデータ処理の手間を省き,より正確なデータが取得できます。
● GC 含量 45% のランダム配列で構成されており,塩基多様性が低い試料に添加することでランのクオリティーが向上します。
● Illumina 社の全ソフトウェアによるマルチプレックス解析にも対応した 2 種類のバーコードが含まれています。
特 長
[メーカー:SQM]
Denatured (一本鎖)
Nondenatured (二本鎖)
対応 機種
MiSeq,MiniSeq,NextSeq,HiSeq 2500 ○ ○
HiSeq X, HiSeq 3000/4000,Nova Seq
× ○
バッファー HT1 buffer TE buffer (pH8.0)
濃 度 20 pM (Ready-to-use) 10 nM
インサートサイズ 380 bp
商品コード TM-502 TM-580
包 装 200 μl 10 μl SQM315020
価格(¥) 43,000 43,000 SQM315080
本製品を使用した場合,Illumina 社の PhiX コントロールライブラリーを使用した場合に比べてコントロールリードのコンタミネーションが低減される
■本製品■Unindexed Phix (Illumina 社標準品)
■TailorMix Indexed PhiX
1% PhiX Spike In
0%0%
1%
2%
6%
4%
5%
6%
0.35% 0.19%
5.60%
20% PhiX Spike In
■Unindexed PhiX
添加した PhiX シークエンスの検出率Illumina 社の PhiX コントロールライブラリーまたは本製品を 1% または 20% Spike-in し,マルチプレックスシークエンシングを行った。リードを PhiX174 ゲノムにマッピングした。
製品ラインナップ 使用例
通常,次世代シークエンスでは,ランのクオリティーをモニタリングするためにコントロールライブラリー(Illumina 社標準品:PhiX V3 Control Library)の Spike-in を行います。ところが,一度に複数の試料をシークエンスするマルチプレックスシークエンスにおいて,コントロールライブラリーのリードが目的試料のものとして読まれてしまい,得られたデータにコンタミネーションするという問題があります。本製品はイルミナシークエンサーにおいて,PhiX ライブラリーの代わりに使用できます。マルチプレックスシークエンシングでデータにコンタミネーションしにくく,よりクリアなデータが得られます。
ここがすごい
Illumina 対応 RNA-Seq 用 miRNA ライブラリー調製キットTailorMix miRNA Sample Preparation Kit
キット名 TailorMix miRNA Sample Preparation Kit V2
Webページ番号検索64864
TailorMix Gel-Free miRNA Sample Preparation Kit
Webページ番号検索64865
実績のある試料 エクソソーム,ホルマリン固定パラフィン包埋組織(FFPE),血清,全血,組織,HITS-CLIP 由来 RNA
Input total RNA 推奨 10 ng 以上 推奨 150 ng 以上
ライブラリー 精製方法
PAGE 精製独自の RNA 抽出ツール (キットに付属)を用いた 簡便な精製が可能です。
磁気ビーズによる精製PAGE 精製と比べ,短時間での精製が可能です。
こちらもオススメ
[メーカー:SQM]
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
試薬 TEL 03 -5684 -1620
FAX 03 -5684 -1775
reagent@funako
shi.co.jp
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
15
次世代シークエンス用の DNA ライブラリー調製キット
sparQ DNA Library Prep Kit
small RNA のライブラリー調製に有用な 逆転写酵素
TGIRT-Ⅲ
Webページ番号検索67711
Webページ番号検索64828
原核生物や真菌などのレトロトランスポゾン内に存在する逆転写酵素を遺伝子改変した製品です。※TGIRT(Thermostable Group Ⅱ Intron Reverse Transcriptase)
Illumina
Illumina
あらかじめ断片化した二本鎖 DNA から,Illumina 社次世代シークエンス用の DNA ライブラリーを,2.5 時間以内に作製できるキットです。
操作方法概略
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
sparQ DNA Library Prep Kit(24 reactions)QTB951910 QTB 95191-024 1 kit / 114,000
Library Yield (ng)
0
200
400
600
1 ng input 100 ng input
本製品 他社 A 他社 B
Fragmented DNA
DNA Polishing(60 minutes)
Adapter Ligation& Cleanup
(40 minutes)
Optional Library Amplification & Cleanup
(50 minutes)
SequencingReady Library
● DNA polishing enzyme mix ● DNA ligase● DNA rapid ligation buffer ● HiFi PCR master mix● DNA polishing buffer ● Primer mix
※キットにはアダプター付加後および PCR 増幅後の DNA 精製用ビーズは含まれていません。sparQ PureMag Beads(Web ページ番号:67711)の使用をお勧めします。
※キットにはアダプターオリゴヌクレオチドは含まれていません。別途ご用意下さい。
使用例
キット内容
特 長
● 熱安定性(反応温度:60℃),転写効率(伸長活性),正確性(fidelity)が優れています。
● 逆転写酵素活性に加えて,アダプターを付加する活性(Tem-plate-switching 活性)も有するため,別途 RNA3’ アダプターの結合は不要です。
● RNA-seq(エクソソーム由来 RNA,細胞由来 RNA,血漿中RNA,細胞外 RNA の解析)や一般的な RT-PCR,qRT-PCRに使用できます。
他社製品 1
Perc
ent s
mal
l ncR
NA
read
s
他社製品 2
small ncRNA100
75
50
25
0A
1A
2A
3B
1B
2B
3A
1A
2A
3B
1B
2B
3
A1
A2
A3
B1
B2
B3
tRNAsnoRNAsnRNA7SK7SLMiscRNAY-RNAVault RNApiRNAmiRNA
本製品
本製品または他社 RNA-Seq Kit を用いて調製したライブラリーを用いた網羅的 RNA 解析のうち,Small RNA についての結果を示した。試料: Universal Human Reference RNA(図中 A1~A3),
Human Brain Reference RNA(図中 B1~B3)
立体構造が原因でライブラリー調製が困難とされてきた
tRNA が検出されている
■TGIRT-Ⅲ 酵素単品RNA アダプターと DNA プライマーは別途ご用意下さい。
■TGIRT Template-Switching RNA-seq Kit
Illumina 社 R2 アダプター用の RNA-Seq ライブラリー調製用キットです。※Illumina 社 R1R DNA オリゴは別途ご用意下さい。
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
TGIRT-Ⅲ EnzymeIGX TGIRT10 10 reactions 10 μl / 44,000 IGX190600IGX TGIRT50 50 reactions 50 μl / 139,000 IGX190610
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
TGIRT Template-Switching RNA-seq kit, ver.3IGX kTGIRT-10 10 tests 1 kit / 44,000 IGX101901IGX kTGIRT-25 25 tests 1 kit / 123,000 IGX101911キット内容:TGIRT-Ⅲ enzyme,Primer mix,Reaction buffer,DTT
使用例
製品ラインナップ
1. 二本鎖 DNA の末端修復・3’末端への dA-tail 付加2. アダプター付加・精製3. PCR による増幅・精製(推奨)※最終産物は,次世代シークエンシングに直接用いる
ことができる。
他社 DNA ライブラリー作製キットよりも本製品を用いたほうが,高収量となった。
