Curriculum vitae

Dr. Sumit Biswas, Ph.D.

AAssssiissttaanntt PPrrooffeessssoorr,, DDeeppaarrttmmeenntt ooff BBiioollooggiiccaall SScciieenncceess,, BBiirrllaa IInnssttiittuuttee OOff TTeecchhnnoollooggyy && SScciieenncceess,, PPiillaannii KK..KK.. BBiirrllaa GGooaa CCaammppuuss

E-mail: ssuummiitt@@ggooaa..bbiittss--ppiillaannii..aacc..iinn,, ttiimmuussiinnvveerrssee@@ggmmaaiill..ccoomm

Telephone No.: ((00883322)) 22558800--117788 MMoobbiillee:: ++99555522555500118800

Research Areas:

SSttrruuccttuurree ooff mmaaccrroommoolleeccuulleess ((eessppeecciiaallllyy pprrootteeiinnss)),, CCrryyssttaallllooggrraapphhyy ooff pprrootteeiinnss aanndd ccoommpplleexxeess,, BBiioopphhyyssiiccaall ssttuuddiieess oonn tthhee ssttrruuccttuurree--ffuunnccttiioonn rreellaattiioonnsshhiipp iinn pprrootteeiinn ddoommaaiinnss..

BBiiooiinnffoorrmmaattiiccss ooff pprrootteeiinn--nnuucclleeiicc aacciidd iinntteerraaccttiioonnss,, SSiiggnnaattuurreess iinn mmiiccrrooRRNNAA aassssoocciiaatteedd wwiitthh ccaanncceerrss,, MMaacchhiinnee LLeeaarrnniinngg AApppprrooaacchheess,, SSiimmuullaattiioonn ooff pprrootteeiinn iinntteerrffaacceess iinn hhyyppeerrtthheerrmmoopphhiilleess..

LLiiffee ccyyccllee sswwiittcchhiinngg iinn VViibbrriioo cchhoolleerraaee,, EEnnvviirroonnmmeennttaall sseennssiinngg,, EEffffeecctt ooff nnaattuurraall ppllaanntt pprroodduuccttss oonn ccaanncceerrss..

About me:

BBIITTSS,, PPiillaannii –– KK KK BBiirrllaa GGooaa CCaammppuuss iiss mmyy ffiirrsstt jjoobb aassssiiggnnmmeenntt.. HHaavviinngg jjooiinneedd aass aann AAssssiissttaanntt PPrrooffeessssoorr iinn BBiioollooggiiccaall SScciieenncceess iinn llaattee 22000099,, iitt hhaass pprroovviiddeedd mmee aa ppllaattffoorrmm aanndd aann ooppppoorrttuunniittyy ttoo ggrrooww bbootthh aass aann iinnddiivviidduuaall aanndd aann aaccaaddeemmiicc.. II hhaadd pprreevviioouussllyy bbeeeenn ooccccuuppiieedd aass aa RReesseeaarrcchh AAssssoocciiaattee ffoorr aabboouutt aa yyeeaarr,, aafftteerr ccoommpplleettiinngg mmyy PPhh..DD.. uunnddeerr PPrrooff.. PPiinnaakk CChhaakkrraabbaarrttii aatt BBoossee IInnssttiittuuttee.. MMyy PPhh..DD.. tthheessiiss iinnvvoollvveedd wwoorrkk oonn ssttrruuccttuurree ddeetteerrmmiinnaattiioonn ooff ccAAMMPP RReecceeppttoorr PPrrootteeiinnss ffrroomm vvaarriioouuss hhoossttss aanndd aa tthheeoorreettiiccaall ddiisssseeccttiioonn ooff pprrootteeiinn--nnuucclleeiicc aacciidd iinntteerrffaacceess.. AAfftteerr jjooiinniinngg BBIITTSS,, aappaarrtt ffrroomm sshhoouullddeerriinngg aa mmaajjoorr cchhuunnkk ooff tteeaacchhiinngg aassssiiggnnmmeennttss,, II hhaavvee ddeevvootteedd mmyysseellff ttoo tthhee qquueesstt ffoorr ffiinnddiinngg aann aalltteerrnnaattiivvee mmeetthhoodd ffoorr ttaacckklliinngg cchhoolleerraa –– aann iinntteerreesstt II ppiicckkeedd uupp dduurriinngg mmyy ppoosstt ddooccttoorraall ssttiinntt.. LLiikkeewwiissee,, tthhee ddeevveellooppmmeenntt ooff aann aallggoorriitthhmm aanndd eevveennttuuaallllyy aa wweebb--bbaasseedd sseerrvveerr ffoorr tthhee iiddeennttiiffiiccaattiioonn aanndd vvaalliiddaattiioonn ooff mmiiccrrooRRNNAAss aassssoocciiaatteedd wwiitthh ccaanncceerr,, hhaass bbeeeenn aa pprroojjeecctt vveerryy cclloossee ttoo mmyy hheeaarrtt.. GGeenneerroouuss aanndd mmuullttiippllee rreessoouurrcceess ffrroomm aa nnuummbbeerr ooff ffuunnddiinngg aaggeenncciieess hhaavvee hheellppeedd mmyy ccaauussee.. AAtt tthhee mmoommeenntt,, II mmeennttoorr aanndd lleeaadd tthhee VVIISSTTAA ((VViibbrriioo aanndd SSttrruuccttuurraall AAnnaallyyssiiss))

LLaabboorraattoorryy iinn BBIITTSS,, wwhhiicchh hhaass bbootthh PPhh..DD.. sscchhoollaarrss aanndd MM..EE..//MM..SScc.. ssttuuddeennttss wwoorrkkiinngg oonn vvaarriioouuss pprroojjeeccttss rreelleevvaanntt ttoo tthhee aabboovvee ssuubbjjeeccttss.. Personal Information:

Date & Place of Birth : 99tthh OOccttoobbeerr,, 11997788 ((0099//1100//11997788));; KKoollkkaattaa

Nationality : IInnddiiaann

Present position : AAssssiissttaanntt PPrrooffeessssoorr

Institution with address: DDeeppaarrttmmeenntt ooff BBiioollooggiiccaall SScciieenncceess,, BBiirrllaa IInnssttiittuuttee OOff TTeecchhnnoollooggyy && SScciieenncceess,, PPiillaannii

KK..KK.. BBiirrllaa GGooaa CCaammppuuss NNeeaarr NNHH1177BB,, BByyee ppaassss RRooaadd,, ZZuuaarriinnaaggaarr –– 440033 772266,, GGOOAA,, IINNDDIIAA..

