CURRICULUM VITAE

Sébastien Barot Institut d’Ecologie et des Sciences de l’Environnement-Paris 46 Rue d’Ulm 75230 Paris Cedex 05 France Tél : (33) 1 44 32 37 03 E-mail : sébastien.barot@ird.fr Né le 11 Mars 1970 à Djerba (Tunisie) Marié, un enfant

Site web personnel : http://millsonia.free.fr/

Profile google scholar : http://scholar.google.fr/citations?user=a0RTlo8AAAAJ&hl=fr

Profile sur web of science : http://www.researcherid.com/rid/A-8447-2012

1 Formation et parcours professionnel .................................................................................... 2 2 Stages et experiences professionnelles ................................................................................. 2 3 Expériences de recherche .................................................................................................... 3 4 Langues .............................................................................................................................. 4 5 Statistiques, informatique, modélisation............................................................................... 4 6 Enseignement ...................................................................................................................... 4 7 Encadrement de stages et de thèses ..................................................................................... 5 8 Encadrement de post-doctotants ......................................................................................... 8 9 Jurys ................................................................................................................................... 8 10 Comités de thèse ............................................................................................................... 9 11 Articles ............................................................................................................................. 9 12 Bibliométrie .....................................................................................................................14 13 Chapîtres de livre .............................................................................................................15 14 Evaluation d'articles pour des revues scientifiques internationales, Edition ........................16 15 Congrès, séminaires et ateliers ..........................................................................................17 16 Organisation de congrès, atelier, école d’été .....................................................................21 17 Vulgarisation ...................................................................................................................22 18 Responsabilités au sein d’un laboratoire ...........................................................................23 19 Evaluations, commissions de recrutement .........................................................................23 20 Expertise ..........................................................................................................................24 21 Programmes de recherches financés sur appel d’offre .......................................................24 22 Vie associative .................................................................................................................26

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1 FORMATION ET PARCOURS PROFESSIONNEL

1988 Baccalauréat C, Mathématiques et Sciences Physiques, au lycée François 1er au Havre (76)

1988-1991 Classe préparatoire Mathématique supérieure et spéciale Biologie au lycée Corneille à Rouen (76)

1991 Admission à la Formation des Ingénieurs Forestiers de l'Ecole Nationale du Génie Rural des Eaux et des Forêts à Nancy

1991-1993 Formation des Ingénieurs Forestiers

1993-1994 Troisième année de la FIF-ENGREF et DEA d'Ecologie Générale (Paris XI, Paris VI, INA-PG, et ENS). Stage de DEA de 6 mois au laboratoire "Fonctionnement et Evolution des Systèmes Ecologiques" dont deux mois sur le terrain en Côte d'Ivoire à la station d'Ecologie de Lamto. Sujet : Stratégie de nutrition du Palmier Rônier en relation avec l'hétérogénéité de l'écosystème savane

1994-1996 Service militaire

1996-1999 Thèse sous la direction de J.-C. Menaut et J. Gignoux au laboratoire "Fonctionnement et évolution des systèmes écologiques" (UMR 7625, Paris VI, Ecole Normale Supérieure). Sujet : Interactions entre la dynamique d’une population végétale, la répartition de ses individus et l’hétérogénéité de l’écosystème. Cas du Palmier Rônier dans une savane humide

2002 Embauche à l’IRD comme CR2. Affectation au Laboratoire d’Ecologie des Sols Tropicaux à Bondy

2007 Passage de l’habilitation à diriger des recherches

2008 Promotion CR1

2009 Janvier, Affectation au laboratoire Bioemco dans l’équipe « Biodiversité» (Ecole Normale Supérieure, Paris)

2011 Octobre, Admis au grade de DR2

2 STAGES ET EXPERIENCES PROFESSIONNELLES

1986 - 1987 Stage d'archéologie préhistorique durant l'été

1991-1993 Inventaires forestiers dans le cadre de la junior entreprise de la FIF-ENGREF

3

1992 Stage de deux semaines durant l'été au Service Régional de la Forêt et du Bois de Franche Comté

1999 Participation à la réalisation d'un CD-ROM sur les plantes médicinales (conception d'une clef de détermination)

3 EXPERIENCES DE RECHERCHE

1992 - Relevés de terrains (topographie, pédologie, flore) effectués dans les Vosges du Sud en vue d'une typologie des stations forestières.

- Traitement statistique des relevés précédemment cités et rédaction d'un pré-catalogue de station sous la direction de J. C. Rameau du Laboratoire d'Ecologie Végétale de l'ENGREF-Nancy.

1992-1993 - Coréalisation d'un logiciel de diagnostic stationnel (détermination du niveau hydrique et trophique) à partir de relevés floristiques en utilisant les données de la Flore Forestière Française.

- Stage d'un mois au laboratoire du professeur P. J. Jarvis à l'Université d'Edimbourg: étude de l'effet du doublement du taux de CO2 sur l'Epicéa de Sitka.

1993-1999 4 périodes de travail de terrain d'environ 2 mois à la station d'Ecologie de Lamto en Côte d'Ivoire (DEA et Thèse).

Collaboration avec Sonia Yakovlev du laboratoire "Ecologie, Systématique et Evolution" de l'Université d'Orsay (UMR 6124): étude du déterminisme du sexe chez le palmier Rônier en utilisant des méthodes de cytogénétique.

Eté 2000 Séjour postdoctoral de 2 mois au Centre for Population Biology de l’Imperial College (Londres). Travail de modélisation pour tester les conséquences démographiques de la diécie (existence de sexes séparés chez les plantes).

2000-2002 Contrat post-doctoral à l’International Institute for Applied Systems Analysis (Vienne, Autriche) dans le cadre du programme européen ModLife (Ulf Dieckmann). Etude de la démographie et de l’évolution du cycle de vie de la morue dans l’Atlantique Nord. Analyse de données pour distinguer les effets environnementaux de la rétroaction liée à la réponse évolutive induite par la surexploitation par la pêche.

2002 Affectation au Laboratoire d’Ecologie des Sols Tropicaux à Bondy

2009 Affectation au laboratoire Bioemco dans l’équipe « Biodiversité» (Ecole Normale Supérieure, Paris)

4

4 LANGUES

Anglais Très bonne connaissance pratique et théorique

"First Certificate" de l'Université de Cambridge, mention B

Allemand Pratique courante, lue, écrite et parlée

Espagnol Pratique courante, lue, écrite et parlée

Portugais Bases parlées et lues

5 STATISTIQUES, INFORMATIQUE, MODELISATION

Très bonne connaissance de SAS (analyse de données, graphiques, programmation de procédures statistiques complexes).