GC 含量領域における Coverage の確認本製品を用いて調製したライブラリーを Illumina 社 MiSeq によりシークエンシングし,解析した。PCR を行わないワークフローで調製したライブラリーと PCR を行って調製したライブラリーとで,一貫性のある結果が得られた。
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マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
試薬 TEL 03- 5684-1620 FAX 03-5684- 1775
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
16
3’ 末端だけ! 集中的にシークエンス
MACE Kit(Massive Analysis of cDNA Ends)
Webページ番号検索65499
Illumina
mRNA の 3’ 末端構造解析に特化した次世代 RNA-Seq ライブラリーの調製キットです。Illumina 社のプラットフォームに対応しています。
MACE は mRNA の 3’ 末端を特異的にシークエンスする技術です。RNA の分解にも強く,短い RNA や低発現の mRNA も検出可能です。一般的な RNA-Seq では,転写産物のサイズが大きいものほどリード数が多くなり,短いものほど少なくなるためデータの正規化を要し,その方法によって結果が異なってしまう問題があります。MACE は転写産物 1 分子あたり 1 リードのみが読み取られるため,短くコピー数の少ない転写産物も少ないシークエンス(読み)深度で同定できます。また,転写産物の長さによるデータの正規化が不要です。
MACE
RNA-Seq
SNP SNP SNP
SNP SNP
Reads
Reads
SNP
SNPs with enough coverage:2
SNPs with enough coverage:0
cDNA
cDNA
AT
AT
CG
AT
CG
AT
RNA-Seqでは同定できないSNPも,MACEではSNPの多い3’-UTRを集中的にシークエンシングすることにより同定できる。
ここがすごい
アプリケーション
● 対立遺伝子のアレル特異的な発現の同定● 遺伝子マッピング● 植物・動物のマーカー選抜による育種への活用● 3’ 末端のポリアデニル化部位の異なるバリアント(選択的
ポリアデニル化)の解析● SNP 解析● 低コピー数 RNA の定量品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
MACE KitGXP604600 GXP 16046.1 6 reactions(MiSeq 用) 1 kit / 98,000GXP604241 GXP 160424.1 24 reactions(HiSeq / NextSeq用)1 kit / 330,000
Additional Adapter SetGXP604243 GXP 160424.3 1 set / 40,000
HiSeq / NextSeq 用(#160424.1)を 4 キット使用して 96 MACE 同時解析を行う場合に必要な,別売りの追加アダプターセット。
特 長
● PCR 増幅前にテンプレート分子をラベリングする TrueQuant 法により,PCR バイアス(不均一な増幅やアーティファクト)を認識し,データセットから排除できます。
● MACE の受託サービスもあります。詳細はお問い合わせ下さい。
■MACEと一般的なRNA-Seq の比較
左図同じシークエンス量(20 M リード)の解析で同定できた異なる転写物の数
右図左図のうち,30×以上のシークエンス(読み)深度で配列が得られた遺伝子座の数試料:ヒト胎盤組織MACE は転写産物の狭い範囲(多型が豊富な部分)の読み取りを集中して行うため,読み深度が増え,対立遺伝子をより正確に発見できる。
メーカーインタビューvol.23
3’mRNA 解析から新しい研究の提案へ
GenXPro 社は フランクフルト大学・パリ大学発のベンチャー企業です。
「モデル生物を使わない,低コストな遺伝子発現解析」を実現するため 2005 年に設立されました。2013 年(日本では 2017 年)に発売された MACE Kit は,世界の研究者から高い評価を受けています。
Webページ番号検索65833
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試薬 TEL 03 -5684 -1620
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連 載 企 画
FRONTIERSフ ロ ン テ ィ ア ー ズ
所有する 特許の数
6リボソーム 解析専門
Trento 大学発ベンチャー“The Ribosome Company”
2014 年に設立された IMMAGINA BioTechnology 社はイタリアの Trento 大学発のベンチャー企業で,リボソーム解析を専門としています。活性リボソーム単離キットや,タンパク質生合成の実際のレベルを測定するためのキットを開発してきました(下記参照)。「より迅速に操作できること」「よりユーザーフレンドリーな製品であること」「遺伝子発現における翻訳調節レベルを解析するためにより正確な技術を用いること」を全製品共通の基本理念としています。現在,Oxford Nanopore Technologies 社と新製品の開発を進めているところであり,2020年内にリボソームプロファイリング用キットをリリース予定です。私たちの製品が,翻訳障害と関連するがん・疾患の新規治療法の発見に貢献することを祈っています。
IMMAGINA BioTechnology 社メンバー
RiboLace活性型リボソームを単離する製品
➡Ribo-Seq(リボソームプロファイリング)に使用
● スクロースグラジエントよりも 10 倍早く単離可能● 抗体やタグ配列を使用しない● 操作が簡単● 少ない試料からでも使用できる● 正確に翻訳レベルを推定できる● Ribo-seq として使用できる市場唯一のキット
p.19 参照 AHARIBO翻訳複合体をプルダウンする製品
➡ LC-MS(de novo プロテオーム解析)やRNA-Seq(Translatome 解析)に使用
● 翻訳複合体をプルダウンできるキット● 抗体や超遠心を使用しない● 少ない試料からでも使用できる
[Web ページ番号:68157]
CircAID-p-seq単鎖RNAのライブラリー調製キット
● 世界初の単鎖 3'P-RNA 用ライブラリー調製キット
● Oxford Nanopore Technologies 社との共同開発
p.20 参照
AHARIBO
● 新生ペプチドへの Met アナログ AHA の取り込み● sBlock 処理によるリボソーム上の 新生ペプチドの安定化
RNA-Seqライブラリー調製/qPCR 解析へ
RiboLace
https://www.immaginabiotech.com/
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リボソーム解析の最先端へ
18
活性型リボソームを分離・Ribo-Seq に適したライブラリー調製するキット
RiboLace Kit
Webページ番号検索68814
リボソームの機能解析法であるリボソームプロファイリング(Ribo-Seq)用の試料分離・ライブラリー調製キットです。リボソームに結合して翻訳を阻害する独自のピューロマイシン含有分子が結合した磁性ビーズによるプルダウン法を用いて,抗体やタグ配列を用いずに活性型リボソームのみを分離できます。RPF(Ribosome protected fragment)分離用の RiboLace Ribo-Seq-Module 1 と,分離した RPF からの Illumina ライブラリー調製用の RiboLace Ribo-Seq-Module 2 があります。※参考文献:Clamer, M., et al., Cell Rep., 25 (4): 1097~1108.e5 (2018). [PMID:30355487]
Illumina
RiboLace Ribo-Seq-Module 1(#RL001_mod1) RiboLace Ribo-Seq-Module 2(#RL001_mod2)
Ⅰ
1. RiboLace を結合させる際に,mRNA 上のリボソームをブロックし,またリボソームの解離を弱めるために cycloheximide*で処理した後,Lysis bufferで細胞を溶解する。
2. RiboLace magnetic beads を準備する(Beads Functionalization)。3. RNaseⅠ(Nux solution)で mRNA のリボソーム未結合部分を分解する。4. RNase 阻害物質*を加えて分解反応を停止後,2 で用意した RiboLace を加
えて穏やかに撹拌しながらインキュベートする。5. 1.5 ml チューブ用マグネットスタンド*でビーズを分離し,洗浄する。6. SDS 10% と Proteinase K を加えてインキュベートする。7. 酸性フェノール:クロロホルムにより RNA(Ribosome Protected Fragment)