Educational Qualifications:

Degree University Major subject Year

BB..SScc.. ((HHoonnss..)) CCaallccuuttttaa UUnniivveerrssiittyy ZZoooollooggyy 22000000

MM..SScc.. CCaallccuuttttaa UUnniivveerrssiittyy BBiioopphhyyssiiccss,, MMoolleeccuullaarr

BBiioollooggyy aanndd GGeenneettiiccss 22000022

PPhh..DD.. BBoossee IInnssttiittuuttee SSttrruuccttuurraall BBiioollooggyy aanndd

BBiioocchheemmiissttrryy 22000088

PPhh..DD.. TThheessiiss TTiittllee:: ““AAnn AAnnaallyyssiiss ooff PPrrootteeiinn--NNuucclleeiicc AAcciidd IInntteerraaccttiioonnss aanndd CCrryyssttaalllliizzaattiioonn ssttuuddiieess oonn PPrrootteeiinnss”” MMeennttoorr:: PPrrooff.. PPiinnaakk CChhaakkrraabbaarrttii,, DDeepptt.. ooff BBiioocchheemmiissttrryy,, BBoossee

IInnssttiittuuttee,, KKoollkkaattaa..

Experience:

AA.. DDeettaaiillss ooff pprrooffeessssiioonnaall ttrraaiinniinngg aanndd rreesseeaarrcchh eexxppeerriieennccee,, ssppeecciiffyyiinngg ppeerriioodd.

2001: MMaasstteerrss ddeeggrreeee pprroojjeecctt uunnddeerr DDrr.. KK..VV.. RRaaddhhaakkiisshhaann aatt tthhee IInnssttiittuuttee ooff MMiiccrroobbiiaall TTeecchhnnoollooggyy,, CChhaannddiiggaarrhh iinn aa pprroojjeecctt ttiittlleedd ““CCoorrrreellaattiioonn AAnnaallyyssiiss ooff FFlleexxiibbllee RReeggiioonnss iinn PPrrootteeiinn SSttrruuccttuurreess DDeerriivveedd bbyy XX--RRaayy aanndd NNMMRR MMeetthhooddss””..

22000022--22000088:: PPhh..DD.. tthheessiiss ttiittlleedd ““AAnn AAnnaallyyssiiss ooff PPrrootteeiinn--NNuucclleeiicc AAcciidd

IInntteerraaccttiioonnss aanndd CCrryyssttaalllliizzaattiioonn ssttuuddiieess oonn PPrrootteeiinnss”” uunnddeerr PPrrooff.. PPiinnaakk CChhaakkrraabbaarrttii,, DDeepptt.. ooff BBiioocchheemmiissttrryy,, BBoossee IInnssttiittuuttee,, KKoollkkaattaa.. ((TThhee wwoorrkk ccoovveerrss bbootthh tthheeoorreettiiccaall aanndd eexxppeerriimmeennttaall aassppeeccttss.. TThhee pphhyyssiiccoocchheemmiiccaall ffeeaattuurreess tthhaatt cchhaarraacctteerriizzee pprrootteeiinn--nnuucclleeiicc aacciidd iinntteerrffaacceess hhaavvee bbeeeenn aannaallyyzzeedd,, tthhee ccAAMMPP RReecceeppttoorr PPrrootteeiinnss ((CCRRPP)) ffrroomm EE..ccoollii,, VV..cchhoolleerraaee aanndd AA..ttuummeeffaacciieennss hhaavvee bbeeeenn eexxpprreesssseedd,, ppuurriiffiieedd,, cchhaarraacctteerriizzeedd aanndd ccrryyssttaalllliizzaattiioonn eexxppeerriimmeennttss sseett uupp.. FFiinnaallllyy,, tthhee 11--LL mmyyoo--iinnoossiittooll 11--pphhoosspphhaattee ssyynntthhaasseess ffrroomm PPoorrtteerreessiiaa ccooaarrccttaattaa aanndd OO..ssaattiivvaa wweerree eexxpprreesssseedd,, ppuurriiffiieedd aanndd ccrryyssttaalllliizzaattiioonn aatttteemmppttss wweerree mmaaddee ttoo uunnddeerrssttaanndd tthhee ssttrruuccttuurraall ddiiffffeerreenncceess tthhaatt rreessuulltt iinn tthhee ssaalltt--ttoolleerraannccee pprrooppeerrttiieess ooff PP..ccooaarrccttaattaa..))

22000088--22000099:: PPoosstt--ddooccttoorraall rreesseeaarrcchheerr ((RReesseeaarrcchh AAssssoocciiaattee)) uunnddeerr PPrrooff.. PPiinnaakk

CChhaakkrraabbaarrttii,, DDeepptt.. ooff BBiioocchheemmiissttrryy,, BBoossee IInnssttiittuuttee,, KKoollkkaattaa.. ((AA ccyyttoo--ccaarrddiioottooxxiinn ffrroomm NNaajjaa kkaaoouutthhiiaa hhaavviinngg aannttii--ccaanncceerriiaall aaccttiivviittyy hhaass bbeeeenn sseeqquueenncceedd,, bbiioopphhyyssiiccaallllyy cchhaarraacctteerriizzeedd,, ccrryyssttaalllliizzeedd aanndd ddiiffffrraacctteedd ttoo ooppttiimmaall rreessoolluuttiioonn aanndd tthhee ssttrruuccttuurree ssoolluuttiioonn iiss iinn pprroocceessss))..