Logiciel R, bases

Programmation en Turbo Pascal, sous SAS et sous R

Mathematica : calcul numérique et algébrique

Statistique : Modèles linéaires généralisés, ré-échantillonnage, statistiques spatiales

Modélisation : Modèles matriciels, modèles de simulation individu-centrés, modèles analytiques, systèmes dynamiques, automates cellulaires, dynamique adaptative

6 ENSEIGNEMENT

1997-2000 Soutien scolaire bénévole en primaire et collège: mathématiques, français, anglais, biologie, physique-chimie

1999-2000 3 heures de cours annuelles dans le master d'Ecologie générale (Paris VI, Paris XI)

1999-2000 Demi poste d'ATER en biostatistiques à l'Université Paris VII : travaux dirigés en Licence de génétique et en DEUG de Biologie

Mai 2002 Participation en tant qu’enseignant à une Ecole Thématique en Ecologie Tropicale, Dynamique de la biodiversité et des populations : vers de nouveaux outils pour gestion durable des ressources vivantes, Lamto (Côte d’Ivoire), 1 semaine, cours de modélisation et statistiques, encadrement de petits projets de terrain

5

Juin 2003 Participation à l’encadrement d’un stage pour 10 étudiants de maîtrise brésilien de l’UFRA. Ce stage comprenait à la fois le travail de terrain puis l’analyse statistique des données récoltées

A partir de 2003, chaque année, participation à plusieurs modules de deuxième année du Master d’Ecologie de Paris VI, environ 15 h annuelles : spécialité Ecologie, Biodiversité et Evolution : modules ‘‘Ecologie des sols’’ et ‘‘Ecosystèmes tropicaux’’; parcours Biosphère Continentale : modules ‘‘Ecologie des milieux continentaux : plantes et écosystèmes’’ et ‘‘Outils et méthodes dans l’étude de la biosphère continentale’’

Septembre 2005 Participation en tant qu’enseignant à une Ecole Thématique en Ecologie Tropicale, Services écosystémiques et usage durable des ressources naturelles, Bobo Dioulasso (Burkina Faso), 2 semaines, cours de modélisation et statistiques, encadrement de petits projets de terrain

Septembre 2006 Participation en tant qu’enseignant à une Ecole Thématique en Ecologie Tropicale, Réseaux trophiques : de la théorie à la gestion durable des ressources biologiques –écosystèmes terrestres et aquatiques, Mbour (Sénégal), 2 semaines, cours et TP de statistiques, encadrement de petits projets de terrain

A partir de la rentrée 2007, reprise d’une partie des cours donnés à l’UPMC par le professeur Patrick Lavelle en écologie des sol et écologie des écosystèmes:

L3 module d’écologie des écosystèmes (LV 335) ;

M1, module d’écologie des sols (master EBE, SOLT),

M1, module d’écologie des écosystèmes (master EBE, MU 206),

M2, module d’écologie des sols (master EBE, ESOL)

En tout, environ 50 heures de cours par an

Novembre 2007 Participation en tant qu’enseignant à une Ecole Thématique en Ecologie Tropicale, Madagascar, biodiversité des milieux insulaires, Morondava (Madagascar), 1 semaine, cours et TP de statistiques

A partir de 2009, 12 h de cours et 7 h de TD chaque année dans le module LV373, L3 de Biologie, à l’UPMC

Juin-Juillet Participation en tant qu'enseignant et organisateur à une école d’été à Dakar, Microtrop 2012 : intensification des interactions microbiennes pour la gestion durable des sols.

7 ENCADREMENT DE STAGES ET DE THESES

4 TIPE (travaux pratiques en classe préparatoire)

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4 stages de M1

13 stages de M2

2003-2004 Alexis Ugolini : Modélisation de l’effet des vers de terre sur le cycle de l’azote

2004-2005 Anna-Maria Llorens : Stratégie de reproduction du palmier Rônier

2004-2005 Kam-Rigne Laossi : Relation sol-faune du sol-biodiversité végétale

2005-2006 Simon Boudsoq : Modélisation de l’effet de l’inhibition de la nitrification sur la production primaire

2008-2009 Tiphaine Le Mao : Acquisition et recyclage des nutriments: perspectives spatiales, écologiques et évolutives. Coencadrement avec N. Loeuille

2009-2010 Vincent Tardy : Effet de la disponibilité de l’azote, du phosphore et des herbivores sur fonctionnement microbiologique du sol dans une savane zimbabwéenne. Coencadrement avec J.-C. Lata

2009-2010 Justine Vincent : Comment augmenter les services écosystémiques fournis par les espaces verts de la Cité Internationale Universitaire de Paris ? Coencadrement avec J.-C. Lata

2009-2010 Mathieu Perroux : Description des sols des espaces verts de la Cité Internationale de Paris et possibilités d’amélioration de leur gestion

2010-2011 Henri de Parseval : Effet de la concentration spatiale des ressources sur les cycles des nutriments dans les écosystèmes. Coencadrement avec J. Gignoux et X. Raynaud

2011-2012 Anne-Sophie Lafuite: Effet du recyclage des nutriments et du réseau trophique détritivore sur le fonctionnement des réseaux trophiques. Coencadrement avec E. Thébault

2012-2013 Kejun Zu : Interactions entre réseaux trophiques vert et brun et modélisation de la boucle microbienne. Coencadredment avec E. Thébault

2013-2014 Victor Cardenas Ortega : Etude des fractions organo-minérales de sols d’une chronoséquence parisienne de plantation de TiIia tomentosa. Encadrant principal : A. Rankovic, coencadrement avec Pierre Barré

2013-2014 Quentin Guignard : Cycle de l’azote en milieu urbain : Étude comparée de plantations parisiennes fixatrices et non fixatrices. Encadrant principal : A. Rankovic

1 stage de DESS (M2 pro)

2005-2004 Rahantaharimanana Fanjavola : Dégradation des pâturages en Amazonie Brésilienne: déterminants écologiques, agronomiques et socio-économiques: essai de synthèse bibliographique

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3 stages ERASMUS

2004-2005 Maria Martin : Microcosmes : effet du traitement initial des sols sur les communautés microbiennes et invertébrées

2006-2007 Abraham Bartolome Lasa : Effet des vers de terre sur les communautés de plantes

2009-2010 Elisa Turco : Effet de la disponibilité de l’azote, du phosphore et des herbivores sur la croissance et les défenses des acacias dans une savane zimbabwéenne

11 Co-encadrements et encadrements de thèse

2005-2009 Ignace Kouassi Kouadio (Ivoirien): Démographie de Deux espèces de palmier rotin dans une forêt de Côté d’Ivoire, bourse du DSF de l’IRD

2006-2009 Diana Noguera (Colombienne): Apports de charbon de bois au sol et vers de terre : effet sur la croissance des plantes et interactions, bourse du DSF de l’IRD

2006-2009 Simon Boudsocq : Evolution des activités des ingénieurs des écosystèmes influençant l’efficacité du recyclage des nutriments

2005-2009 Kam-Rigne Laossi (Tchadien): Effet des vers de terre sur les plantes : du fonctionnement individuel à la structure des communautés végétales

2009-2011 Séraphine Grellier : Invasion ligneuse par l’Acacia sieberiana dans un pâturage raviné du KwaZulu-Natal (Afrique du Sud). Coencadrement multiple

2010-2013 Charlène Heiniger : Règles de structuration des assemblages locaux d'espèces: le modèle collembole. Coencadrement avec F. Dubs (Directrice)