を抽出する。*キットには含まれていません。別途ご用意下さい。
[メーカー:IBT]
品 名 商品コード 包 装 価格(¥)
RiboLace Ribo-Seq-Module 1(9 reactions) RL001_mod1 1 kit 333,000 IBT710000
RiboLace Ribo-Seq-Module 2(9 reactions) RL001_mod2 1 kit 299,000 IBT710020
1. RPF の PAGE 精製を行う。
2. T4 PNK により RPF 脱リン酸化を行う。
3. アダプターのライゲーションを行う。
4. ライゲーション産物の PAGE 精製を行う。
5. 逆転写を行う。
6. 合成した cDNA の PAGE 精製を行う。
8. PCR ライブラリー増幅を行う。調製したライブラリーの PAGE 精製を行う。
5'
5'
5'5'
5' Ap
3' P
3' OH
3' OH
3' OH3' OH
3'
3'
3'5'
5'
3' P
3' P5'
5'
5'
5'
5'3'
3'
7. cDNA の環状化を行う。
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Oxford Nanopore Technologies 社シークエンサー用の 短鎖 RNA ライブラリー調製キット
CircAID-p-seq Kit
NEW
Webページ番号検索68156
20~50 nt の短鎖 RNA 試料から,独自の CircAID-p-seq テクノロジーにより,PCR を用いずに Oxford Nanopore Technologies 社装置(ロングリードシークエンサー)用の高品質なライブラリーをわずか 1 日で調製できるキットです。※ライブラリーの調製にはDirect cDNA Sequencing Kit(Oxford Nanopore Technologies社)
が別途必要です。
Oxford Nanopore
CircAID-p-seq テクノロジーについてCircAID-p-seq(Circular Amplification and IDentification of short RNA sequences bearing a 3’ Phosphate)は,3’ 末端がリン酸化
(または環状リン酸化)された短鎖 RNA 試料(3’-P / 2’, 3’-cP RNA)から特異的に cDNA 合成を行い,ライブラリーを調製する技術です。RNA 試料へのリンカーのライゲーション,RNA の環状化,RT-ローリングサークル増幅(RT-RCA, Reverse Transcription-Rolling Circle Amplification)の組み合わせにより構成されています。
M EMO
Step13’ 末端がリン酸化(または環状リン酸化)された RNA 試料(3’-P / 2’, 3’-cP RNA)に PK(Polynucleotide Kinase)enzyme を加え,5’ 末端をリン酸化する。
Step23’-P / 2’, 3’-cP RNA に Linker R をライゲーションする。
Step3~4RNA 試料を環状化する。
Step5逆転写により一本鎖 cDNA を合成する。
Step6相補的な DNA の合成により,二本鎖 cDNA とする。
Step7Oxford Nanopore Technologies(ONT) 社 の Direct cDNA Sequencing Kit(#SQK-DCS109)を用いてライブラリー調製をする。
[メーカー:IBT]
品 名 商品コード 包 装 価格(¥)
IBT200010 CircAID-p-seq Kit(6 reactions) NEW CA001 1 kit 231,000
※各種試薬や,RNA 精製キット(Zymo Research 社の RNA Clean & Concentrator-5 を推奨),Direct cDNA Sequencing Kit(Oxford Nanopore Technologies 社)などが別途必要です。詳細は製品データシートをご確認下さい(Web ページ番号:2902)。
Translatome / de novo プロテオーム解析用キットAHARIBO RNA Kit / AHARIBO Protein Kit独自の Ribo-MINATI 技術により,翻訳複合体のプルダウンを行うキットです。Translatome 解析用の AHARIBO RNA Kit と,de novo プロテオーム解析用の AHARIBO Protein Kit があります。
こちらもオススメ
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キャピラリー式電気泳動装置
Qsep100NGS 用のクロマチン/DNA せん断などに
最適な超音波破砕装置
EpiSonic 2000
Webページ番号検索63076
Webページ番号検索63428
次世代 ChIP アッセイ,次世代シークエンシング用のクロマチン/DNA せん断などの幅広い用途に使用できる破砕装置です。
*1 100~500 bp 範囲の場合。*2 試料の種類(DNA/RNA)および分解能に応じて別売カートリッジ
キットをご購入下さい。詳細は Web をご覧下さい。※別途,PC(Windows 7 以上)が必要です。
● NGS 用の DNA / RNA のサイズチェックに最適です。● ペン型のキャピラリーゲルカートリッジをセットするだけで,
簡単に操作できます。● 測定試料数:1~96
Qsep100 本体ペン型キャピラリーゲルカートリッジ*2
解析用 ソフトウェア 付属
検出感度 分解能*1
0.1 ng/μl 2 bp~
分析時間
2~7分/sample
38L×30W×40H cm
EpiSonic により 12 種類の試料を一度に処理した結果,すべての試料で均一なサイズにせん断された DNA が得られた。
L 1
10380 -5000 -2000 -1000 -
700 -
500 -
300 -
50 -
2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
特 長
● 15 μlの試料量で,最大12種類の試料を同時に処理できます。● 150 bp~20 kb のサイズにせん断できます。● 0.2 ml または 1.5 ml チューブを使用できます*。● 密閉したチューブでの破砕処理が可能であるため,コンタミ
ネーションの心配がありません。● 冷却装置により反応液の温度上昇を抑え,均一な破砕を可能
にします。● 超音波コンバーターを消音ボックスに収容した消音設計です。
*EpiSonic 専用チューブ(0.2 ml×1,000 本)が付属しています。
[メーカー:EPG]
電 源 100~120 V AC,50/60 Hz
コントローラーサイズ 20.3W×38.7D×21.6H cm(7.3 kg)
消音ボックスサイズ(発振ユニットを含む) 25.5W×25.5D×42H cm(11.1 kg)
出 力 750 W(最大)
出力周波数 20 kHz(平均)
動作環境 温度:4~35℃, 相対湿度:20~90%(結露厳禁)
商品コード EQC-2000
包 装 1 unit
価格(¥) 2,930,000 EPG002000
[メーカー:BOP]
商品コード 包 装 価格(¥)
BOP001000 C100100 1 unit 2,600,000
Range(bp) ng / μl % total nmol/L Avg.size
Library 100~5,000 55.98 99.71% 101.71 846.96
400~600 7.63 13.62% 23.75 493.97
600~800 7.16 15.03% 15.53 709.73
800~1,000 9.22 19.37% 15.82 896.50
1,000~1,200 5.29 10.40% 7.52 1082.95
フラグメント化 DNA の品質確認より高品質なシークエンスデータを得るためには,DNA 断片の大きさをある範囲内にそろえる必要がある。図の場合,DNA が平均 895 bp に断片化されていることがわかる(赤)。分子量マーカー(青)
使用例
Quality control of fragmented DNA
泳動時間(分)
RFU
1.50.83
5.33
9.83
14.33
18.82
23.32
2 2.5
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マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
機器 TEL 03-5684-1619
FAX 03-5684-5643
kiki@funako
shi.co.jp
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
21
次世代シークエンサーを使用した解析サービスサービスの詳細,ご依頼方法については,当社受託・特注品担当までお問い合わせ下さい。 [メーカー:ZYR]
メタゲノム解析検索45963
5-mC解析検索5391
ChIP 解析検索8751Webページ番号
