23
Seite ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften Publikation von Forschungsdaten im Fachrepositorium Lebenswissenschaften ein Werkstattbericht

ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

  • Upload
    others

  • View
    1

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

Seite

ZB MED – Leibniz-Informationszentrum

Lebenswissenschaften

Publikation von Forschungsdaten im Fachrepositorium

Lebenswissenschaften – ein Werkstattbericht

Page 2: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Forschungsdaten im Fachrepositorium

Lebenswissenschaften

Entwicklung des Fachrepositoriums Lebenswissenschaften

Der Weg zur Publikation von Forschungsdaten – Ziele und

Vorgehensweise

Metadaten für lebenswissenschaftliche Forschungsdaten

Ein Einblick ins System

Fragen?

15. Juni 2016 2

Page 3: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Fachrepositorium Lebenswissenschaften

in PUBLISSO – Open-Access-Publikationsportal

15. Juni 2016 3

PUBLISSO-Publikationsangebote

ZeitschriftenBücher

ForschungsdatenKongresse

Erstpublikationen Fachrepositorium Lebenswissenschaften

GO

LD

GR

ÜN

- basierend auf DRUPAL (open source)

- Software wird der Community zur Verfügung gestellt

- basierend auf Fedora

(open source)

- in Kooperation mit dem

Hochschulbibliotheksze

mtrium NRW (hbz)

alle lebenswissenschaftliche

Fächer

Page 4: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Fachrepositorium Lebenswissenschaften

Wohin geht die Entwicklung?

15. Juni 2016 4

Ausgangspunkt

„ElliNet“ (Erfassung im Verbundkatalog)

Neukonzeption

Hochschulschriftenserver

Graue Literatur

Monographien

Softwareumstellung

(Unselbstständige) Publikationsarten

Institutionelle Sicht

Kongressbeiträge

Zeitschriftenartikel

(Buch) Kapitel

Forschungsdaten

Neue Medientypen

(direkt im Repository erfasst)

Page 5: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Ziele und Strategien des Forschungsdatenmanagement

bei ZB MED

Aufzeigen bereits vorhandener Infrastrukturen

Identifizierung von Lücken

„Long tail“ der Forschungsdaten

Aufbau eigener Infrastrukturen in Kooperation mit lebenswissenschaftlichen

Fachcommunities

15. Juni 2016 5

http://www.publisso.de/open-access-publizieren/forschungsdaten/forschungsdatenrepositorien/

Page 6: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Ziele im Fachrepositorium Lebenswissenschaften

dauerhafte Archivierung von Forschungsdaten aus den

Lebenswissenschaften,

Sicherstellung der Nachnutzbarkeit der

Forschungsdaten,

Publikation singulärer Forschungsdaten („raw research

data“) sowie von Forschungsdaten, die mit einem

Volltext verknüpft sind („enhanced publication),

Lizenzierung der Daten im Sinne von Open Data, also

der Möglichkeit zur Nachnutzung.15. Juni 2016 6

Page 7: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Schritte beim Ausbau des Fachrepositoriums

Lebenswissenschaften

1. Entwicklung eines Metadatenschemas

(„Erfassungsmaske“),

2. technische Implementierung der

Erfassungsmaske,

3. Erprobung durch Publikation realer

Forschungsdaten.

15. Juni 2016 7

abgeschlossen

In Bearbeitung

Kontakte zu Kooperationspartnern

Page 8: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Entwicklung eines Metadatenschemas -

Orientierungshilfen

15. Juni 2016 8

Institution relevante Inhalte Fachgebiet

Digital Curation Center (DCC)

Auflistung von bereits erstellten

Metadatenstandards diverser

Disziplinen (Grundauswahl)

generisch

Humboldt Universität Berlin

Informationen zur Dokumentation

von Forschungsdaten sowie zu

geeigneten Metadatenschemata

generisch / Beispiele für Disziplinen

DataCite

Auswahl zwischen festgelegten und

optionalen Inhalten (Möglichkeit auf

Diversität der Disziplinen

einzugehen)

generisch

GESIS DatoriumBeispiel für allgemeine Aufnahme

von Forschungsdaten

Sozialwissenschaften

PangaeaDatenrepositorium für

Geowissenschaften

Geo-/ Agrarwissenschaften

Dublin Core Metadata Initiative

(DCMI)

weltweiter Metadaten-Standard

Darwin Core

Weiterentwicklung von DCMI zur

Darstellung von biologischen

Spezifikationen

Biologie / Geologie

PUB Uni BielefeldBeispiel zur Darstellung von

Forschungsdaten im Repositorium

generisch

Page 9: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

DataCite Metadatenschema

15. Juni 2016 9

Pflichtfelder Empfohlene Felder Optionale Felder

Identifier (with type Attribut) Subject (with scheme sub‐property) Language

Creator (with type and name

identifier attributes)

Contributor (with type, name

identifier, and affiliation

sub‐properties)

Size

Title (with optional type attribut) Date (with type sub‐property) Format

Publisher RelatedIdentifier (with type and

relation type sub‐properties)

Version

Publication Year Description (with type sub‐property) Rights

ResourceType (with general type

description sub‐property)

GeoLocation (with point and box

sub‐properties)

Page 10: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Metadatenschema Fachrepositorium - Pflichtfelder

15. Juni 2016 10

Metadatum

(übergeordneter Begriff)Feldname Feldname (untergeordnet)

Titel Titel

Urheberschaft Autor*in Nachname

Vorname

Orcid ID (optional)

Affiliation (optional)

Körperschaft (wenn kein Autor vorhanden)

Dateiupload Hochzuladende Datei

Format (xls, jpeg, etc.)