2010-2013 Lambiénou Yé (Burkinabé): Stratégies des Graminées pour le recyclage des nutriments et herbivorie. Coencadrement avec Hassan Nacro et Dominique Masse, bourse du DSF de l’IRD

2010-2013 Nazia Perveen (Pakistanaise): Modélisation du priming effect et du couplage plante-décomposeurs-matière organique du sol. Coencadrement avec S. Fontaine (Directeur)

2011-2014 Henri de Parseval : Modélisation des effets de la concentration spatiale des racines sur le recyclage des nutriments et la croissance des plantes. Coencadrement avec J. Gignoux (Directeur) et X. Raynaud

2009-2013 Aleksandar Rankovic : Cycle de l''azote et du carbone dans le sol des arbres d'alignement en milieu urbain. Coencadrement avec L. Abbadie (Directeur) et J.-C. Lata

2013-2016 Kejun Zou : Modélisation des interactions entre réseau trophique et recyclage des nutriments. Coencadrement avec E. Thébault

8

8 ENCADREMENT DE POST-DOCTOTANTS

2010-2011 Ignace Kouassi Kouadio : Modélisation de la démographie de deux espèces de palmier rotin de Côté d’Ivoire, bourse de la mairie de paris

2014-2015 Ignace Kouassi Kouadio, 12 mois sur 2 ans, formation à la modélisation, programmation de modèle de simulation, bourse BEST de l’AIRD

9 JURYS (THESE, HDR)

Examinateur dans un jury de thèse

2007 Natalia Norden, Université Paul Sabatier, Toulouse

2010 Sébastien Scotto di Vettimo, Muséum d’Histoire Naturelle, Paris

2011 Florence Palla, Université Paris VI, Paris

Rapporteur dans un jury de thèse

2010 Arnaud Pocheville, Université Paris VII, Paris

2011 Usman Irshad, SupAgro, Montpellier

2012 Tanvir Shahzad, Université Paris VI, Paris

2012 Elodie Betencourt, SupAgro, Montpellier

2012 Grabriel Pérez, Université de Rouen

2013 Ezequiel Zamora-Ledezma, Université Montpellier 2

Examinateur dans un jury de HDR

2009 Jean-Christophe Lata, Paris VI

Rapporteur dans un jury d’HDR

2007 Claude Lattaud, Paris VII

Présidence de jury de M2

2012-2013 Ecologie, Biodiversité et Evolution, Paris

9

10 COMITES DE THESE

2008-2010 Tatiana de Oliveira, Laboratoire EGC, direction de thèse: Michel Bertrand et Jean Roger-Estraded

2008-2010 Jean-Paul Maalouf, Laboratoire BioGeco, directeur de thèse : R. Michalet

2008-2010 Brigite N’Dri, Laboratoire Bioecmo-université d’Abobo Adjamé, Direction de thèse : Souleyman Konaté et Jacques Gignoux

2009-2011 Ruben Puga Freitas, Laboratoire Bioemco, directeur de thèse : M. Blouin

2009-2012 Grégory Mollot, CIRAD-Persyst UPR 26, directrice de thèse : Françoise Lescourret

2011-2013 Cynthia Gidoin, CIRAD UR31 / UMR System, directrice de thèse : Marie-Ange Ngo Bieng

2011-2014 Cristophe Naisse, Bioemco, directrice de thèse : Cornelia Rumpel

2011-2014 Dutreuil, Institut d'Histoire et de Philosophie des Sciences et des Techniques, directeur de thèse : Philipe Huneman

2012-2015 Nianxun Xi, INRA Clermont-Ferrand, Directrice de thèse : Juliette Bloor

2013-2016 Christophe Lecarpentier, INRA Le Moulon, Directeur de thèse : Jérôme Enjalbert

11 ARTICLES

1 Mordelet, P., S. Barot, and L. Abbadie. 1996. Root foraging strategies and soil patchiness in a humid savanna. Plant Soil 182:171-176.

2 Barot, S., and J. Gignoux. 1999. Population structure and life cycle of Borassus aethiopum Mart.: evidence of senescence in a palm tree. Biotropica 31:439-448.

3 Barot, S., J. Gignoux, and J.-C. Menaut. 1999a. Demography of a savanna palm tree: predictions from comprehensive spatial pattern analyses. Ecology 80:1987-2005.

4 Barot, S., J. Gignoux, and J.-C. Menaut. 1999b. Seed shadows, survival and recruitment: how simple mechanisms lead to dynamics of population recruitment curves. Oikos 86:320-330.

10

5 Gignoux, J., C. Duby, and S. Barot. 1999. Comparing the performances of Diggle's tests of spatial randomness for small samples with and without edge effect correction: application to ecological data. Biometrics 55:166-177.

6 Barot, S., J. Gignoux, S. Legendre, and R. Vuattoux. 2000. Demography of a savanna palm tree in Ivory Coast (Lamto): population persistence, and life history. J. Trop. Ecol. 16:637-655.

7 Barot, S., J. Gignoux, and S. Legendre. 2002. Stage-structured matrix models and age estimations. Oikos 96:56-61.

8 Barot, S., and J. Gignoux. 2003. Neighborhood analysis in a savanna palm: interplay of intraspecific competition, and soil patchiness. J. Veg. Sci. 14:79-88.

9 Grift, R. E., A. D. Rijnsdorp, S. Barot, M. Heino, and U. Dieckmann. 2003. Trends in reaction norms for maturation in North Sea plaice. Mar. Ecol. Prog. Series 257:247-257.

10 Barot, S., and J. Gignoux. 2004a. How do sessile dioecious populations cope with their males? Theoretical Population Biology 66:163-173.

11 Barot, S., and J. Gignoux. 2004b. Mechanisms promoting plant coexistence: can all the proposed processes be reconciled? Oikos 106:158-192.

12 Barot, S., M. Heino, L. O'Brien, and U. Dieckmann. 2004a. Estimation of reaction norm for age and size at maturity with missing first-time spawner data. Evolutionary Ecology Research 6:659-678.

13 Barot, S., M. Heino, L. O'Brien, and U. Dieckmann. 2004. Long-term trend in the maturation reaction norm of two cod stocks. Ecological Applications 14:1257-1271.

14 Barot, S., M. Grimaldi, G. Mejia, D. Mitja, and I. Miranda. 2005a. Reproductive plasticity in an invading palm tree of Amazon. Evolutionary Ecology Research 7:1051-1065.

15 Barot, S., M. Heino, M. J. Morgan, and U. Dieckmann. 2005b. Maturation of the Newfoundland American plaice (Hippoglosoides platessoides) : a long-term trend in maturation reaction norm with low fishing mortality? ICES journal of Marine Science 62:56-64.

16 Fontaine, S., and S. Barot. 2005. Size and functional diversity of microbe populations control plant persistence and long-term soil carbon accumulation. Ecol. Lett. 8:1075-1087.

17 Blouin, M., S. Barot, and P. Lavelle. 2006. Earthworms (Millsonia anomala, Megascolecidae) do not increase rice growth through enhanced nitrogen mineralization. Soil Biol. Biochem. 38: 2063-2068.