マイクロバイオームのメタゲノム解析受託サービス
特 長 受託内容● ヒト糞便,環境水,土壌,食品などの幅広い試料に存在する
マイクロバイオームの遺伝子解析(NGS 解読)を行い,系統分類,同定を行う受託サービスです。
● スタンダードや核酸抽出などに ZymoBIOMICS 製品(p.3参照)を使用するため,エラーやバイアスが少なく,再現性の高いデータが期待できます。
※お送りいただく試料は,DNA/RNA Shield(p.7 参照)により核酸の安定化およびウイルスなどの感染因子の不活性化を行っていただきます。
● 16S シークエンシング● ITS シークエンシングサービス● 18S シークエンシング● ショットガンシークエンシング
※Illumina 社 MiSeq を使用します。
● 調製した試料を解読後,独自のデータベースを用いた最先端のバイオインフォマティクスで解析します。
● 納品されるレポートは様々な形式のデータを含み,論文にそのまま使用可能です。
クロマチン免疫沈降試料の解析(ChIP-Seq)受託サービス
バイサルファイトシークエンス受託サービス
特 長 受託内容
微生物組成の棒グラフ 微生物組成の存在度ヒートマップ β-多様性の 3D プロット LEfSe 解析
● 幅広い試料(ヒト,マウス,ラット,植物など)からゲノムワイドな DNA メチル化(5-mC)解析を行うサービスです。
● 1 塩基の解像度で定量的なデータが得られます。
● classic RRBS(カバー率:1.5~2 million sites)● Methyl-MiniSeq(カバー率:3~4 million sites)● Methyl-MaxiSeq(カバー率:全ゲノム)
● クロマチン免疫沈降(ChIP)の実施からライブラリーの調製,シークエンシング,バイオインフォマティクス解析まで一貫したサービスをご提供します。
● ヒストン修飾,タンパク質-DNA 相互作用に関するゲノムワイドな網羅解析や,タンパク質結合部位の同定に有用です。
● Illumina 社 HiSeq を使用してシークエンシングを行います。
解析例:ピークコーリング(ゲノム上のタンパク質結合部位と結合量の解析図)
Illumina
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マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
受託 TEL 03-5684-1645 FAX 03-5684-6539
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
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次世代シークエンス解析受託サービス
RNA-Seq検索64720
miRNA-Seq検索64721
Cancer Panel検索64799Webページ番号
専門のスタッフが Illumina 社の HiSeq,NextSeq または MiSeq を用いてシークエンスを行う受託サービスです。ライブラリー作製やデータ解析のみのご依頼も承ります。 [メーカー:DNA]
RNA-Seq 解析受託サービス
mRNA や lincRNA の配列をシークエンスし,発現変動のある遺伝子を同定する受託サービスです。RNA-Seq は,融合遺伝子の検出や新規スプライス部位の検出,エクソンレベルでの発現差解析など豊富な情報が得られます。
ストランド特異的RNA-Seq センス鎖,アンチセンス鎖を区別しての解析が可能です。
微量試料からのRNA-Seq* RNA 換算で 10 pg(プロトコル上のインプット量は 10 pg~10 ng)からの使用に耐えるスペックとなっています。数十細胞からの解析実績があります (シングルセルについてはお問い合わせ下さい)。
rRNA除去によるRNA-Seq(ヒト,マウス,ラットのみ対応)
rRNA 除去により,poly-A を持つ mRNA だけでなく,non-coding RNA の解析も可能になります。また,RNA の分解が進んだ FFPE 試料からの解析も可能です。
*微量のため,試料の品質検査は行いません。total RNA(DNase 処理済み) をご送付いただきます。
miRNA-Seq 解析受託サービス Cancer Panel 解析受託サービス
● 遺 伝 子 発 現 に 大 き く 影 響 を 与 え る こ と が 知 ら れ て い るmiRNA を次世代シークエンサーにより網羅的に解析します。
● 血清,血漿試料からの解析にも対応しています。● 微量の RNA(3 μg~)からでもライブラリー調製が可能です。
● QIAGEN 社の QIAseq Targeted DNA Panels を使用したがんパネル解析受託サービスです。
● 11 種類のがんパネルから目的に応じてご選択いただけます。● ディープシークエンスにより 5% 以下の遺伝子変異を検出し
ます。● FFPE 試料等の分解が進んだ試料にも対応いたします。
NGS による 微生物相解析受託サービス
有用微生物のスクリーニングに
細菌叢からの純化培養サービス
Webページ番号検索7853
Webページ番号検索6683
NGS を用いて大量の細菌 16S rRNA 遺伝子配列を解読し,活性汚泥や土壌などの試料中に存在する細菌の数や種類を詳細に解析する受託サービスです。DNA 抽出からデータ解析まで,全工程に対応します。 [メーカー:JBI]
解析内容
● DNA 抽出(オプション)
● 16S rRNA 遺伝子の定量(リアルタイム PCR)
● PCR 増幅 ● シークエンス解析(MiSeq)
● データ解析
細菌(V1,V2 もしくは V3,V4),細菌・古細菌(V4,V5),真菌(ITS1)の 4 つのメニューをご用意しています。真菌(ITS1)を対象とする場合は,真菌 18S rRNA 遺伝子を定量します。目的に合わせてお選び下さい。
価 格
6 万円/検体(税抜)※11 検体以上をご依頼の場合の価格,DNA 抽出などオプションサービス
の価格は,お問い合わせ下さい。
有用微生物を複数種含むカクテル状態の微生物群から純化して個々に培養を行うことで,細菌叢中の各微生物を 分離・同定します。
受託内容
■純化サービス● 複数の培地を用いて分離培養を試みます(細菌・カビなど)。● 確認されたコロニー数と形態確認を行います。● 分離・同定の実施についてはご相談させていただきます。
※同定試験の際,DNA抽出は1コロニーにつき最大2回まで実施します。※取得したシークエンスは BLAST Search による参照を行います。
■培養・保管サービス● 小スケール検証培養(1 L)● 拡大培養(10 L など)● 保管
[メーカー:AHC]
Illumina
Illumina
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
マイクロバイオーム・
次世代シークエンス特集
受託 TEL 03-5684-1645
FAX 03-5684-6539
jutaku@funako
shi.co.jp
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
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マウスモノクローナル抗体作製受託サービス
Webページ番号検索68864
抗原試料をご用意して頂くだけで,免疫感作からハイブリドーマ樹立までの作業を行います。ミエローマ細胞株(SP2)と脾臓 B 細胞との細胞融合法(PEG 法)によりモノクローナル抗体を作製しています。ご注文方法,価格,納期などの詳細は当社受託・特注品担当までお問い合わせ下さい。 [メーカー:HKD]
ハイブリドーマ作製
腹 水 採 取
腹水採取量2~5 ml
マウス(BALB/c) 8,000 円~/匹(3匹から実施)ヌードマウス(BALB/c nu/nu) 12,000 円~/匹(3匹から実施)
ハイブリドーマを お客様にご用意いただきます
お手持ちのハイブリドーマ株をお送りいただき,(株)ホクドーにて細胞培養し,マウスに細胞投与および腹水採取を行います。
ステップ1免疫
8週間~
抗原試料を お客様にご用意いただきます
● マウス(BALB/c)4 匹に免疫感作します。
● 4 匹のうち,抗体価の優れた 1 匹を細胞融合に使用します。
ステップ2細胞融合~スクリーニング
3週間~
● ミエローマ細胞株(SP2)と脾臓 B 細胞とを PEG 法を用いて細胞融合を実施します。
● HAT 培地によるスクリーニングを行い,陽性ハイブリドーマ(最大 20 株)を選択します。
※第 1 回目の細胞融合で陽性ハイブリドーマが認められない場合に限り,第 2 回目の細胞融合,スクリーニングを実施します。
腹水採取量2~5 ml
ハイブリドーマ納品1,200,000 円~
【オプション】腹水納品8,000 円~/匹 (3匹から実施)
ステップ3 クローニング~クローン樹立
12週間~
● 最大 5 株の陽性ハイブリドーマを用いて限界希釈法によるクローニングを行います。
● クローン化したハイブリドーマ株の内 1 クローンを用いてマウス(BALB/c)5 匹の腹水採取を行います。