22000099--22001133:: IInnvvoollvveedd iinn tthhrreeee--pprroonnggeedd rreesseeaarrcchh::

LLiiffeessttyyllee sswwiittcchhiinngg iinn VViibbrriioo cchhoolleerraaee :: IInnvvoollvveess tthhee lliiffeessttyyllee sswwiittcchhiinngg ooff VViibbrriioo cchhoolleerraaee aanndd iinndduuccttiioonn ooff vviirruulleennccee.. PPrreesseenntt rreesseeaarrcchh iinn tthhiiss aarreeaa iinnvvoollvveess iinnvveessttiiggaattiioonn iinnttoo aa GGGGEEEEFF ddoommaaiinn pprrootteeiinn ffrroomm VV.. cchhoolleerraaee aanndd cchhaarraacctteerriizzaattiioonn ooff aa pprriimmaarryy ssiiggmmaa ffaaccttoorr ffrroomm tthhee ssaammee ssoouurrccee.. WWhhiillee ssttrruuccttuurraall ssttuuddiieess iinnvvoollvviinngg XX--rraayy ccrryyssttaallllooggrraapphhyy iiss aa mmaajjoorr ttooooll ffoorr tthheessee ssttuuddiieess,, mmoolleeccuullaarr bbiioollooggyy ooff VV.. cchhoolleerraaee aanndd ootthheerr bbiioopphhyyssiiccaall mmeetthhooddss aarree aallssoo bbeeiinngg ddeeaalltt wwiitthh.. EEffffoorrttss wwiillll bbee mmaaddee ffoorr tthhee iinndduuccttiioonn ooff aa mmuuttaanntt GGGGEEEEFF ssttrraaiinn iinnttoo tthhee eennvviirroonnmmeenntt..

((iiii)) OOnnccoommeerriicc mmiiccrrooRRNNAAss:: TThhee sseeccoonndd aarreeaa iiss aa ccoommppuuttaattiioonnaall

bbiioollooggyy pprroojjeecctt ccoonncceerrnneedd wwiitthh tthhee pprreeddiiccttiioonn aanndd vvaalliiddaattiioonn ooff oonnccooggeenniicciittyy ooff mmiiccrrooRRNNAAss.. WWhhiillee eexxppeerriimmeennttaall mmeetthhooddss ttoo ddeetteerrmmiinnee tthhee iinnvvoollvveemmeenntt ooff mmiiccrrooRRNNAAss iinn oonnccooggeenniicc ppaatthhwwaayyss iiss aa ttiimmee--ccoonnssuummiinngg aanndd eexxtteennssiivvee pprroocceessss,, mmyy llaabb hhaass ssttrruucckk uuppoonn aann iinnnnoovvaattiivvee ttooooll ttoo pprreeddiicctt aanndd vvaalliiddaattee oonnccoommeerriicc mmiiccrrooRRNNAAss..

((iiiiii)) PPhhaarrmmaaccoollooggiiccaallllyy aaccttiivvee pprrootteeiinnss iinn MMoorriinnggaa oolleeiiffeerraa lleeaaff::

CCoommpplleettee ssccrreeeenniinngg ooff tthhee lleeaaff eexxttrraacctt ooff MMoorriinnggaa oolleeiiffeerraa aanndd sseeppaarraattiioonn ooff pprrootteeiinnaacceeoouuss ccoommppoonneennttss aarree bbeeiinngg uunnddeerrttaakkeenn.. WWhhiillee ssoommee hhaavvee bbeeeenn ffoouunndd ttoo hhaavvee pprrooffoouunndd eeffffeeccttss oonn sseerruumm ccrreeaattiinniinnee,, ootthheerrss aarree iinnddiiccaattiivvee ooff rreevveerrssaall ooff ddaammaaggee iinn mmeellaannoommaass..

BB.. DDeettaaiillss ooff eemmppllooyymmeenntt ((ppaasstt && pprreesseenntt))..

2009-Present: EEmmppllooyyeedd aass aann AAssssiissttaanntt PPrrooffeessssoorr aatt BBIITTSS--PPiillaannii,, KK KK BBiirrllaa GGooaa CCaammppuuss..

2008-2009: RReesseeaarrcchh AAssssoocciiaattee uunnddeerr DDrr.. PPiinnaakk CChhaakkrraabbaarrttii aatt BBoossee IInnssttiittuuttee,, KKoollkkaattaa..

2002-2008: CCSSIIRR--JJRRFF aanndd CCSSIIRR--SSRRFF uunnddeerr DDrr.. PPiinnaakk CChhaakkrraabbaarrttii aatt BBoossee IInnssttiittuuttee,, KKoollkkaattaa..

2002-2003: TTaauugghhtt ZZoooollooggyy aass aann hhoonnoorraarryy LLeeccttuurreerr aatt BBiiddhhaannnnaaggaarr CCoolllleeggee,, KKoollkkaattaa aatt bbootthh ggrraadduuaattee aanndd ppoosstt--ggrraadduuaattee lleevveell..

2004-2007: TTaauugghhtt MMiiccrroobbiioollooggyy iinn aann hhoonnoorraarryy ccaappaacciittyy aatt BBiiddhhaannnnaaggaarr CCoolllleeggee,, KKoollkkaattaa aatt bbootthh ggrraadduuaattee aanndd ppoosstt--ggrraadduuaattee lleevveell..

CC.. SSppoonnssoorreedd pprroojjeeccttss rruunnnniinngg oorr ccoommpplleetteedd.. i. As Principal Investigator: FOUR

Funding agency Project Title Duration Amount

in INR

(lakhs)

11.. BBRRNNSS,, DDAAEE Structure elucidation of VC0395_300 protein from Vibrio cholerae (leading to an

alternate method of checking Cholera epidemics).

03/2011-

03/2014

22

22.. DDBBTT--NNEERR Physicochemical characterization of the Primary Sigma Factor of Vibrio cholerae.

01/2012-

01/2015

31.75

33.. DDSSTT--FFAASSTTTTRRAACCKK Studies on putative GGEEF/Sensory box domain of Vibrio cholerae.

07/2012-

07/2015

21.8

44.. RRIIGG,, BBIITTSS Expression and purification of GGEEF protein of Vibrio cholerae

11/2011-

11/2013

2

Total Ongoing

Projects,

Range and

Amount

FOUR 03/2011-

07/2015 77.55

ii. As co Investigator: ONE

UUGGCC FFuunnddeedd pprroojjeecctt ““Biochemical and genetic characterization of antimicrobial (candidacidal) peptides produced by the Antarctic strain Enterococcus faecalis APR 210” worth INR 7. 65 Lakhs.

DD.. AAwwaarrddss && FFeelllloowwsshhiippss..

((aa)) NNaattiioonnaall SScchhoollaarrsshhiipp ((22000000--22000011)) ffoorr GGrraadduuaattiioonn ssttuuddiieess,, bbyy MMiinniissttrryy ooff HHuummaann RReessoouurrccee DDeevveellooppmmeenntt,, GGoovvtt.. ooff IInnddiiaa..