11

18 Lahoreau, G., S. Barot, J. Gignoux, W. A. Hoffmann, S. A. Setterfield, and P. R. Williams. 2006. Positive effect of seed size on seedling survival in fire-prone savannas of Australia, Brazil and West Africa. J. Trop. Ecol. 22: 719-722.

19 Measey, G. J., and S. Barot. 2006. Seasonal abundance of a subterranean East African caecilian Boulengerula boulengeri (Amphibia; Gymnophiona; Caecilidae) in a secondary forest of the East Usambara mountains, Tanzania. Journal of Zoology, London. 269: 29-37.

20 Lavelle, P., T. Decaëns, M. Aubert, S. Barot, M. Blouin, F. Bureau, P. Margerie, P. Mora, and J.-P. Rossi. 2006. Soil invertebrates and ecosystem services. Eur. J. Soil Biol. 42: S3-S15.

21 Blouin, M., Barot, S., Roumet, C., 2007. A quick method to determine root biomass distribution in diameter classes. Plant and Soil 290: 371-381.

22 Barot, S., A. Ugolini, and F. Bekkal Brikci. 2007. When do soil decomposers and ecosystem engineers enhance plant production? Func. Ecol. 21: 1-10.

23 Barot, S., J. P. Rossi, and P. Lavelle. 2007. Self-organization in a simple consumer-resource system, the example of earthworms. Soil Biol. & Biochem. 39:2230-2240.

24 Fontaine S., Barot S., Barré P., Bdioui N., Mary B. & Rumpel C. 2007 Stability of organic carbon in deep soil layers controlled by fresh carbon supply. Nature, 450: 277-281

25 Barot S., Blouin M., Fontaine S., Jouquet P., Lata J.-C. & Mathieu J. 2008 A Tale of Four Stories: Soil Ecology, Theory, Evolution and the Publication System. PLoS ONE

26 Laossi, K.-L., S. Barot, D. Carvalho, T. Desjardins, P. Lavelle, M. Martins, D. Mitja, A. C. Rendeiro, G. Roussin, M. Sarazin, E. Velasquez, and M. Grimaldi. 2008. Effects of plant diversity on plant biomass production and soil macrofauna in Amazonian pastures. Pedobiol. 51:397-407

27 Kouassi, I. K., S. Barot, J. Gignoux, and I. A. Zoro Bi. 2008. Demography and life history of two rattan species, Eremospatha macrocarpa and Laccosperma secundiflorum, in Côte d'Ivoire. J. Trop. Ecol. 24:493-503.

28 Boudsocq, S., J. C. Lata, J. Mathieu, L. Abbadie, and S. Barot. 2009. Modelling approach to analyze the effects of nitrification inhibition on primary production. Func. Ecol. 23:220-230.

29 Gignoux, J., G. Lahoreau, R. Julliard, and S. Barot. 2009. Establishment and early persistence of tree seedlings in an annually burned savanna. J. Ecol. 97:484-495.

30 Laossi, K.-L., D. C. Noguera, A. Bartolomé-Lasa, J. Mathieu, M. Blouin, and S. Barot. 2009. Effects of endogeic and anecic earthworms on the competition

12

between four annual plants and their relative reproduction potential. Soil Biol. Biochem 41:1668-1773.

31 Auclerc, A., J.-F. Ponge, S. Barot, and F. Dubs. 2009. Experimental assessment of habitat preference and dispersal ability of soil springtails. Soil Biol. Biochem 41:1596-1604.

32 Kouassi, I. K., S. Barot, and I. A. Zoro Bi. 2009. Population structure and repoductive strategy of two multiple-stemmed rattans of Côte d'Ivoire. Palms 53:39-48.

33 Jana, U., S. Barot, M. Blouin, L. Lavelle, D. Laffray, and A. Repellin. 2010. Earthworms influence the production of above- and belowground biomass and the expression of genes involved in cell proliferation and stress responses in Arabidopsis thaliana. Soil Biol. Biochem 42:244-252.

34 Laossi, K.-L., D.-C. Noguera, and S. Barot. 2010. Earthworm-mediated maternal effects on seed germination and seedling growth in three annual plants. Soil Biol. & Biochem. 42:319-323.

35 Mathieu, J., s. Barot, M. Blouin, G. Caro, T. Decaëns, F. Dubs, L. Dupont, P. Jouquet, and P. Nai. 2010. Habitat quality, conspecific density, and habitat pre-use affect the dispersal behaviour of two earthworm species, Aporrectodea icterica and Dendrobaena veneta, in a mesocosm experiment. Soil Bio. Biochem. 42:203-209.

36 Laossi, K.-L., A. Ginot, D. C. Noguera, M. Blouin, and S. Barot. 2010. Earthworm effects on plant growth do not necessarily decrease with soil fertility. Plant Soil 328:109–118.

37 Noguera, D., M. Rondon, K.-R. Laossi, V. Hoyos, P. Lavelle, M. H. Cruz de Carvalho, and S. Barot. 2010. Contrasted effect of biochar and earthworms on rice growth and resource allocation in different soils. Soil Biol. Biochem. 42:1017-1027.

38 Laossi, K.-R., T. Decaëns, P. Jouquet, and S. Barot. 2010. Can we predict how earthworm effect on plant growth vary with soil properties? Appl. Env. Soil Sci.

39 Bornhofen, S., S. Barot, and C. Lattaud. 2011. The evolution of CSR life-history strategies in a plant model with explicit physiology and architecture. Ecol. Model. 222:1-10.

40 Boudsocq, S., S. Barot, and N. Loeuille. 2011. Evolution of nutrient acquisition: when adaptation fills the gap between contrasting ecological theories. Proc. Royal. Soc London B 278:449-457.

41 Laossi, K.-R., D. C. Noguera, T. Decaens, and S. Barot. 2011. The effects of earthworms on the demography of annual plant assemblages in a long-term mesocosm experiment. Pedobiologia 54: 127-132.

13

42 Guenet, B., J. Leloup, C. Hartmann, S. Barot, and L. Abbadie. 2011. A new protocol for an artificial soil to analyse soil microbiological processes. Appl. Soil Ecol. 48:243-246.

43 Noguera, D., K.-R. Laossi, P. Lavelle, M.-H. Cruz de Carvalho, N. Asakawa, C. Botero, and S. Barot. 2011. Amplifying the benefits of agroecology by using the right cultivars. Ecol. Appl. 21:2349–2356.

44 Forey, E., S. Barot, T. Decaëns, E. Langlois, K.-L. Laossi, P. Margerie, S. Scheu, and N. Eisenhauer. 2011. Importance of earthworm-seed interactions for the composition and structure of plant communities: A review. Acta Oecologica 37:594-603.

45 Barot, S., J.-C. Lata, and G. Lacroix. 2012. Meeting the relational challenge of ecological engineering. Ecol. Eng. 45:13-23.

46 Boudsocq, S., A. Niboyet, J.-C. Lata, X. Raynaud, N. Loeuille, J. Mathieu, M. Blouin, L. Abbadie, and S. Barot. 2012. Plant preference for ammonium versus nitrate: a neglected determinant of ecosystem functioning? Am. Nat. 180:60-69.