● 1 クローンあたり 2 本の凍結保存細胞を作製し納品いたします。
● オプションで,追加クローニング,ハイブリドーマ凍結保存も承ります。詳細はお問合せ下さい。
イムノクロマトグラフィー作製受託サービス
Webページ番号検索4347
イムノクロマトグラフィーの構築に必要な抗体作製から構築の検討,試作品作製など各ステップすべての作業を行います。各ステップごとのご注文も承ります。ご注文方法,価格,納期などの詳細は当社受託・特注品担当までお問い合わせ下さい。 [メーカー:HKD]
イムノクロマトグラフィーの構築に必要な抗体作製から構築の検討,試作品作製など各ステップすべての作業を行い
抗体選定 条件検討 反応確認 部材作製 裁断 製品化製品化検討 アセンブリ
イムノクロマトグラフィー製品化までの流れ
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
受
託
サ
ー
ビ
ス
受託 TEL 03-5684-1645 FAX 03-5684-6539
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
24
発現タンパク質や未知タンパク質の N 末端アミノ酸配列を確認!
ペプチドシークエンス受託サービス
Webページ番号検索4764
● Edman 分解法により,タンパク質のアミノ酸配列を N 末端から高感度に決定する受託サービスです。
● 必要試料量:10 pmol 以上● 試料形態:転写済み PVDF メンブレンまたは溶液(脱塩済み)
フナコシ Web ページ番号:4764 に掲載の「N 末端ペプチドシークエンス分析依頼書」に必要事項をご記入の上,販売店担当者にお渡し下さい。
[メーカー:NIP]
■基本料金
1 試料(5 残基まで)¥48,0006 残基以降,1 残基ごとに追加料金 ¥4,500
■オプション料金
脱塩,濃縮(ProSorb による)¥15,000システイン残基検出(還元アルキル化)¥30,000
特 長 価 格
ご注文方法
ヒト腫瘍組織切片をスポットしたアレイ
Human Cancer Tissue Array
Webページ番号検索3327
特 長
包装/価格
● 様々なヒト腫瘍組織の切片をスポットしたアレイです。● 各組織は 10% ホルマリンで 12~24 時間固定した後,パラフィン包埋
されています。
下記製品は2 slidesまたは5 slidesの包装品からお選びいただきます。2 slides / ¥ 44,0005 slides / ¥ 96,000
試料の準備方法などの FAQ を掲載しています!
検索4764
[メーカー:SBC]
組織アレイの種類 内 容 スポット数 商品コード
Human, Breast Cancer/Metastasis/Normal 乳房(がん・転移・正常) 59 CBA
Human, Lung Cancer/Metastasis/Normal 肺(がん・転移・正常) 59 CCA
Human, Colorectal Cancer/Metastasis/Normal 結腸,直腸(がん・転移・正常) 59 CDA
Human, Liver Cancer/Metastasis/Normal 肝臓(がん・転移・正常) 59 CSA
Human, Uterine Cervix, Cancer/Metastasis/Normal 子宮頸部(がん・転移・正常) 59 CZA
Human, Gastrointestinal Stromal Tumor/Metastasis/Normal 胃腸間質(腫瘍・転移・正常) 59 DAA
Human, Common Cancers(1) 胃がん,食道がんなど 59 MA
Human, Normal Matching Tissue of #MA #MA に対応した正常組織 59 MAN
Human, Common Cancers(2) 乳がん,肝臓がんなど 59 MB
Human, Normal Matching Tissue of #MB #MB に対応した正常組織 59 MBN
Human, Common Cancers(3) 子宮体がん,胆のうがんなど 59 MC
Human, Normal Matching Tissue of #MC #MC に対応した正常組織 59 MCN
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
受
託
サ
ー
ビ
ス-が
ん
試薬 TEL 03 -5684 -1620
reagent@funako
shi.co.jp
受託 TEL 03-5684-1645
jutaku@funako
shi.co.jp
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25
bFGF の培地添加量を減らして安定した ES/iPS 細胞培養を可能にする
ヒト ES/iPS 細胞分化抑制物質 NN15-017NEW
Webページ番号検索68806
ES/iPS 細胞の培養において,bFGF は未分化能を維持させる上で重要です。しかし,bFGF は高価であることやロット間差が問題になっています。本製品は,bFGF の添加量を 1/5 に減らすことができ,ES/iPS 細胞の安定した培養が可能となります。
特 長
● 濃度の推奨範囲:5~25 μg/ml(細胞株によって異なる)● 多くの研究者に使用されている培地*に 100 ng/ml の濃度
で使われている bFGF を,20 ng/ml まで下げることができます。
● 溶解性:水に不溶,DMSO に可溶*DMEM/F-12 に N2 と B27 のサプリメントを添加した合成培地(Liu, Y., et al., 2006, PMID: 16753134)
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
ES/iPS 細胞分化抑制物質 NN15-017 NEW
NSC NN15-017 5 mg / 35,000 NSC000002分子式:C13H20N2O2,M.W.:236.32,融点:48℃,純度:>98%
NN15-017 の化学構造
O
ONH2N
培養時の推奨試薬
● 培養基質:Matrigel(Corning 社),iMatrix-511(#892011,(株)マトリクソーム)など,ヒト ES/iPS 細胞のフィーダーフリー培養で実績があるもの。
● 剥離液:L7 hPSC継代試薬(Lonza社),ReLeSR(STEMCELL Technologies社),Gentle Cell Dissociation Reagent(STEM CELL Technologies 社)などの非酵素系剥離液,または Accutase(#AT104,Innovative Cell Technologies 社)などの酵素系剥離液。
ヒト多能性幹細胞(ES 細胞,iPS 細胞)の培養には高濃度の bFGF が重要な役割を担っていることが知られており,世界的に最も使われているmTeSR1(STEMCELL Technologies 社)や Essential 8(Thermo Fisher Scientific 社)でも,高濃度の bFGF を使用していることが知られています。また,ヒト多能性幹細胞の未分化維持が可能な培地に関する論文がいくつも発表されていますが,その中で Liu, Y., et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 346, 131~139 (2006) DOI: 10.1016/j.bbrc.2006.05.086 は,様々なラボで未分化維持培養が再現できている培地です。
この培地の特徴は,N2 と B27 の 2 つのサプリメントを含み,培地調製も極めて容易なことです。論文では,bFGF は 100 ng/ml にて使用していますが,この培地に NN15-017 を添加することで,bFGF の濃度を少なくとも 1/5 以下(20 ng/ml 以下)にて培養することができます。
ES 細胞の培養の形態
20 ng/ml bFGF 20 ng/ml bFGF+NN15-017 100 ng/ml bFGF
N2,B27 を使用したヒト多能性幹細胞の培養法
幹細胞(ES/iPS 細胞)の培養に最適な基質iMatrix-511
[Web ページ番号:7756]
穏和な条件で細胞・組織を分散できるAccutase
[Web ページ番号:2334]
こちらもオススメ
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細
胞
関
連
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掲載品はすべて研究用です
26
ルシフェラーゼ活性測定キット HDL および LDL/VLDL の コレステロール量を定量
HDL and LDL/VLDL Cholesterol Assay Kit
NEW
Webページ番号検索2889
Webページ番号検索68783
血清・血漿中のリポタンパク質を,HDL および LDL/VLDL に分画し,それぞれのコレステロール量を蛍光により定量します。
ルシフェラーゼ活性測定キットLuciferase Reporter Gene Assay Kit
特 長