((bb)) AAwwaarrddeedd CCSSIIRR JJuunniioorr RReesseeaarrcchh FFeelllloowwsshhiipp bbyy HHuummaann RReessoouurrccee DDeevveellooppmmeenntt GGrroouupp,, GGoovveerrnnmmeenntt ooff IInnddiiaa,, aafftteerr qquuaalliiffiiccaattiioonn ooff CCSSIIRR--NNEETT ffoorr JJRRFF aanndd eelliiggiibbiilliittyy ooff LLeeccttuurreesshhiipp ((DDeecceemmbbeerr 22000011))..

((cc)) AAwwaarrddeedd CCSSIIRR SSeenniioorr RReesseeaarrcchh FFeelllloowwsshhiipp bbyy HHuummaann RReessoouurrccee DDeevveellooppmmeenntt GGrroouupp,, GGoovveerrnnmmeenntt ooff IInnddiiaa ((22000044)).. ((dd)) SSeelleecctteedd ffoorr pprreessttiiggiioouuss CCCCPP44 CCrryyssttaallllooggrraapphhyy wwoorrkksshhoopp aatt IIIISScc,, BBaannggaalloorree mmeennttoorreedd bbyy PPrrooff.. EElleeaannoorr DDooddssoonn ((22000055)).. ((ee)) DDBBTT RReesseeaarrcchh AAssssoocciiaattee ((22000088)).. ((ff)) AAwwaarrddeedd YYoouunngg SScciieennttiisstt PPrroojjeecctt ffrroomm DDeepptt.. ooff SScciieennccee aanndd TTeecchhnnoollooggyy,, GGoovvtt.. ooff IInnddiiaa ((22001122)) ((gg)) BBeesstt PPoosstteerr AAwwaarrdd aatt 33rrdd WWoorrlldd CCoonnggrreessss ooff BBiiootteecchhnnoollooggyy,, 22001122..

((hh)) BBeesstt PPoosstteerr AAwwaarrdd aatt BBiiooffeesstt,, 22001122..

EE.. PPuubblliiccaattiioonnss dduurriinngg tthhee llaasstt 55 yyeeaarrss::

i. Journal Publications:

BBiisswwaass SS ,, GGuuhhaarrooyy MM,, CChhaakkrraabbaarrttii PP.. DDiisssseeccttiioonn,, rreessiidduuee ccoonnsseerrvvaattiioonn,, aanndd ssttrruuccttuurraall ccllaassssiiff iiccaattiioonn ooff pprrootteeiinn--DDNNAA iinntteerrffaacceess.. PPrrootteeiinnss 7744((33)),, 664433--665544 ((22000099)).. BBiisswwaass SS ,, GGuuhhaarrooyy MM,, CChhaakkrraabbaarrttii PP.. SSttrruuccttuurraall sseeggmmeennttss aanndd rreessiidduuee pprrooppeennssiittiieess iinn pprrootteeiinn--RRNNAA iinntteerrffaacceess:: CCoommppaarriissoonn wwiitthh pprrootteeiinn--pprrootteeiinn aanndd pprrootteeiinn--DDNNAA ccoommpplleexxeess.. BBiiooiinnffoorrmmaattiioonn 22((1100)),, 442222--442277 ((22000088)).. JJhhaa RR,, JJhhaa HHCC,, BBiisswwaass SS ,, MMiittttaall AA.. PPrreeddiiccttiioonn ooff tthhrreeee--ddiimmeennssiioonnaall ssttrruuccttuurree ooff CChhllaammyyddiiaa ttrraacchhoommaattiiss hheeaatt sshhoocckk pprrootteeiinn 6600:: AAnn iimmmmuunnooddoommiinnaanntt aannttiiggeenn.. TThhee IInntteerrnneett JJoouurrnnaall ooff GGeennoommiiccss aanndd PPrrootteeoommiiccss 44((22)),, ((22000099)) ..

DDeebbnnaatthh AA,, GGoommeess AA,, SSaahhaa AA,, BBiisswwaass SS ,, CChhaakkrraabbaarrttii PP,, GGiirrii BB,, BBiisswwaass AAKK,, DDaassgguuppttaa SS,, GGoommeess AA.. AA lleetthhaall ccaarrddiioottooxxiicc--ccyyttoottooxxiicc pprrootteeiinn ffrroomm tthhee IInnddiiaann mmoonnoocceellllaattee ccoobbrraa ((NNaajjaa kkaaoouutthhiiaa)) vveennoomm.. TTooxxiiccoonn.. 22001100 SSeepp 1155;;5566((44)) ::556699--7799..

SShhaarrmmaa SS,, BBiisswwaass SS .. SSeeqquueennccee ttrraaddeemmaarrkkss iinn oonnccooggeennee aassssoocciiaatteedd

mmiiccrrooRRNNAAss,, BBiiooiinnffoorrmmaattiioonn 66((99))::336644--55..((22001111))..

RRaassttooggii AA,, BBiisswwaass SS ,, SSaarrkkaarr AA,, CChhaakkrraabbaarrttyy DD.. AAnnttiiccooaagguullaanntt aaccttiivviittyy ooff MMoooonn jjeellllyyffiisshh ((AAuurreelliiaa aauurriittaa)) tteennttaaccllee eexxttrraacctt.. TTooxxiiccoonn.. 6600((55))::771199--772233.. ((22001122)) ..

MMaannjjuurr ii KK.. KKoolleeyy,, SSeesshhaaddrrii CC.. SSiivvaassuubbrraammaanniiaann,, SSuummiitt BBiisswwaass ,,

PPeerriiaakkaarruuppppaann TT.. MMaannoohhaarraann && AAddiittyyaa PP.. KKoolleeyy.. DDiiooxxyyggeenn bbiinnddiinngg aanndd aaccttiivvaattiioonn bbyy aa hhiigghhllyy rreeaaccttiivvee CCrr((IIII)) ccoommppoouunndd ccoonnttaaiinniinngg SS,,NN--ddoonnoorrss ddeerriivveedd ffrroomm ooaammiinnootthhiioopphheennooll,, JJoouurrnnaall ooff CCoooorrddiinnaattiioonn CChheemmiissttrryy,, 6655,, 33332299 -- 33335511 ((22001122))..