47 Grellier, S., S. Barot, J.-L. Janeau, and D. Ward. 2012. Grass competition is more important than seed ingestion by livestock for Acacia recruitment in South Africa. Plant Ecol. 213:899-908.

48 Velasquez, E., S. J. Fonte, S. Barot, M. Grimaldi, T. Desjardins, and P. Lavelle. 2012. Soil macrofauna-mediated impacts of plant species composition on soil functioning in Amazonian pastures. Appl. Soil Ecol. 56: 43-50.

49 Noguera, D., S. Barot, K.-R. Laossi, J. Cardoso, P. Lavelle, and M.-H. Cruz de Carvalho. 2012. Biochar but not earthworm enhances rice growth through increased protein turnover. Soil Biol. & Biochem. 52:13-20.

50 Stokes, A., S. Barot, J.-C. Lata, G. Lacroix, C. G. Jones, and W. J. Mitsch. 2012. Ecological engineering: from concepts to applications. Ecol. Engin. 45:1-4.

51 Grellier, S., J. Kemp, J.-L. Janeau, N. Florsch, D. Ward, S. Barot, P. Podwojewski, S. Lorentz, and C. Valentin. 2012. The indirect impact of encroaching trees on gully extension: A 64 year study in a sub-humid grassland of South Africa. Catena 98:110-119.

52 Richard, B., M. Legras, P. Margerie, M. Mathieu, S. Barot, G. Caro, T. Desjardins, F. Dubs, L. Dupont, and T. Decaëns. 2012. Spatial organization of earthworm assemblages in pastures of northwestern France. Eur. J. Soil Biol. 53:62-69.

53 Puga-Freitas, R., S. Barot, L. Taconnat, J.-P. Renou, and M. Blouin. 2012. Signal molecules mediate the impact of the earthworm Aporrectodea caliginosa on growth, development and defence of the plant Arabidopsis thaliana. PLoS One 7:e49504.

14

54 Raynaud, X., C. G. Jones, and S. Barot. 2013. Ecosystem engineering, environmental decay and environmental states of landscapes. Oikos 122:591-600.

55 Loeuille, N., S. Barot, E. Georgelin, G. Kylafis, and C. Lavigne. 2013. Eco-evolutionary dynamics of agricultural networks: implications for a sustainable management. Advances in Ecological Research 49:339-435.

56 Grellier, S., D. Ward, J.-L. Janeau, P. Podwojewski, S. Lorentz, L. Abbadie, C. Valentin, and S. Barot. 2013. Positive versus negative environmental impacts of tree encroachment in South Africa. Acta Oecologica 53:1-10.

57 N'Dri, A. B., J. Gignoux, S. Barot, A. Dembélé, and S. Konaté. 2013. The dynamics of hollowing in annually burnt savanna trees and its effect on adult tree mortality. Plant Ecology in press.

58 Kouassi, I. K., S. Barot, K.-R. Laossi, J. Gignoux, and I. A. Zoro Bi. 2014. Relationships between ramet and genet dynamics in two clonal palms. Forest Ecology and Managment 312:101-107.

59 Pelosi, C., S. Barot, Y. Capowiez, M. Hedde, and F. Vandenbulcke. 2014. Pesticides and earthworms. A review. Agronomy for Sustainable Development in press.

12 BIBLIOMÉTRIE Au total j’ai publié 59 articles dans des journaux internationaux à comité de

lecture. Ces articles ont reçu collectivement environ 1300 citations, aboutissant à un h index de 17 (17 articles ont été cités au moins 17 fois). Il faut probablement manier avec précaution les indicateurs bibliométriques (par exemple, pratiques qualitatives et quantitatives de publication et de citation différentes suivant les disciplines et sous-disciplines). Les figures 1 et 2 montrent cependant un ou deux éléments qui me paraissent significatifs de ma progression dans le métier de chercheur.

La Figure 1 montre que j’ai régulièrement publié depuis mon recrutement à l’IRD en 2002 : une moyenne de 3.5 articles par an (minimum 2, maximum 6). De plus, depuis mon recrutement à l’IRD environ la moitié de mes articles ont été signés ou cosignés par un doctorant ou chercheur du Sud.

La figure 2 montre que le nombre de citations recueillies par mes travaux a fortement augmenté au cours du temps. En particulier, le nombre annuel de citations a été multiplié par 20 depuis mon recrutement à l’IRD.

15

Nombre de publications par an

0

1

2

3

4

5

6

7

1996

1997

1998

1999

2000

2001

2002

2003

2004

2005

2006

2007

2008

2009

2010

Figure 1

Nombre total de citations par an

0

20

40

60

80

100

120

140

160

180

200

1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010

Figure 2

13 CHAPÎTRES DE LIVRE Gignoux, J., Barot, S. 2006 Modeling tree and grass dynamics: from demographic to

spatially explicit models In "Lamto. Structure, functioning, and dynamics of a savanna ecosystem" (Abbadie, Gignoux, Leroux & Lepage eds), Springer.

Gignoux, J., Barot, S. Menaut, J.-C. and Vuattoux, R. 2006 Structure, long-term dynamics, and demography of the tree community In "Lamto. Structure, functioning, and dynamics of a savanna ecosystem" (Abbadie, Gignoux, Leroux & Lepage eds), Springer

Vuattoux, R., Konaté, S., Abbadie, L. Barot, S., Gignoux, J. and Lahoreau, G. 2006 history of the Lamto ecology station and ecological studies in Lamto In

16

"Lamto. Structure, functioning, and dynamics of a savanna ecosystem" (Abbadie, Gignoux, Leroux & Lepage eds), Springer

Lavelle, P., Barot, S., Blouin, M. Decaëns, T., Jimenez, J. J. and Jouquet, P. 2007. Earthworms as key actors in self-organized soil systems. Pages 405 in K. Cuddington, J. E. Byers, W. G. Wilson, and A. Hastings, editors. Ecosystem engineers: plants to protists. Academic Press.

Jouquet, P., J. Mathieu, S. Barot, and C. Chossai. 2007. Soil engineers as ecosystem heterogeneity drivers. in S. I. Munoz, editor. Ecology research progress. Nova Science Publishers.

Velthof, G., S. Barot, J. Bloem, K. Butterbach-Bahl, W. de Vries, H. Kros, P. Lavelle, J. E. Olesen, and O. Oene Oenema. 2011. Threats of reactive nitrogen on European soil quality. in M. A. Sutton, C. M. Howard, J. W. Erisman, G. Billen, A. Bleeker, P. Grennfelt, H. van Grinsven, and B. Grizzetti, editors. The European nitrogen assessment sources, effects and policy perspectives. Cambridge University Press.

Barot, S., M. Heino, L. O'Brien, and U. Dieckmann. Case study of two Northwest Atlantic cod stocks. In “Fisheries-induced Adaptive Change” (U. Dieckmann, O. Rune Godø, M. Heino, and J. Mork eds) Cambridge University Press, Cambridge, in press.