● 約 10 分で測定が完了します。● 細胞の溶解と発光測定を,1 ステップで行えます。● 高感度であり,わずか 4 細胞からでも測定できます。● 検出限界:2 fg Luciferase
● ホタルルシフェラーゼとウミシイタケルシフェラーゼの活性を,連続して測定できます。
● 約 20 分で測定が完了します。● 検出限界:2 fg Luciferase
ホタルルシフェラーゼおよびウミシイタケルシフェラーゼの活性を連続して測定できるキットDual Luciferase Reporter Gene Assay Kit
キット内容
特 長
● Assay reagent● Assay buffer
※測定にはルミノメーターが必要です。
測 定 原 理
LuciferaseATP+D-Luciferin+O2 Oxyluciferin+AMP+PPi+CO2+light
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
Luciferase Reporter Gene Assay Kit, SuperLightBAS182000 BAS SLLU-200 200 assays 1 kit / 27,000BAS185000 BAS SLLU-500 500 assays 1 kit / 48,000BAS180100 BAS SLLU-01K 1,000 assays 1 kit / 81,000
キット内容
● Lysis buffer ● FFL reagent● Assay buffer ● RL reagent
※測定にはルミノメーターが必要です。
測 定 原 理
Firefly LuciferaseATP+D-Luciferin+O2 Oxyluciferin+AMP+PPi+CO2+light
Renilla LuciferaseCoelenterazine+O2 Coelenteramide+CO2+light
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit, SuperLight(100 tests)BAS181000 BAS SLDL-100 1 kit / 27,000
特 長
● 測定試料:血清,血漿(ヘパリン,クエン酸処理)● 標準曲線範囲:1~12 μM● 測定方法:蛍光法● 測定波長:励起 530~570 nm/蛍光 590~600 nm● アッセイ数 :192 assays
※測定には蛍光プレートリーダーが必要です。
測定原理
本アッセイにより,コレステリルエステルおよび遊離コレステロールの総量を定量する。コレステロールエステラーゼを使用しない場合は,遊離コレステロールのみを定量できる。
使用例
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
HDL and LDL/VLDL Cholesterol Assay Kit(192 assays) NEW
CBO STA-391 1 kit / 107,000 CBO998690キット内容:96-well microtiter plate,Cholesterol standard,Assay diluent,Fluorescence probe,HRP,LDL precipitation solution,Cholesterol esterase,Cholesterol oxidase
Cholest-4-ene-3-one
コレステリルエステル(コレステリルオレエート)
コレステロール
H2O
HRP
H2O2 +
蛍光
蛍光プローブ
コレステロールオキシダーゼ
コレステロールエステラーゼ
O
O
H
H
H
H
H
HHO
H
HO
H
■ Total Cholesterol■ HDL■ LDL/VLDL
160
Ch
ole
ster
ol C
on
cen
trat
ion
(m
g/d
L)
140
120
100
80
60
40
20
0ヒト血清
ヒト血清中のコレステロール量の測定例
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
ア
ッ
セ
イ
キ
ッ
ト
試薬 TEL 03 -5684 -1620
FAX 03 -5684 -1775
reagent@funako
shi.co.jp
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
27
急性腎障害マーカー NGAL 測定キット
NGAL ELISA Kit
Webページ番号検索3832
試料中の NGAL をサンドイッチ法により比色定量するELISA キットです。
● 測定波長:450 nm● アッセイ時間:約 4 時間
NGAL(Neutrophil Gelatinase-Associated Lipocalin, Lipocalin-2)とはNGAL は活性化した好中球のほか,腸腺腫や炎症腸上皮,乳腺がん,尿路上皮がんでの発現亢進が見られます。腎臓に障害が生じると尿中の NGAL 濃度が顕著に上昇するため,近年,急性腎障害など各種腎疾患の初期マーカーとして注目されています。
M EMO
[メーカー:ABS]
ABS368362測定動物種
ヒト マウス イヌ ブタ サル ラット
ABS368420 測定試料 血漿,尿 血清,血漿,組織抽出液,細胞培養上清,尿
ABS000430 測定範囲(pg/ml) 10~1,000 10~1,000 4~400 4~400 10~1,000 4~400
ABS368440 商品コード KIT036RUO KIT042 KIT043 KIT044 KIT045 KIT046
ABS368450 包 装 1 kit(96 well)
ABS368460 価格(¥) 145,000 112,000 159,000 136,000 252,000 112,000
NIST 規格に準拠した較正用標準ポリスチレンビーズ
Precision Particles
Webページ番号検索69173
微粒子の粒径および粒度分布を測定する機器の較正に使用するための NIST(米国国立標準技術研究所)規格に準拠した信頼性の高いビーズ標準品です。
● ナノビーズ , マイクロビーズ はディスク型遠心分離機により,また メガビーズ は光学的検知方式(SPOS 法)により粒径・粒度分布の検定を行っています。
● 製品にはロット固有の平均粒径が記載された較正/トレーサビリティー検定書が添付されています。● 分散媒:15 ml/1% 固形分懸濁液(界面活性剤含有)
ナノビーズ
包装/価格(¥):15 ml / 61,000
常粒径 商品コード 常粒径 商品コード
40 nm 64004 400 nm 64017
50 nm 64005 450 nm 64018
60 nm 64006 500 nm 64019
70 nm 64007 550 nm 64020
80 nm 64008 600 nm 64021
90 nm 64009 650 nm 64022
100 nm 64010 700 nm 64023
125 nm 64011 750 nm 64024
150 nm 64012 800 nm 64025
200 nm 64013 850 nm 64026
250 nm 64014 900 nm 64027
300 nm 64015 950 nm 64028
350 nm 64016 - -
マイクロビーズ
包装/価格(¥):15 ml / 68,000
常粒径 商品コード
1.00 μm 64030
1.25 μm 64035
1.50 μm 64040
1.75 μm 64045
2.00 μm 64050
2.50 μm 64055
3.00 μm 64060
3.50 μm 64065
4.00 μm 64070
5.00 μm 64080
6.00 μm 64090
7.00 μm 64100
8.00 μm 64110
9.00 μm 64120
メガビーズ
包装/価格 (¥):15 ml / 68,000
常粒径 商品コード
10.0 μm 64130
12.0 μm 64140
15.0 μm 64155
20.0 μm 64160
25.0 μm 64165
30.0 μm 64170
40.0 μm 64180
50.0 μm 64190
60.0 μm 64200
80.0 μm 64210
100.0 μm 64220
125.0 μm 64225
150.0 μm 64230
175.0 μm 64235
[メーカー:POL]
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
アッセイキット-ビーズ
試薬 TEL 03- 5684-1620 FAX 03-5684- 1775
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
28
レンチウイルスによる形質導入を促進する試薬
LentiBlast PremiumNEW
Webページ番号検索68137
レンチウイルスによる形質導入を促進する試薬です。
特に CD34+細胞(造血幹細胞,初代培養 T 細胞)やその他の形質導入が困難な細胞株における導入効率が向上しています。
従来の LentiBlast に比べて,形質導入効率がアップ!