SSuubbhhaassiisshh SSaahhoooo aanndd SSuummiitt BBiisswwaass .. CCoommpplleettee ssccrreeeenniinngg ooff MMoorriinnggaa oolleeiiffeerraa

lleeaaff ffoorr tthheerraappeeuuttiicc aapppplliiccaattiioonnss.. JJoouurrnnaall ooff BBiiootteecchhnnoollggyy aanndd BBiioommaatteerriiaallss.. VVooll.. 22.. IIssssuuee 66.. ((22001122))..

BBaannddeekkaarr DDiivvyyaa RR,, DDhhiirreennddrraa SSiinngghh,, SSuummiitt BBiisswwaass.. GGGGDD((//EE))EEFF DDoommaaiinn::

AA UUbbiiqquuiittoouuss EEuubbaacctteerriiaall ddoommaaiinn ccoonnffeerrss ttooxxiicciittyy.. IInntteerrnnaattiioonnaall JJoouurrnnaall ooff BBiiootteecchhnnoollooggyy aanndd RReesseeaarrcchh.. VVooll.. 33,, IIssssuuee 11.. 7733--8800 ((22001133))..

RRaamm KK aanndd SSuummiitt BBiisswwaass.. SSeeaarrcchh ffoorr SSiiggnnaattuurreess iinn mmiiccrrooRRNNAAss AAssssoocciiaatteedd

wwiitthh CCaanncceerr.. BBiiooiinnffoorrmmaattiioonn.. VVooll.. 99.. IIssssuuee 1100 ((22001133))..

BBiisswwaass SS ,, CChhaakkrraabbaarrttii PP.. RReessiidduuee ccoonnsseerrvvaattiioonn aanndd sseeccoonnddaarryy ssttrruuccttuurraall ccllaassssiiffiiccaattiioonn aatt pprrootteeiinn--RRNNAA iinntteerrffaacceess.. PPLLOOSS CCoommpp BBiiooll((uunnddeerr ssuubbmmiissssiioonn))..

SSaahhoooo SS,, BBiisswwaass SS.. IIddeennttiiff iiccaattiioonn OOff AA PPrrootteeiinnaacceeoouuss CCoommppoonneenntt IInn TThhee

LLeeaaff OOff MMoorriinnggaa oollee iiffeerraa ,, LLaamm.. WWiitthh EEffffeeccttss OOnn HHiigghh SSeerruumm CCrreeaattiinniinnee.. II JJ PPhhaarrmm.. SSccii.. RReevviisseedd mmaannuussccrriipptt ssuubbmmiitttteedd..

RRaamm KK,, BBiisswwaass SS.. NNoovveell ssiiggnnaattuurreess iinn mmiiccrrooRRNNAAss aassssoocciiaatteedd wwiitthh ttuummoorr ssuupppprreessssoorrss.. BBiiooiinnffoorrmmaattiiccss.. UUnnddeerr rreevviieeww..

ii. Conference Publications:

Ram K, Sumit Sharma and Sumit Biswas. MICROON – A Tool for Identification and Validation of Oncomirs. Conference on Informatics & Integrative Biology CIIB-2011. 63 (2011)

Subhasish Sahoo and Sumit Biswas. Complete screening of Moringa oleifera leaf for

therapeutic applications. 3rd World Congress on Biotechnology. (2012)

Ram K and Sumit Biswas. Oncogenic signatures in microRNA. Biofest 2012. (2012)

Akriti Rastogi, Sumit Biswas, Angshuman Sarkar, Dibakar Chakrabarty.

Anticoagulant activity of Moon jellyfish (Aurelia aurita) tentacle extract. 17th World Congress of International Society on Toxinology, held at Honolulu, Hawai from 8th -13th July, 2012. Toxicon, Volume 60, Issue 2,133-134, August 2012.

FF.. SSoommee IInnvviitteedd ttaallkkss..

Invited talk at Dept.of Biotechnology, IIT Kharagpur on 10th-11th June, 2013, on "Signatures in microRNAs associated with cancer"

Invited talk at the Certificate Course in Global Health, organized by Albert Einstein College of Medicine and BITS, Hyderabad, on "The Cholera Enigma", 2nd July, 2013

Invited session talk at the First International and Third National Conference on Biotechnology, Bioinformatics and Bioengineering, organised by Society of Applied Biotechnology on 28th June, 2013 at Tirupati.

Invited as mentor for Young Scientist Research Awardees' Meet, Bhabha Atomic and Research Centre, Trombay, from November 26-28, 2012 as special invitee to mentor Young Scientists.

Invited talk on "Frontiers in Structural Biology: Innovations and Challenges" at Nagaland University, Dept. of Biotechnology, September 24, 2012.

Dissection of the protein-DNA interfaces. Indian Biophysical Society. 2006

The ambiguities in the double helix. DM Symposium on Golden Jubilee of the double helix. 2004

Research guidance AA..PPhhDD TThheessiiss uunnddeerr SSuuppeerrvviissiioonn..

RRaamm KKootthhaannddaann.. MICROON - A Tool for Identification and Validation of OncomiRs. In

Progress

BBaannddeekkaarr DDiivvyyaa RRaammeesshh.. Structural Studies on the VC0395_300 Protein from Vibrio

cholerae. In Progress

OOmm PPrraakkaasshh CChhaauuhhaann.. Physicochemical Studies on the Mutants of the VC0395_300

gene of Vibrio cholerae. In Progress

BB.. PPrroojjeecctt SScchhoollaarr -- DDBBTT--JJRRFF.. Poonam Sain. Physicochemical characterization of primary sigma factor of Vibrio

cholerae. In Progress

CC.. MMEE TThheessiiss SSuuppeerrvviisseedd..

Subhasish Sahoo. Purification and Identification of Therapeutic Components of Leaf

extract of Moringa oleifera. 2012.

DD.. MM..SScc.. TThheessiiss SSuuppeerrvviisseedd..

Abhijeet Gautam. Development of Human Behavior and Applications. 2012.

Amit Dhanda. Isolation of SeBox protein mutants from Vibrio cholerae. 2013.

EE.. MM..EE.. PPrroojjeeccttss..

