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Dr. Ulrich Scheller
OCH2
OH
O
O
O
O - P = O
O - P = O
O - P = O
O
-
NukleinsäureNukleinsäureDesoxyriboseDesoxyribose
TriphosphatTriphosphat
Ein Nukleotid – Grundbaustein der DNA
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 2
DNA-Synthese: WDNA-Synthese: Wie werden Nukleotide miteinander verknüpft?
OCH2
OH
O
O
O
-
O - P = O
-
O - P = O
-
O - P = O
O
-
Base
OCH2
OH
O
O
O
O - P = O
O - P = O
O - P = O
O
Base
OH
O
O - P = O
O - P = O
O
O
OCH2
O
O
O
O - P = O
O - P = O
O - P = O
O
Base
OCH2
OH
O
O - P = O
Base
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 3
Die Kette wächst!
DNA-Polymerase
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 4
Didesoxynukleotid (ddNTP)
OCH2
OH
O
O
O
O - P = O
O - P = O
O - P = O
O
Base
Desoxynukleotid (dNTP)
DidesoxynukleotideDidesoxynukleotide: : Eine wichtige OH-Gruppe wird entfernt
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 5
Einbauen von Fehlern: Einbauen von Fehlern: ddNTP‘s
OCH2
OH
O
O
O
O - P = O
O - P = O
O - P = O
O
BaseO
CH2
OH
O
O
O
O - P = O
O - P = O
O - P = O
O
Base
Keine Reaktion!!!Keine Reaktion!!!
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 6
Eine Sequenzierung = 4 Ansätze Eine Sequenzierung = 4 Ansätze
Ansatz A Ansatz C Ansatz G
H
T
H
C
H
G
Ansatz T
DNAPrimer
Polymerase
DNAPrimer
Polymerase
DNAPrimer
Polymerase
DNAPrimer
Polymerase
2
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 7
Die Synthesereaktion:Die Synthesereaktion: Eine Vorlage – viele verschiedene Produkte
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 8
Fragmente verschiedener LängeFragmente verschiedener Länge –– a aber das Ende ist gleich!!!
GCGTAAGGCATAGAC
GC
GCGTAAGGC
GCGTAAG
GCGTAAGGCATAG
GCG
G
GCGTAAGGCATAGACG
GCGTAAGG
Ansatz C Ansatz TAnsatz GAnsatz A
GCGTAAGGCAT
GCGT
GCGTAAGGCATAGT
GCGTA
GCGTAA
GCGTAAGGCA
GCGTAAGGCATA
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 9
Ansatz C Ansatz TAnsatz GAnsatz A
---------A
-----------A
--------------------A
------------------------A
-------------------------------C
---C
------------------C
-------------G
--------------------------G
-----G
G
---------------------------------G
----------------G
-----------------------------T
----------------------T
-------T
Fragmente verschiedener LängeFragmente verschiedener Längeaber das Ende ist gleich !!!Fragmente verschiedener LängeFragmente verschiedener Länge
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 10
GelelektrophoreseGelelektrophorese: : Das Wirrwar wird geordnet
A C G T
+
-
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 11
G
Die Sequenz wird gelesenDie Sequenz wird gelesen
+
-A C G T
CAGATACGGAATG
G
C
23.01.2008Dr. Ulrich Scheller
Das menschliche Genom - Alphabetdes Lebens
Folie Nr. 12
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