相対
蛍光
強度
(RF
U)
GFP
陽生
細胞
(%
)
LV LVLBBV2(MOI 0.75) HEK293(MOI 0.75)
LBP LB LBP
70%60%50%40%30%20%10%
0%
70,00060,00050,00040,00030,00020,00010,000
0LV LVLBBV2(MOI 0.75) HEK293(MOI 0.75)
LBP LB LBP
BV2 細胞または HEK293 細胞に GFP 発現用レンチウイルスを感染させた後,GFP 陽性細胞の割合と相対蛍光強度を測定した。LB:従来品の LentiBlast,LBP:新製品の LentiBlast Premium
CD34+幹細胞に低 MOI(MOI 5)で GFP 発現用レンチウイルスを感染させた後,細胞を顕微鏡観察した。右下の数値:本製品の使用量(μl)
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
LentiBlast Premium NEW
OZB LBPX500 500 μl / 47,000 OZB115305OZB LBPX1500 1,500 μl / 98,000 OZB115315
試薬 A 試薬 B
従来品 LentiBlast 新製品 LentiBlast Premium新製品 LentiBlast Premium
使用する試薬が 1本のみになり,さらに使いやすくなりました!
1 2 3 4
1 レンチウイルスを細胞培地で希釈する。
2 レンチウイルス懸濁液に,LentiBlast Premium を加える。
3 チューブを転倒混和する。
4 細胞に懸濁液を添加する。
組織透明化試薬
Visikol HISTO無料サンプル品あります
Webページ番号検索65456
一度透明化した組織を初期状態に復元(非透明化)できるため,3D イメージングを行った後,追加アッセイや免疫組織染色が行えます。
● 従来の透明化試薬とは異なり,細胞膜脂質の除去を行わないため,本来の細胞の構造を損なうことがありません。
● Visikol HISTO Starter Kit(#HSK-1)1 キットでマウス全脳 4 個分(組織約 2 g)の透明化が行えます。
● 小組織(ミクロ組織や脳切片 500 μm など)は Solution #1のみで透明化を行えます。大きな組織は,Solution #1 と#2 を使用します。
特 長
HISTOの種類 屈折率 粘 度 参考使用量
HISTO Solution #1 1.50 148 cP マウス全脳 1 つにつき 7~10 mlHISTO Solution #2 1.53 76 cP
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
Visikol HISTO Solution #1VSK070300 VSK H1-30 30 ml / 73,000VSK071000 VSK H1-100 100 ml / 154,000
Visikol HISTO Solution #2VSK080300 VSK H2-30 30 ml / 20,000VSK081000 VSK H2-100 100 ml / 46,000
Visikol HISTO Solution #1 & 2 サンプルVSK090100 VSK HH-10 10 ml each 1 set / 32,000VSK090300 VSK HH-30 30 ml each 1 set / 83,000VSK091000 VSK HH-100 100 ml each 1 set / 174,000
Visikol HISTO Starter KitVSK100010 VSK HSK-1 1 kit / 137,000
透明化試薬と免疫標識用バッファーのセット。抗体や蛍光色素を別途用意するだけで,組織の透明化から標識染色まで行うことができる。キット内容:Visikol HISTO-1/2(各 30 ml),Penetration buffer,Washing buffer,Blocking buffer,Antibody buffer,Tissue permeabilizing buffer
試料:マウス脳赤:5C10(red-546)緑:chMBP(green-488)青:DAPI(blue-405)
試料:ラット脳赤:Rab-cFos(red-546)緑:mo NFH-AH1(green-488)青:DAPI(blue-405)
本製品で透明化した組織の染色例
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
透
明
化-遺
伝
子
関
連
試薬 TEL 03 -5684 -1620
FAX 03 -5684 -1775
reagent@funako
shi.co.jp
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
29
非変性アガロースゲルで RNA を電気泳動できるRNA High for Easy Electrophoresis
キャンペーン期間:~2020年 2月 28日
Webページ番号検索898
● 専用ローディングバッファー*と RNA 試料を混合し熱処理するだけで,非変性ゲルでも泳動できます。
● 各バンドの RNA 濃度は 0.1 μg/μl に調製されているため,バンドの濃淡の比較によって試料 RNA の量が概算できます。
*ホルムアルデヒドを添加してから使用します。
ホルムアルデヒド 変性アガロースゲル
非変性 アガロースゲル
変性ゲルおよび非変性ゲルのいずれでも同様の泳動パターンを示した。ホルムアルデヒド変性アガロースゲル:1×MOPS,1% アガロース非変性アガロースゲル:1×TAE,1.3% アガロース
品 名メーカー 商品コード 包装 /
通常 価格(¥)
キャンペーン価格(¥)
DynaMarker, RNA High for Easy ElectrophoresisBDL000170 BDL DM170 1 set / 27,000 21,600
変性/非変性アガロースゲルでの RNA 電気泳動を行える独自のローディングバッファーと,RNA 分子量ラダーマーカーのセットです。
特 長
キット付属のマーカー ヒト組織全 RNA
500
1,000
1,5002,000
3,0004,0005,0008,000
200500
1,000
1,5002,000
3,0004,0005,000
8,000
200
キット付属のマーカー ヒト組織全 RNA
Web にユーザーレビュー掲載 検索898
国立遺伝学研究所 黒川裕美子先生
©樹庵じゅあん
安全性を考えると学生実験では特にお勧めしたいイチオシの製品です。
色つき RNA マーカー
Prestain RNA Markerキャンペーン期間:~2020年 2月 28日
Webページ番号検索3921
20%OFF
20%OFF
品 名メーカー 商品コード 包装 /
通常 価格(¥)
キャンペーン価格(¥)
Prestain Marker for RNA HighBDL DM260 180 μl / 25,000 20,000 BDL000260
Prestain Marker for Small RNA PlusBDL DM253 150 μl / 25,000 20,000 BDL000253
ゲル組成:0.8% アガロース, 2.2M ホルムアルデヒド,1×MOPS buffer
ゲル組成:10% ポリアクリルアミド, 7.5M 尿素 / 1×TBE
#DM260base
8,000 ―
4,000 ―
2,000 ―
1,000 ―
500 ―200 ―
#DM253base
100 ―75 ―
50 ―40 ―30 ―
20 ―
加熱変性 不要!!