SSoowwmmyyaa GGaannggaaddhhaarraann.. 22000099HH112299000022GG.. 22001100

SSuubbhhaassiisshh SSaahhoooo.. 22001100HH112299440088GG.. 22001100..

SSuubbhhaassiisshh SSaahhoooo.. 22001100HH112299440088GG.. 22001111

TTaannvvii PPaarreekkaarr.. 22001111HH112299000088GG.. 22001111

MMaallvviikkaa SSuuddhhaakkaarr.. 22001122HH112299000077GG.. 22001122--1133

MMaallvviikkaa SSuuddhhaakkaarr.. 22001122HH112299000077GG.. 22001133--1144

FF.. FFiirrsstt DDeeggrreeee PPrroojjeeccttss ((MM..SScc..//BB..TTeecchh PPrroojjeeccttss))..

11.. ““DDEEPPLLOOYYMMEENNTT OOFF YYEEAASSTT AANNDD DDRROOSSOOPPHHIILLAA GGEENNOOMMEE

DDAATTAABBAASSEESS IINN TTHHEE LLOOCCAALL NNEETTWWOORRKK”” BByy SSHHAARRAATT CCHHAANNDDRRAA

RRAACCHHAA 22000066AA77PPSS111133GG AApprriill 22001100

22.. ““IINNTTEERRNNAALL MMIIRRRROORR SSEERRVVEERR FFOORR PPRROOTTIIEENN DDAATTAA BBAANNKK AANNDD

PPRROODDOOMM”” BByy MMoohhaann VVaarrmmaa GGoottttuummuukkkkaallaa 22000066AA77PPSS002222GG AApprriill

22001100

33.. ““FFAASSTT IINNTTRRAANNEETT AACCCCEESSSS TTOO HHUUMMAANN GGEENNOOMMEE PPRROOJJEECCTT”” BByy

SS..NN..VVeennkkaatt KKaanntthhaa RRaaoo 22000066AA77PPSS111199GG AApprriill 22001100

44.. ““EEXXPPRREESSSSIIOONN,, PPUURRIIFFIICCAATTIIOONN AANNDD CCHHAARRAACCTTEERRIIZZAATTIIOONN OOFF VViibbrriioo

cchhoolleerraaee DDUUFF11 DDOOMMAAIINN PPRROOTTEEIINNSS”” bbyy PPAANNKKAAJJ SS.. VVAAIIDDYYAA

22000077BB11AA44445544GG 2288//44//22001100

55.. ““MMuuttaaggeenneessiiss ooff VViibbrriioo cchhoolleerraaee DDUUFF11 DDoommaaiinn PPrrootteeiinn”” BByy,, AAKKSSHHAAYY

WWAALLIIAA 22000077BB11AA77552266 2288//44//22001100

66.. ““AAnn IInnssiigghhtt iinnttoo tthhee SSttrruuccttuurraall FFeeaattuurreess ooff HHyyppeerrtthheerrmmoopphhiilliicc

PPrrootteeiinnss”” BByy PPUULLKKIITT BBUUDDHHIIRRAAJJAA 22000077BB11AA77447755GG.. AApprriill 22001100

77.. ““SSEEQQUUEENNCCEE CCOONNSSEERRVVAATTIIOONN VVIISS--ÀÀ--VVIISS DDOOMMAAIINN CCOONNSSEERRVVAATTOO IINN

FFAABB HHEEAAVVYY CCHHAAIINNSS OOFF IIggGG”” BByy NNeeeerraajjaa..MM..RR 22000088BB11AA55882222 JJuullyy 22001100

88.. ““SSTTUUDDYY OOFF MMIICCRROO--RRNNAAss AANNDD IITTSS RREELLAATTIIOONN WWIITTHH

OONNCCOOGGEENNEESSIISS”” bbyy SSuummiitt SShhaarrmmaa 22000088AA77PPSS111144GG 1199//1111//22001100

99.. ““DDIISSSSEECCTTIIOONN OOFF TTHHEE IINNTTEERRFFAACCEE OOFF HHYYPPEERRTTHHEERRMMOOPPHHIILLEE

PPRROOTTEEIINNSS –– AANN IINNTTRRIICCAATTEE SSTTUUDDYY”” .. BByy PPUULLKKIITT BBUUDDHHIIRRAAJJAA

22000077BB11AA77447755GG.. NNoovv.. 22001100..

1100.. ““SSTTUUDDIIEESS OOFF TTHHEE FFLLEEXXIIBBLLEE RREEGGIIOONNSS OOFF AAMMIINNOOAACCYYLL TTRRNNAA

SSYYNNTTHHEETTAASSEESS”” BBYY HHAARRIISSHH NNAARRAAYYAANNAAMM 22000077BB11AA11550077GG.. NNoovv.. 22001100

1111.. ““DDIISSTTOORRTTIIOONN IINN NNUUCCLLEEIICC AACCIIDD SSTTRRUUCCTTUURREE VVIISS--ÀÀ--VVIISS PPRROOTTEEIINN

BBIINNDDIINNGG TTOO SSTTUUDDYY AANNDD AANNAALLYYSSEE TTHHEE IINNTTEERRFFAACCEE RREEGGIIOONN OOFF

DDNNAA BBIINNDDIINNGG PPRROOTTEEIINN SSUUBBUUNNIITTSS AAFFTTEERR IITT BBIINNDDSS TTOO DDNNAA..””

YYEESSHHWWAANNTTHH..TT 22000077BB11AA33550044GG.. NNoovv.. 22001100

1122.. ““CClloonniinngg aanndd oovveerreexxpprreessssiioonn ooff vviirruulleenntt ggeennee ffrroomm VViibbrriioo cchhoolleerraaee”” ..

AAnnkkiittaa PPaall.. 22000088BB11AA33668899GG

1133.. ““SSmmaarrtt IIddeennttiiffiiccaattiioonn CCaarrdd ffoorr BBIITTSS,, PPiillaannii GGooaa CCaammppuuss””.. BByy SSaarrtthhaakk

PPaall.. 22000088AA88PPSS333300GG

1144.. ““TToo SSttuuddyy TThhee TTooppooggrraapphhyy ooff EExxttrreemmoopphhiilliicc PPrrootteeiinnss uussiinngg CCAASSTTPP

SSeerrvveerr”” bbyy SSHHAARRMMAA SSUUPPRRIIYYAA VVIIJJAAYY 22000088BB11PPSS668833GG.. NNoovv.. 22001100..