Medientyp (Bild, Video, Software, etc.)

Größe

Zugriffsrechte (open access, Embargo) Embargofristende

Copyrightjahr

Lizenz

DOI Neu

Vorhanden

Zuletzt hochgeladen

Erschließung Abstract Sprache

Fachgruppenzuordnung

DDC-Klassifikation

Sprache

Page 11: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Metadatenschema Fachrepositorium – optionale Felder

15. Juni 2016 11

Metadatum

(übergeordneter

Begriff)

Feldname Feldname (untergeordnet)

Beteiligte Beteiligte Personen Orcid ID

Affiliation

Förderer Förder-ID

Erfassung Schlagworte Sprache

Datenerhebungsform

Erhebungszeit Zeitpunkt

Zeitraum

Erfassungsort Koordinaten (Point)

Kordinaten (Box)

Externe Referenzen Verwendete Publikationen

Zugehörige Publikationen

Versionen Vorgänger

Nachfolger

Page 12: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Sacherschließung

15. Juni 2016 12

Einträge aus der GND ((Auto-)Vorschläge des Systems)

DDC– 610 (Medizin, Gesundheitswesen),

– 610 & 640 (Ernährungswissenschaft),

– 630 (Agrarwissenschaft)

– 333.7 (Umwelt)

fünf definierte Fachgruppen (ZB MED)– Medizin

– Gesundheit

– Agrar

– Umwelt

– Biologie

– Interdisziplinär

Freie Schlagworte („selbst lernend“)

Ziel: Ausweitung möglicher Sucheinstiege durch Einbindung vorhandener

Klassifikationen, etc.

Page 13: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeite

Lizenzen

Birte Lindstädt - ZB MED - Forschungsdaten 15. Juni 2016 13

Voreingestellte Empfehlung: ODC BY (Open Data Commons Attribution License)

Weitere Auswahlmöglichkeiten:

CC0

CC BY

ODbL (Open Database License)

PDDL (Public Domain Dedication and License)

GNU GPL (GNU General Public Licence) für Software

Sonstige (mit Eingabemöglichkeit)

Hinterlegung des Lizenztextes als Link

Ziel: Verbindlichkeit für Open Data im Sinne einer Nachnutzbarkeit schaffen

Page 14: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeite

Embargofrist

Konkretes Datum für die Publikation von Autor festzulegen

max. zwei Jahre ab Publikation der Metadaten

Ablauf der Embargofrist muss ZB MED in irgendeiner Form

angezeigt werden

Birte Lindstädt - ZB MED - Forschungsdaten 15. Juni 2016 14

Ziel: Forschenden Zeit zum Abschluss eigener Forschung geben

Page 15: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeite

Externe Referenzen – Beziehungen eines

Forschungsdatensatzes

Quellen / verwendete Forschungsdaten

Versionen (über DOI abgebildet)

zugehörige Forschungsdaten

zugehöriger Volltext

Birte Lindstädt - ZB MED - Forschungsdaten 15. Juni 2016 15

Ziel: Zusammenhänge aufzeigen

Page 16: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Einblicke ins System

„Enhanced Publication“ - Dateihierarchie

15. Juni 2016 16

Metadatentragende Datei / „Volltext“

„Kind-Objekt“

Page 17: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

„Enhanced Publication“ - Dateihierarchie

15. Juni 2016 17

„Kind-Objekt“

Page 18: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Viewer für Bilder und Videos

15. Juni 2016 18

High-resolution zoomable images(Basis: OpenSeadragon)

Page 19: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Linked Open Data – Beispiel GND

15. Juni 2016 19

• Schlagworte

• Personen

• Körperschaften

Page 20: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

Linked Open Data

15. Juni 2016 20

• Daten werden maschinenlesbar als Linked Data in RDFa angeboten

• Identifier können im System gesucht werden und sind über Linksymbole mit ihrer Quelle (z.B. GND) verlinkt

Page 21: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeite

„Raw research data“ - Planungen

Realisierung Gigabyte großer Uploads

Metadaten-Erfassung für Forschungsdaten direkt im Repositorium

Embargo

Lizenzverwaltung

Login mit Orcid ID

Einbindung von Orcid ID in die Personenrecherche

Birte Lindstädt - ZB MED - Forschungsdaten 15. Juni 2016 21

Page 22: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeiteBirte Lindstädt– ZB MED – Forschungsdaten

„Raw research data“ - Architektur

15. Juni 2016 22

Publisso Frontend

regal-drupal

Publisso

Data Upload

Publisso Backend

regal-api

neu !

Publisso Helper

Lobid

Etikett

Thumby

Deepzoom

GND-Linked-Data

DDC-Linked-Data

OrcID

Geodatenneu !

„Zettel“

(Bereitstellung von Erfassungsmasken)

neu !

Page 23: ZB MED – Leibniz-Informationszentrum Lebenswissenschaften · 2017. 4. 12. · regal-drupal Publisso Data Upload Publisso Backend regal-api neu ! Publisso Helper Lobid Etikett Thumby

SeiteSeite

Danke! Fragen?

Birte Lindstädt

Open-Access- Publizieren und

-Beraten

Forschungsdatenmanagement

Gleueler Straße 60

50931 Köln

[email protected]

+49 (0) 221 478-97803

23