特 長
● 電気泳動中にも分離状況を目視確認でき,便利です。● ナイロンメンブレンへの転写も可能で,RNA が転写されて
いるかどうかを確認できます。
“Northern Hybridization: A Proficient Method for Detection of Small RNAs and MicroRNAs.”Iram, S., Methods Mol. Biol., 1099, 179 (2014).
[PMID: 24243204]
#DM253 の紹介文献(プロトコル集)
1. Wang, Y., et al., Mol. Genet. Genomics, 290 (2), 471 (2015). [PMID: 25293935]
2. Lin, C.Y., et al., Tansgenic Research., 20 (2), 261 (2011). [PMID: 20559871]
#DM253 の使用文献
0~30%OFF
AllV
iew
PAGE Buffer30%OFF
JetG
iga C
ompetent Cell
20%OFF
TA C
loning Kit
10~20%OFF
BioDynamics Labolatory 社 年度末キャンペーン実施中! 期間:~2020 年 2 月 28 日(金)
終了間近です!
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
遺
伝
子
関
連
試薬 TEL 03- 5684-1620 FAX 03-5684- 1775
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
30
© 樹庵じゅあん
Human Phosphorylation Pathway Profiling Array C55NEW
Webページ番号検索68790
MAPK,AKT,JAK/STAT,NFκB,TGF-β 経路における計 55 種類のリン酸化タンパク質を同時に検出できる抗体アレイです。
● 測定試料:血清,血漿,細胞/組織ライセートなど● 測定法:化学発光
標的因子リスト(リン酸化部位についてはフナコシ Web をご覧下さい)
4E-BP1 AKT AMPKa ATF2 ATM
BAD C-Fos c-Jun CREB EGFR
eIF-2a ERK1/2 GSK-3 α GSK-3 β HDAC2
HDAC4 HSP27 IKBa JAK1 JAK2
JNK MEK MKK3 MKK6 MSK1
MSK2 mTOR NF-kB p27 p38
P53 P70S6K PDK1 PRAS40 PTEN
Raf-1 RPS6 RSK1 RSK2 SHP-1
SHP2 SMAD1 SMAD2 SMAD4 SMAD5
Src STAT1 STAT2 STAT3 STAT5
STAT6 TAK1 TBK1 TYK2 ZAP70
品 名メーカー 商品コード 包装 / 価格(¥)
Human Phosphorylation Pathway Profiling Array C55 NEW
RAY590992 RAY AAH-PPP-1-2 2 membranes 1 kit / 151,000RAY591002 RAY AAH-PPP-1-4 4 membranes 1 kit / 258,000
※解析用ソフトウェアについてはフナコシ Web をご覧下さい。
キャンペーン期間Webページ番号 2020年 3月 4月 5月
20%OFF 全製品 81415 BioVision 社 3/13
20%OFF 全製品 81414 Toronto Research Chemicals 社 3/13
特別価格 オルガノイド,hTERT 不死化細胞 ➡ p.32 参照 81418 ATCC® 3/31
20%OFF 抗体パネル 81426 Arigo Biolaboratories 社 3/31
20%OFF 液状/粉末コラーゲン,コラーゲン線維シート 81396 (株)ニッピ 3/31
10%OFF 無細胞タンパク質合成キット 81380 NUProtein(株) 3/31
30%OFF組換え体タンパク質/ELISA キット
(アカデミックユーザー限定)81422 R&D Systems 3/31
実施中のキャンペーン
MAPKPAKT
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TGFβ
特 長
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たまにフォロワー限定プレゼントキャンペーンをやっていることも…
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
抗体-キャンペーン案内
試薬 TEL 03 -5684 -1620
FAX 03 -5684 -1775
reagent@funako
shi.co.jp
価格・内容は発刊日現在です
掲載品はすべて研究用です
31
ATCC® 製品分譲は初回のご依頼に先立ち,MTA(Material Transfer Agreement)にご同意・ご署名いただくと共に,New Account Application(BSL1・BSL2・BSL3 のいずれか)を提出し,ユーザー登録をしていただく必要がございます(2 回目以降のご依頼時は,フナコシでユーザー登録の有無を確認させていただきます)。※MTA および New Account Application 未提出の場合は分譲をご依頼いただくことはできません。※ご依頼は New Account Application でお名前をご登録いただいた方のみに制限されます。
ご依頼にあたっての注意事項
Webページ番号検索68657
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ご依頼方法についての お問い合わせ
オルガノイド,hTERT 不死化細胞 特別価格キャンペーン
キャンペーン期間:~2020年 3月 31日(火)Webページ番号
検索81418
オルガノイド hTERT 不死化細胞ATCC® のオルガノイドは,HCMI で作製された,二次元(2D)および三次元(3D)の多様な培養がんモデルです。がん研究,新規治療法の特定,標的決定に有用なツールとなっています。
hTERT 不死化細胞とは,ヒトテロメア逆転写酵素(hTERT;Human Telomerase Reverse Transcriptase)遺伝子を初代培養細胞に導入して作製した,正常2倍体の染色体を持つ細胞株です。初代培養細胞の性質に近い状態を保持したまま,安定的に継代できます。
HCMI(Human Cancer Models Initiative)は,関連ゲノムおよび臨床データを用いて,新規のヒト腫瘍由来培養モデルを作製している国際コンソーシアムです。ATCC® は,HCMI のオルガノイド提供機関からモデルを預かり,信頼性確認,増殖,保存および世界への配布を行っています。
memo
各種がんモデル消化器系
呼吸器系
神経系
筋骨格系
豊富な細胞ラインナップ● 肺/気管支● 食道● 血管● 皮膚● 軟骨● 神経● 膵臓● 腎臓● 乳腺● 子宮● 前立腺● 眼● 脂肪/間葉系幹細胞
フナコシニュース 2020 年 2 月 15 日号(No.697)funakoshi news
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※本紙に記載されている価格は,2020年 2月15日現在です。 FUN-6762( 2020.2, № 697 )
フナコシ株式会社 〒113-0033 東京都文京区本郷2丁目9番7号https://www.funakoshi.co.jp/ e-mail : info@funakoshi.co.jp
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