1155.. ““SSTTRRUUCCTTUURRAALL AANNDD FFUUNNCCTTIIOONNAALL AANNAALLYYSSIISS OOFF AANNIIMMAALL

TTOOXXIINNSS”” .. BByy RRAAGGHHAAVVAANN RRAAJJAASSHHEEKKAARRAANN .. 22000088BB11AA33770044GG.. AApprriill

22001111..

1166.. ““CCOOMMPPAARRAATTIIVVEE SSTTUUDDYY OOFF BBIIOOIINNFFOORRMMAATTIICCSS TTOOOOLLSS FFOORR TTHHEE

DDEETTEECCTTIIOONN OOFF CCAANNCCEERR””.. BByy SSHHAARRMMAA SSUUPPRRIIYYAA VVIIJJAAYY

22000088BB11PPSS668833GG.. AApprriill 22001111..

1177.. ““DDIISSSSEECCTTIIOONN OOFF SSTTRRUUCCTTUURRAALL FFEEAATTUURREESS OOFF EEXXTTRREEMMOOPPHHIILLIICC

PPRROOTTEEIINNSS”” BBYY AAppoooorrvvaa VVeerrlleekkaarr 22000099AA77PPSS111155GG NNoovv.. 22001111..

1188.. ““MMuuttaaggeenneessiiss ooff WWiilldd TTyyppee VV.. cchhoolleerraaee GGGGEEEEFF pprrootteeiinn”” .. BByy SSuuddeeeepp

GGuuppttaa .. 22000099BB11AA33666633GG.. NNoovv.. 22001111..

1199.. ““SSPPEECCIIFFIICCIITTYY OOFF BBIINNDDIINNGG IINN PPHHAAGGEE--HHOOSSTT IINNTTEERRAACCTTIIOONNSS”” BByy

NNaannddkkiisshhoorree PPrraakkaasshh 22000088BB11AA77226622GG.. AApprriill 22001122..

2200.. ““DDEESSIIGGNN OOFF TTHHEE MMIICCRROOOONN GGUUII””.. BByy CCHHIIRRAAYYUU GGAARRGG

22000099BB11AA77558899GG.. AApprriill 22001122..

2211.. ““IIMMPPRROOVVIINNGG TTHHEE EEFFFFEECCTTIIVVEENNEESSSS OOFF SSCCIINNTTIILLLLAATTIIOONN

CCOOUUNNTTEERRSS”” ,, BByy NNeehhaa AAggggaarrwwaall 22000099BB11AA88335577GG.. NNoovv.. 22001122..

2222.. SSppeecciiffiiccaattiioonn ooff pprrootteeiinn lliiggaanndd iinntteerraaccttiioonn iinn hhyyppeerrtthheerrmmoopphhiilliicc

pprrootteeiinnss BBYY CCHHIIRRAAYYUU GGAARRGG 22000099BB11AA77558899GG 2255//44//22001133 Teaching and pedagogy

AA..CCoouurrsseess TTaauugghhtt iinn BBIITTSS..

ME Courses: • MMoolleeccuullaarr MMeecchhaanniissmm OOff GGeennee EExxpprreessssiioonn ((BBIIOO GG551122))

•• PPrrootteeiinn AAnndd EEnnzzyymmee BBiiooeennggiinneeeerriinngg ((BBIIOO GG665511))

•• AAddvvaanncceedd CCeellll AAnndd MMoolleeccuullaarr BBiioollooggyy ((BBIIOO GG554422))

EExxppeerriimmeennttaall TTeecchhnniiqquueess ((BBIIOO GG664422))

MM..SScc.. CCoouurrsseess::

BBiioopphhyyssiiccss ((BBIIOO CC333311))

GGeenneettiiccss ((BBIIOO CC333322))

MMoolleeccuullaarr BBiioollooggyy OOff TThhee CCeellll ((BBIIOO CC441133))

GGeenneettiicc EEnnggiinneeeerriinngg TTeecchhnnoollooggyy ((BBIIOO CC441188))

IInntteeggrraatteedd BBiioollooggyy ((BBIIOO FF221144))

IInnssttrruummeennttaattiioonn MMeetthhooddss AAnndd AAnnaallyyssiiss ((BBIIOO CC339911 AAnndd BBIIOO FF224444))

BBiioollooggyy PPrroojjeecctt LLaabboorraattoorryy ((BBIIOO CC223311))

GGeenneerraall BBiioollooggyy ((BBIIOO CC111111))

PPrroojjeecctt CCoouurrsseess::

HHiigghheerr DDeeggrreeee TThheessiiss ((FFoorr MMEE)) ((BBIITTSS GG662299TT))

FFiirrsstt DDeeggrreeee TThheessiiss ((FFoorr MMSScc)) ((BBIITTSS CC442211TT))

RReesseeaarrcchh PPrraaccttiiccee ((FFoorr MMEE)) ((BBIITTSS GG554400))

PPrrooffeessssiioonnaall PPrraaccttiiccee II ((BBIITTSS GG662200))

PPrrooffeessssiioonnaall PPrraaccttiiccee IIii ((BBIITTSS GG662211))

CCoommppuutteerr PPrroojjeeccttss ((BBIITTSS CC333311 AAnndd BBIITTSS CC333355))

LLaabb OOrriieenntteedd PPrroojjeeccttss ((BBIITTSS CC331133 AAnndd BBIITTSS CC331144))

SSttuuddyy OOrriieenntteedd PPrroojjeeccttss ((BBIITTSS CC332233 AAnndd BBIITTSS CC332244))

SSppeecciiaall PPrroojjeeccttss ((BBIIOO CC449911))

PPrraaccttiiccee SScchhooooll::

•• MMeennttoorr FFoorr PPrraaccttiiccee SScchhooooll IIII AAtt LLuuppiinn LLttdd..,, GGooaa

PPrree--PPhh..DD.. ccoouurrsseess::

IInnssttrruuccttoorr ffoorr sseevveerraall pprree--PPhhDD ccoouurrsseess ttaakkeenn aass ccoouurrssee wwoorrkk..

BB..CCoouurrsseess TTaauugghhtt iinn BBiiddhhaannnnaaggaarr CCoolllleeggee..