14 EVALUATION D'ARTICLES POUR DES REVUES SCIENTIFIQUES INTERNATIONALES, EDITION

Acta Oecologica (3), African Journal of Ecology (1), Agriculture, Ecosystems and Environment (1), American Naturalist (1), Applied and Environmental Soil Science (1), Biodiversity and Conservation (1), Biological Invasions (1), Communications in Statistics - Simulation and Computation (1), Biotropica (1), Ecography (2), Ecological Complexity (1), Ecology (1), Ecology and Evolution (1), Ecological Engineering (3), Ecological Modelling (3), Ecology Letters (1), Ecosphere (1), Environmental Management (1), European Journal of Soil Biology (5), Evolutionary Applications (1), Functional Ecology (2), Geoderma (2), Hydrobiologia (1), ICES Journal of Marine Sciences (2), Insectes Sociaux (1), Journal of Ecology (2), Journal of Tropical Ecology (5), Journal of Theoretical Biology (2), Journal of Vegetation Science (3), Oecologia (1), Oikos (1), Pedobiologia (3), Plants (1), Plant & Soil (1), Plant Ecology (1), PLoSOne (2), Population Ecology (1), Revue d’Ecologie (1), Soil Biology & Biochemistry (1), Transactions of the American Fisheries Society (1)

Participation à l’édition des actes du XIVth Intenational colloquium on soil ecology and zoology, Rouen, 2004, publication dans la revue European Journal of Soil Biology

Participation à l’édition des actes du Congrès Ecological Engineering, from Concepts to Applications, Paris, Décembre, 2009, publication sous forme de Procedias (Elsevier)

17

15 CONGRES, SEMINAIRES ET ATELIERS

Septembre 1998 Petit Pois Déridé (congrès annuel de l'association française d'écologie évolutive). Demography of a palm population, towards an understanding of the role of space.

Mars 1998 Réunion annuelle de l'Institut Fédératif d'Ecologie. Déterminisme du sexe chez le palmier Rônier

Juillet 1998 INTECOL. Florence (Italie), Recruitment distances around savanna palm trees, new insights into Janzen-Connell hypothesis. Poster

Décembre 1999 Graduate Student Workshop du "Centre for Population Biology". Imperial College (Londres), Demography of a palm tree, towards an understanding of the role of space.

Mai 2000 Journées d’Ecologie Fonctionnelle, Toulon, Effets directs et indirects de la répartition hétérogène des nutriments dans le sol sur la démographie d’un palmier de savane.

Mars 2001 Fisheries-induced adaptive changes, IIASA (Autriche), Reconstruction of first-time spawner data to assess the reaction norm for age and size at maturation.

Octobre 2002 Congrès du Conseil International pour l’Exploitation des Océans (ICES), Copenhague, Reaction norms for age and size at maturation: study of the long term trend (1970-1998) for Georges Bank and Gulf of Maine cod stocks.

Septembre 2004 XIVth Intenational colloquium on soil ecology and zoology, Rouen (France), S. Barot, J.-P. Rossi, P. Lavelle. Coupling spatial variations in earthworm density and soil structure, a modelling approach.

Septembre 2004 XIVth Intenational colloquium on soil ecology and zoology, Rouen (France), F. Thomas, J.-P. Rossi, M. Grimaldi, S. Barot, P. Lavelle. Spatial and temporal distribution of earthworm casts in forests and pastures resulting fro mdeforestation in the Northern Brazil. Poster.

Septembre 2004 XIVth Intenational colloquium on soil ecology and zoology, Rouen (France), M. Blouin, S. Barot, P. Lavelle. Earthworms enhance fertilizer effects. Poster

Mars 2005 Journées d’Ecologie Fonctionnelle, Super Besse, S. Barot. Effets des vers de terre sur le recyclage des nutriments et la croissance des plantes

Mars 2005 Journées d’Ecologie Fonctionnelle, Super Besse, S. Fontaine, S. Barot. La diversité microbienne serait-elle une condition de la survie des plantes ? Poster

18

Mars 2006 Journées d’Ecologie Fonctionnelle, Noan-le-Fuzelier, S. Barot et al. Effet de la diversité végétale sur la macrofaune et la structure du sol dans les pâturages d’Amazonie brésilienne

Mars 2007 Journées d’Ecologie Fonctionnelle, Biarritz, S. Barot et al. Effet des entrées et sorties de nutriments et de la vitesse de leur recyclage sur la production primaire

Mars 2007 Journées d’Ecologie Fonctionnelle, Biarritz, S. Boudsocq et al. Effets de l’inhibition de la nitrification sur la production primaire et le recyclage des nutriments en savane tropicale humide. Poster

Juin 2007 Annual meeting of the European Network of Palm Scientists, Paris, S. Barot, Reproductive plasticity in an Amazonian palm tree

Juin 2007 Annual meeting of the European Network of Palm Scientists, Paris, Kouadio Ignace Kouassi, S. Barot, Y. Djè and I.A. Zoro Bi, Population structure and reproductive strategy of two rattan species of Ivory Coast

July 2007 International Symposium on Organic Matter Dynamics in Agro-Ecosystems, Poitiers, S. Barot, S. Fontaine, N. Bdioui, B. Mary, C. Rumpel, P. Barré, Carbon storage and mineralization below the soil surface: new perspectives from a new experiment

Septembre 2007 Congreso latinoamericano de Agroecologia, Medelin (Colombie), D. Noguera, P. Lavelle, M. Rondon, M.-H Cruz de Carvalho, S. Barot, Effecto del carbon negro y lombriz de tierra en el crecimiento de Arroz. Poster

Mars 2008 Journées d’Ecologie Fonctionnelle, la Grande Motte, K.-R. Laossi, D. Noguera, S. Barot, Effets des vers de terre endogés et anéciques sur la compétition entre quatre espèces de plantes annuelles et leur potentiel de reproduction

Août 2008 XVth International Colloquium on Soil Zoology, Curitiba (Brésil), K.-R. Laossi , D. Noguera, S. Barot, Effects of endogeic and anecic earthworms on the competition between annual plants and their relative reproduction

Décembre 2009 Ecological Engineering from Concepts to Applications, Paris, S. Barot, K.-R. Laossi, D. Noguera, Can we generalize the principles of ecological engineering from a particular example?

Décembre 2009 Ecological Engineering from Concepts to Applications, Paris, X. Raynaud, S. Barot, C. G. Jones, Ecosystem engineering and environmental heterogeneity

Septembre 2010 Ecologie 2010, Montpellier, X. Raynaud, S. Barot & C. G. Jones, Comment des organismes ingénieurs modifient l'hétérogénéité environnementale ?

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Septembre 2010 Ecologie 2010, Montpellier, S. Boudsocq, A. Niboyet, J.-.C Lata, X. Raynaud, N. Loeuille, J. Mathieu, M. Blouin, L. Abbadie, S. Barot, Nitrate, or not nitrate: that is the question.

Septembre 2010 Ecologie 2010, Montpellier, T. Le Mao, S. Barot, N. Loeuille, Evolution de la stratégie des plantes dans un méta-écosystème : influence sur le recyclage des nutriments et sur les dynamiques source-puits

Septembre 2010 Ecologie 2010, Montpellier, J.-F. Humbert, S. Barot, G. Lacroix, J. Leloup, E. rochelle-Newall, La question de l’érosion de la biodiversité est-elle potentiellement pertinente pour les communautés microbiennes ?

