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Biometrie III Datenbeispiel zum Thema Permutationstests Wiebke Rygulla. In dem Versuch wurde die Sterberate von Epiphyas postvittana Eiern (3 unterschiedliche Entwicklungsstadien) nach Kontakt mit unterschiedlichen Konzentrationen von C15-Ampol-CPD-Öl untersucht. Datensatz. - PowerPoint PPT Presentation
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Biometrie III
Datenbeispiel zum Thema Permutationstests
Wiebke Rygulla
In dem Versuch wurde die Sterberate von Epiphyas postvittana Eiern (3 unterschiedliche Entwicklungsstadien) nach Kontakt mit unterschiedlichen Konzentrationen von C15-Ampol-CPD-Öl untersucht.
!!! KEINE MEHRWEGANLAGEN !!!
Datensatz
Konzentration [ml/l]
Alter der Eier tote Eier
Gesamtzahl Eier
0 2 34 2530 7 27 2990 10 29 248
0,1 2 175 2640,1 7 17 3120,1 10 135 2631 2 265 2651 7 73 3011 10 253 2745 2 248 2485 7 306 3065 10 316 316
Jonckheere-Terpstra-Test
Globalanalyse -- Gibt es einen Trend?
Konzentration [ml/l] tote Eier
0 340 270 29
0,1 1750,1 170,1 1351 2651 731 2535 2485 3065 316
p (asy) p (exakt) p (mid)0,0022 0,0017 0,0013
nicht-parametrischer Trendtest
Einfluß der Eierstadien wird ignoriert
Gesamtzahl wird als konstant betrachtet
Es liegt ein Trend vor!
Globalanalyse -- Gibt es einen Trend?Cochran-Armitage-Trendtest
Konzentration [ml/l] tote Eier
Gesamtzahl Eier
0 90 8000,1 327 8391 591 8405 870 870
p (asy) p (MC)<0,0001 <0,0001
Trendtest für Proportionen
Einfluß der Eierstadien wird ignoriert
Werte werden je Konzentration summiert
Es liegt ein Trend vor!
Weitere Analyse der Daten -- Testschemata
4 unterschiedliche Fragestellungen:
1. Welche Behandlung hat bei welchen Eierstadien einen Effekt? Untersuchung der einzelnen Behandlungen unabhängig voneinander.
5 ml/l - 10 Tage 5 ml/l - 7 Tage 5 ml/l - 2 Tage
1 ml/l - 10 Tage 1 ml/l - 7 Tage 1 ml/l - 2 Tage
0.1 ml/l - 10 Tage 0.1 ml/l - 7 Tage 0.1 ml/l - 2 Tage
2. Ermittlung der minimal effektiven Dosis
Weitere Analyse der Daten -- Testschemata
3. Ermittlung der minimal effektiven Dosis je Alter getrennt
5 ml/l - 10 Tage 5 ml/l - 7 Tage 5 ml/l - 2 Tage
1 ml/l - 10 Tage 1 ml/l - 7 Tage 1 ml/l - 2 Tage
0.1 ml/l - 10 Tage 0.1 ml/l - 7 Tage 0.1 ml/l - 2 Tage
4. Ermittlung der minimal effektiven Dosis bei totaler Ordnung
5 ml/l - 10 Tage 5 ml/l - 7 Tage 5 ml/l - 2 Tage
1 ml/l - 10 Tage 1 ml/l - 7 Tage 1 ml/l - 2 Tage
0.1 ml/l - 10 Tage 0.1 ml/l - 7 Tage 0.1 ml/l - 2 Tage
Weitere Analyse der Daten
Konzentration [ml/l]
Alter der Eier tote Eier
Gesamtzahl Eier
0 2 34 2530 7 27 2990 10 29 248
0,1 2 175 2640,1 7 17 3120,1 10 135 2631 2 265 2651 7 73 3011 10 253 2745 2 248 2485 7 306 3065 10 316 316
Konzentration [ml/l]
Alter der Eier tote Eier
Gesamtzahl Eier
0 2 34 2530,1 2 175 264
0 2 34 2531 2 265 265
0 2 34 2535 2 248 248