EEvvoolluuttiioonnaarryy BBiioollooggyy aanndd TTaaxxoonnoommyy,, aass ppaarrtt ooff BB..SScc.. ZZoooollooggyy HHoonnss.. AAnndd MM..SScc..

ZZoooollooggyy

VViirroollooggyy aanndd MMoolleeccuullaarr BBiioollooggyy ttoo MM..SScc.. MMiiccrroobbiioollooggyy ssttuuddeennttss..

CC.. YYeeaarr--wwiissee aanndd sseemmeesstteerr wwiissee bbrreeaakkuupp ooff tteeaacchhiinngg eexxppeerriieennccee..

YYeeaarr SSeemmeesstteerr II SSeemmeesstteerr IIII

22000022--0033 EEvvoolluuttiioonnaarryy BBiioollooggyy TTaaxxoonnoommyy

22000044--0055 VViirroollooggyy MMoolleeccuullaarr BBiioollooggyy

22000055--0066 VViirroollooggyy MMoolleeccuullaarr BBiioollooggyy

22000066--0077 VViirroollooggyy ------------------------------------------------------

22000099--1100 BBIIOO CC333311((IICC));; BBIIOO CC111111 BBIIOO CC339911;; BBIIOO CC111111;; BBIIOO CC223311

22001100--1111 BBIIOO GG554422;;BBIIOO CC333311((IICC));; BBIIOO CC111111

BBIIOO CC441133 ((IICC));; BBIIOO CC223311 ((IICC));; BBIIOO CC339911;;

BBIIOO CC111111

22001111--1122 BBIIOO GG554422;; BBIIOO CC333311((IICC));; BBIIOO CC441188 BBIIOO GG665511 ((IICC));; BBIIOO CC333322 ((IICC));; BBIIOO CC339911 ;;

BBIITTSS CC442211TT

22001122--1133 BBIIOO GG551122 ((IICC));; BBIIOO CC333311((IICC));;

BBIIOO FF221144 ((IICC));; BBIITTSS GG662299TT BBIIOO GG665511 ((IICC));; BBIIOO CC339911;; BBIIOO FF224444;;

BBIITTSS CC442211TT

22001133--1144 BBIIOO GG551122 ((IICC));; BBIIOO FF221144 ((IICC));;

BBIIOO GG664422 ----------------------------------------------------------------------------------

$$BBeessiiddeess,, eeaacchh sseemmeesstteerr ffrroomm 22000099--1100 22nndd sseemm hhaass sseeeenn aa nnuummbbeerr ooff pprroojjeecctt bbaasseedd ccoouurrsseess bbeeiinngg

ssuuppeerrvviisseedd uunnddeerr mmee..

Administrative/Institutional Contributions

AA.. CCoonnttrriibbuuttiioonn ttoo tthhee IInnssttiittuuttee..

11.. DDeevveellooppmmeenntt ooff PPrrootteeoommiiccss llaabboorraattoorryy aanndd ccrryyssttaallllooggrraapphhyy sseettuupp ((ffiirrsstt ooff iittss kkiinndd iinn GGooaa)) wwiitthh oowwnn ffuunnddss.. 22.. CCoooorrddiinnaattoorr ffoorr BBIITTSSAATT qquueessttiioonnss ffrroomm BBiioollooggyy DDeepptt.. 33.. IInnvvoollvveedd iinn tthhee ddeessiiggnniinngg ooff nneeww ccoouurrssee ssttrruuccttuurreess ooff BBiioopphhyyssiiccss,, GGeenneettiiccss aanndd

IInntteeggrraatteedd BBiioollooggyy.. 44.. GGuuiiddiinngg aass PPrraaccttiiccee SScchhooooll IIII ffaaccuullttyy mmeennttoorr ffrroomm 22001111--1122,, aatt LLuuppiinn LLttdd.. GGooaa.. 55.. SSeeccrreettaarryy ooff BBIITTSS FFoooottbbaallll CClluubb,, wwhhiicchh aaddvvaanncceedd ffrroomm 33rrdd ttoo 22nndd ddiivv.. ooff GGFFAA lleeaagguuee.. BB.. PPrrooffeessssiioonnaall CCoonnttrriibbuuttiioonnss..

11.. HHoosstteedd aass OOrrggaanniizziinngg SSeeccrreettaarryy aanndd IInnssttrruuccttoorr ((mmaajjoorr rreessoouurrccee ppeerrssoonn)) tthhee nnaattiioonnaall--lleevveell ‘‘FFrroomm RRNNAA ttoo PPrrootteeiinn:: AA CCoommpprreehheennssiivvee WWoorrkksshhoopp’’ ffrroomm 33rrdd ttoo 99tthh JJuunnee.. IInnvvoollvveedd iinn ppllaannnniinngg,, PPRROOCCUURRIINNGG FFUUNNDDSS TTOOTTAALLIINNGG RRSS.. 55..4455 LLAAKKHHSS FFRROOMM GGOOAA SSCCIIEENNCCEE,, TTEECCHHNNOOLLOOGGYY && EENNVVIIRROONNMMEENNTT,, BBRRNNSS,, eettcc.. 22.. QQuueessttiioonn sseetttteerr ffoorr DDeepptt.. ooff BBiiootteecchhnnoollooggyy,, GGoovvtt.. ooff IInnddiiaa.. 33.. RReevviieewweerr ooff pprroojjeeccttss ffrroomm ffuunnddiinngg aaggeenncciieess ((nnaammeess wwiitthhhheelldd)).. 44.. RReevviieewweerr ooff rreeppuutteedd jjoouurrnnaallss ffrroomm OOxxffoorrdd UUnniivveerrssiittyy PPrreessss,, EEllsseevviieerr,, eettcc.. CC.. MMeemmbbeerrsshhiipp ooff PPrrooffeessssiioonnaall BBooddiieess..

11.. LLiiffee MMeemmbbeerr ooff IInnddiiaann CCrryyssttaallllooggrraapphhiicc AAssssoocciiaattiioonn.. 22.. PPaarrttiicciippaattiinngg mmeemmbbeerr ooff GGlloobbaall NNeettwwoorrkk ooff CChhoolleerraa aanndd ootthheerr DDiiaarrrrhhooeeaall IInnffeeccttiioonnss,, aa WWHHOO iinniittiiaattiivvee..