Septembre 2010 Ecologie 2010, Montpellier, C. Heiniger, F. Dubs, S. Barot, J. F. Ponge, S. Salmon, Influence de la structure du paysage sur la diversité locale de collembole. Poster

Septembre 2010 Ecologie 2010, Montpellier, F. Dubs, S. Barot, M. Blouin, M. Chauvat, T. Decaëns, M. Hedde, J.-F. Ponge, S. Salmon, Les Traits de la faune du sol pour relier les Changements Environnementaux aux fonctions du Sol (TRACES). Poster

Septembre 2010 9th International Symposium of Earthworm Ecology, Xalapa (Mexique), E. Forey, S. Barot, T. Decaëns, E. Langlois, K.-R. Laossi, P. Margerie, S. Scheu and N. Eisenhauer, Importance of earthworm - seed interactions for the structure and composition of plant communities: a review.

Mars 2012 Journées d'Ecologie des Sols, Versailles, R. Puga-Freitas, S. Barot, L. Taconnat, J.-P. Renou, S. Abbad, A. Gigon, E. Garnier-Zarli , M. Blouin, Implication des molécules signal dans l’effet des vers de terre sur les plantes.

Mars 2012 Journées d'Ecologie des Sols, Versailles, C. Heiniger, F. Dubs, S. Salmon, J.-F. Ponge, S. Barot, Influence de la structure spatio-temporelle du paysage sur la diversité locale des collemboles.

Juillet 2012 EUROSOIL, Bari, Italy, N. Perveen, S. Barot, G. Alvarez, S. Fontaine, A model of C and N cycling where the plant-soil synchrony functions as a symphony. Poster

Juillet 2012 EUROSOIL, Bari, Italy, A. Rankovic, B. Izac, J.-C. Lata, J. Leloup, A. Zanella, S. Barot, L. Abbadie, Differences in carbon and nitrogen stocks and isotopic compositions regarding the exposure time of soils to urban conditions: the case of street tree-pit soils from the city of Paris

Août 2012 XVI International Colloquium on Soil Zoology, Coimbra, Portugal, J. Clause, B. Richard, S. Barot, T. Decaëns, C. Mchergui, E. Forey, Do seed performances depend on earthworm species and soil types? Poster

Août 2012 XVI International Colloquium on Soil Zoology, Coimbra, Portugal, C. Heiniger, F. Dubs, J.-F. Ponge, S. Salmon, S. Barot, Effect of spatiotemporal landscape structure on collembolan local diversity

Août 2012 XVI International Colloquium on Soil Zoology, Coimbra, Portugal, C. Heiniger, F. Dubs, J.-F. Ponge, S. Salmon , D. Carmignac, J. Meriguet, S. Barot, Experimental design disentangling habitat preferences and

20

interspecific competition as constraints structuring collembolan species assemblage, poster

Août 2012, ESA annual Meeting, Portland, USA, Julia Clause, B. Richard, S. Barot, T. Decaëns, E. Forey, Do seed performances depend on earthworm species and soil types?

Août 2013 Intecol, Londres, Urban ecosystem ecology at the soil-plant-atmosphere interface: studies on a Parisian long-term chronosequence, A. Rankovic, S. Barot, J.-C. Lata, J. Leloup, M. Sebilo, A. Zanella, L. Abbadie

Août 2013 Intecol, Londres, Patterns in urban soil nitrogen cycling communities from a soil-tree chronosequence in Paris: A case of long-term microbial succession? A. Rankovic, M. Fernandez, A. Wolff, T. Lerch, J.-C. Lata, S. Barot, L. Abbadie, J. Leloup, poster

Août 2013 Intecol, Londres, Modelling how the extent of the root zone of influence affects plant productivity, H. de Parseval, L. Abbadie, S. Barot, J. Gignoux, J.-C. Lata, X. Raynaud

Août 2013 Intecol, Londres, Earthworms affect plant communities through seed ingestion: do exotic seed species benefit from it? J. Clause, C. Lortie, S. Barot, A. Lambert, V. Vincent, C. D'Antonio, D. Canestro, A. Reid, E. Forey

Conférences invitées

Septembre 2010 Ecologie 2010, Montpellier, S. Barot, D. Noguera, K.-R. Laossi, Etudier les interactions épigé-hypogé pour unifier l’écologie ?

Octobre 2011 Journées annuelles de la société Allemande d’Ecologie des sols, Berlin, S. Barot, Finding the principles of soil ecology or bridging the gap between soil ecology and general ecology?

Août 2013 Intecol, Londres, Evolution of plant capacity to control mineralization, S. Bornhofen, N. Perveen, S. Fontaine

Août 2013 Intecol, Londres, Theoretical challenges for soil biodiversity and ecosystem services, E. Thébault, S. Barot, K. Zou

Séminaires hebdomadaires de laboratoire

Laboratoire d'Ecologie de Paris VI (1995); Laboratoire d'Ecologie de l'Université d'Orsay, Paris XI (1998); Centre d'Ecologie fonctionnelle et évolutive, Montpellier (1999), Centre for Population Biology, Imperial college, Londres (2000); Institute of Marine Research, Bergen (Norvège, 2001); Northeast Fisheries Science Center, Woods Hole (USA, 2002); Ecophysiologie Moléculaire Végétale, Université de Créteil (2004) ; Unité d'Agronomie INRA Clermont (2005) ; INRA Dijon (2005) ; IRD Montpellier, UR SeqBio (2005) ; CEFE, Montpellier (2006) ; CIAT, Cali (Colombie, 2006); LEMSAT, Dakar (2006), Bioemco, Paris (2008), Ecodiv, Rouen (2011), Unité d’Agronomie, AgroParisTech (Grignon, 2011), Département d’Ecologie, Université de

21

Cologne (Allemagne, 2012), Helmholtz Zentrum, Leipzig (Allemagne, 2013), Centre IRD de Bondy (2014)

Ateliers

Août 2005 Atelier des réseaux européens Biorhiz et Consider, Latimer (GB), S. Barot, J. Mathieu, M. Blouin, K. Laossi, E. Velasquez, P. Lavelle. Earthworm effects on plant communities: insights from field studies, microcosm experiments and modelling

Janvier 2006 Atelier du programme BIOMOS (ANR – PNBC), INRA Clermont Ferrand, S. Barot. Effets des vers de terre sur le recyclage des nutriments et la croissance des plantes

Décembre 2010 Atelier de modélisation du PPR SREC, Dakar, S. Barot, K.-R. Laossi, D. Noguera. Etudier les interactions épigé-hypogé pour unifier l’écologie ?

Mars 2011 Atelier de modélisation des activités et processus microbiens (cycles C, N et P), Laboratoire Eco & Sol, Montpellier. S. Barot, S. Boudsocq, N. Loeuille. Conséquences écologiques de l’inhibition de la nitrification par les plantes

Avril et Juin 2011 (4 jours) Netherlands Institute of Ecology, Goes, Pays Bas. How to scale influences on and effects of Ecosystem Engineers from patches to landscapes, including addressing multiple Ecosystem Engineers.

