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Replikation – formaler Ablauf. 3`. 5 `. 5 `. 3`. 3`. 5 `. Okazaki-Fragmente. Problemstellung: Warum entstehen Okazaki – Fragmente?. Replikation – Neubetrachtung auf Nukleotidebene. 3`. 5 `. 5 `. 1. 3`. 3`. 5 `. 2. - PowerPoint PPT Presentation
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Okazaki-Fragmente
Replikation – formaler Ablauf
Problemstellung: Warum entstehen Okazaki – Fragmente?
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Replikation – Neubetrachtung auf Nukleotidebene
Zum Verständnis des Mechanismus wird die Replikation im Weiteren auf der Nukleotidebene verfolgt.
5` 3`5`3`
Replikation – Entspiralisierung und Öffnung durch Helikase
5` 3`
5`5`5` 3`3`3`5`3`
Syntheserichtung
ReplikationAblauf am 3`Ende
5`
DNA-Polymerase verknüpft die Nukleotide immer vom 3` Ende zum 5`-Ende der Phosphorgruppe.Wirkungsspezifität der Polymerase!
Vom 3`-Ende des Originalstrangs wird daher die DNA kontinuierlich aufgebaut.
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5`3`
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3`3` 5`5`5` 3`5`3`
Syntheserichtung
3`
Da die Syntheserichtung dieselbe ist lässt sich kein Begründung für das Entstehen von Fragmenten finden. Dies bedeutet, dass ein weiterer Faktor entscheidend sein muss für deren Entstehung.
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3`
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5`3`2
ReplikationAblauf am 5`Ende
Replikation mit Primeram 3` - Ende
5` 3`
5`
Syntheserichtung
Primer
Anlagerung eines Primers ermöglicht die Aktivität der DNA-Polymerase. Diese benötigt zum Starteine Basenpaarung (Substratspezifisch). Synthese läuft kontinuierlich durch, da immer eine Basenpaarung vorhanden ist.Der Primer selbst besteht aus RNA.
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Syntheserichtung
Primer 5` 3`Primer
Primer lagert sich an und schafft eine Basenpaarung. Dort setzt die Polymerase an und bildet ein kleines Stückchen.Vorgang wiederholt sich, da wieder Basenpaare vorhanden.
3`
3`
3`
5`5`
5`3`2
Replikation mit Primeram 5` - Ende
5`3`
5`3`
Replikation mit Primer - Vergleich
Kontinuierlicher Strang
Diskontinuierlicher Strang
Man sieht sofort, dass für den diskontinuierlichen Strang viele RNA-Primer benötigt werden.
Zum Abschluss der Replikation werden die RNA-Primer entfernt
Primer
Primer Primer Primer Primer
5`3`
5`3`
Replikation mit Primer - Vergleich
Kontinuierlicher Strang
Diskontinuierlicher Strang
5`3`
5`3`
Replikation mit Primer - Vergleich
Kontinuierlicher Strang
Diskontinuierlicher Strang
Danach schließt eine Polymerase die Lücken.
5`3`
5`3`
Replikation mit Primer - Vergleich
Kontinuierlicher Strang
Diskontinuierlicher Strang
Eine Ligase verknüpft die neuen Nukleotide mit dem Strang
5`3`
5`3`
Replikation mit Primer - Vergleich
Kontinuierlicher Strang
Diskontinuierlicher Strang
ENDE