Weitere Analyse der Daten
Weitere Analyse der Daten2-Test Barnard´s Test
Konzentration [ml/l]
Alter der Eier tote Eier
Gesamtzahl Eier
0 2 34 2530,1 2 175 264
0 [ml/l] 0,1 [ml/l] Summetote Eier 34 175 209
lebende Eier 219 89 308Summe 253 264 517
0 [ml/l] 0,1 [ml/l] Summetote Eier 209
lebende Eier 308Summe
0 [ml/l] 0,1 [ml/l] Summetote Eier
lebende EierSumme 517
p-Werte
2 Tage alte Eier p (asy) p (exact) p (mid) p (Barnard)
0.1 vs. 0 <0,0001 <0,0001 <0,0001 <0,0001
1 vs. 0 <0,0001 <0,0001 <0,0001 <0,0001
5 vs. 0 <0,0001 <0,0001 <0,0001 <0,0001
7 Tage alte Eier p (asy) p (exact) p (mid) p (Barnard)
0.1 vs. 0 0,0435 0,0597 0,0451 0,0457
1 vs. 0 <0,0001 <0,0001 <0,0001 <0,0001
5 vs. 0 <0,0001 <0,0001 <0,0001 <0,0001
10 Tage alte Eier p (asy) p (exact) p (mid) p (Barnard)
0.1 vs. 0 <0,0001 <0,0001 <0,0001 <0,0001
1 vs. 0 <0,0001 <0,0001 <0,0001 <0,0001
5 vs. 0 <0,0001 <0,0001 <0,0001 <0,0001
Ergebnisse -- 1. Fragestellung
Untersuchung der einzelnen Behandlungen unabhängig voneinander.
-Adjustierung:
Es werden 9 Einzelvergleiche durchgeführt, daher müssen die p-Werte mit /9 verglichen werden (/9 = 0,00556).
Ergebnis:
Nur 7 Tage alte Eier können nicht mit der geringsten Konzentration bekämpft werden.
Ergebnisse -- 2. Fragestellung
Ermittlung der minimal effektiven Dosis
5 ml/l - 10 Tage 5 ml/l - 7 Tage 5 ml/l - 2 Tage
1 ml/l - 10 Tage 1 ml/l - 7 Tage 1 ml/l - 2 Tage
0.1 ml/l - 10 Tage 0.1 ml/l - 7 Tage 0.1 ml/l - 2 Tage
-Adjustierung:
Jede Ebene darf zu getestet werden. Da je Ebene 3 Vergleiche durchgeführt werden, müssen die p-Werte mit /3 verglichen werden (/3 = 0,01667).
Ergebnis:
Die erste Nicht-Signifikanz tritt beim Vergleich von 7 Tage alten Eiern bei 0.1ml/l vs. Kontrolle auf, daher ist die darüberliegende Ebene (1ml/l) die minimal effektive Dosis.
Ergebnisse -- 3. Fragestellung
Ermittlung der minimal effektiven Dosis je Alter getrennt
5 ml/l - 10 Tage 5 ml/l - 7 Tage 5 ml/l - 2 Tage
1 ml/l - 10 Tage 1 ml/l - 7 Tage 1 ml/l - 2 Tage
0.1 ml/l - 10 Tage 0.1 ml/l - 7 Tage 0.1 ml/l - 2 Tage
-Adjustierung:
Da je Alter nur eine Konzentrationsstufe getestet wird, dürfen die p-Werte mit verglichen werden.
Ergebnis:
Bei allen Eierstadien liegt die minimal effektive Dosis bei 0.1 ml/l.
Ergebnisse -- 4. Fragestellung
Ermittlung der minimal effektiven Dosis bei totaler Ordnung
5 ml/l - 10 Tage 5 ml/l - 7 Tage 5 ml/l - 2 Tage
1 ml/l - 10 Tage 1 ml/l - 7 Tage 1 ml/l - 2 Tage
0.1 ml/l - 10 Tage 0.1 ml/l - 7 Tage 0.1 ml/l - 2 Tage
-Adjustierung:
Da die Vergleiche in einer bestimmten Reihenfolge nacheinander getestet werden. Darf jeder Vergleich zu durchgeführt werden.
Ergebnis:
Alle Vergleiche sind signifikant, daher ist die kleinste Konzentration (0.1 ml/l) die minimal effektive Dosis.
Biometrie III
Datenbeispiel zum Thema Permutationstests
Wiebke Rygulla