Décembre 2011 Atelier du PPR SREC sur l'intensification écologique, Dakar (par visioconférence), S. Barot. Comprendre et manipuler les interactions hypogé-épigé : pour une intensification écologique de l’agriculture

16 ORGANISATION DE CONGRES, ATELIER, ECOLE D’ETE

Décembre 2009, Ecological Engineering, from concepts to Applications, organisateur principal avec Jean-Christophe Lata, Gérard Lacroix et Gaëlle Embs, 180 participants, 3 jours.

Décembre 2010, 2nd EUCARPIA Organic and Low-input Section Conference, "Breeding for resilience: a strategy for organic and low-input farming systems?", Paris, participation au comité scientifique.

Mars 2012, Comité scientifique des Journées d'Etude des Sols, Versailles.

Juillet 2012 Participation à la préparation et l’organisation d’une école d’été à Dakar, Microtrop 2012 : intensification des interactions microbiennes pour la gestion durable des sols.

22

Avril 2012, Comité scientifique de "Restauration écologique, quand conserver ne suffit plus", NatureParif, Paris.

Juillet 2014 Participation à la préparation et l’organisation d’une école d’été à Dakar, Microtrop 2014 : Microorganismes des sols et services écosystémiques.

17 VULGARISATION

Octobre 2004 Participation à la fête de la science, Stand biodiversité du CNRS. La macrofaune du sol comme ingénieurs des écosystèmes

Mai-Juin 2004 S. Barot, Des vers modèles, Sciences au Sud- Le journal de l’IRD, N° 25

Novembre 2008 Participation à la fête de la science, Stand biodiversité du laboratoire Bioemco. Les vers de terre comme ingénieurs des écosystèmes

Novembre 2009 Participation à la fête de la science, Stand du laboratoire Bioemco. Darwin et les vers de terre

Janvier 2010 Conférence devant le personnel du Conseil Général de Seine Saint Denis, L’écologie, une science au service de la société

Juillet-Août 2011 S. Barot, Les variétés modernes des plantes cultivées ne sont pas forcément les mieux adaptées aux nouvelles pratiques agroécologiques, Sciences au Sud- Le journal de l’IRD, N°60

Février 2012 S. Barot, F. Dubs, Mieux comprendre et utiliser la diversité des organismes du sol, Regards et débats sur la biodiversité, SFE, http://www.sfecologie.org/regards/2012/02/17/r28-sols-barot-et-dubs/

Mai-Juin 2012 S. Barot, Prendre soin des cultures, Le journal du CNRS N°266, numéro spécial sur l'ingénierie écologique

Avril-Mai 2012 S. Barot, K.-R. Laossi, Impacts sur la démographie végétale, Sciences au Sud- Le journal de l’IRD, N°64

Juin 2012 S. Barot, Le fonctionnement écologique des sols, conférence organisée par NatureParif, Paris.

Novembre 2012 L. Lardy, Do you speak Microtrop ? Sciences au Sud- Le journal de l’IRD, N°67

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18 RESPONSABILITES AU SEIN D’UN LABORATOIRE

1996-1999 Représentant étudiant au conseil de laboratoire pendant la thèse

2000-2002 Création et maintenance du site Internet du réseau européen ModLife finançant mon travail post-doctoral en Autriche

2002-2006 Animation scientifique et organisation des séminaires au Laboratoire d’Ecologie des Sols Tropicaux

2002-2008 Représentant chercheur au sein du conseil de l’UMR 137

2009- Représentant chercheur au sein du conseil de l’UMR 7618 (Bioemco)

2009- 2012 Animation scientifique et organisation des séminaires dans l’équipe Biodiversité du laboratoire Bioemco

2010-2011 Porteur et animateur du Groupe de Recherche International REDH, en collaboration avec A. Brauman (IRD) et H. Nacro (Université Polytechnique de Bobo Dioulasso) qui fédère un certain nombre de laboratoires de France et d’Afrique (essentiellement d’Afrique de l’Ouest). 20 000 euros de budget annuel

2012- Chef de l’équipe « Ecologie intégrative » de l’Institut d’Ecologie et des Sciences de l’Environnement-Paris

19 EVALUATIONS, COMMISSIONS DE RECRUTEMENT

2005-2008 Commission des spécialistes de l’ENS Paris, Biologie, membre suppléant

2007-2008 Commission des spécialistes de Paris XII, Biologie, membre extérieur

2009 Participation à l’évaluation AERES du laboratoire ECOLAB à Toulouse

2009- 2011 Commission de recrutement de l’UPMC

2009- 2010 Comité de sélection des projets Emergence de l’UPMC

2009- 2010 Membre du comité de pilotage du programme ANR « Sixième extinction »

2011 Membre de la commission d’évaluation des projets soumis à l’appel d’offre Les champs de biodiversité de la FRB

2011 Président du Jury pour le recrutement d'un Maître de Conférences en agro-écologie à l'AgroParisTech

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2011 Membre de la commission pour le recrutement d'un Maître de Conférences sur une chaire paris XII-IRD

2012-2016 Membre élu du collège 1 de la Commission Scientifique Sectorielle 3 (Science des systèmes écologiques) de l'IRD

2012-2016 Membre du Comité Scientifique et d'Orientation du CESAB (Centre de Synthèse et d'Analyse sur la Biodiversité)

2013 Membre de la commission pour le recrutement pour un poste de Professeur à l’Université de Rouen (interactions sol-plantes)

2013 Membre de la commission pour le recrutement pour une poste de Professeur à l’Université d’Avignon (écologie des communautés végétales, restauration écologique)

2014 Février, Membre du comité AERES d’évaluation du laboratoire Eco & Sols à Montpellier (SupAgro, IRD, INRA, CIRAD)

2014 Février, membre du comité AERES d’évaluation du laboratoire Biologie et Génétique des Interactions Plantes-Parasites à Montpellier (SupAgro, INRA, CIRAD)

20 EXPERTISE

2013- Membre du Conseil Scientifique et Technique de l’Evaluation Française des Ecosystèmes et des Services Ecosystémiques

2014- Membre du Conseil Scientifique de la Fondation pour la Recherche pour la Biodiversité

21 PROGRAMMES DE RECHERCHES FINANCES SUR APPEL D’OFFRE

2005-2008 ANR ‘‘Jeune chercheur’’ Titre : Vers une écologie évolutive des sols : évolution de la relation faune du sol – plante Laboratoire impliqués : UMR 137, IRD-LEST et EPM-Paris XII Projet dirigé par Sébastien Barot

2005-2008 ANR ‘‘Biodiversité’’ Titre : Impacts sur le fonctionnement des écosystèmes de la biodiversité intra- et inter-niveaux trophiques Laboratoires impliqués : UMR 7618 CNRS-Paris VI, LEST-IRD, CIRAD-Zimbabwe, Université McGill (Canada) Projet dirigé par Florence Hulot et Hervé Fritz

2005-2008 ANR ‘‘ECCO’’ ‘‘Ecosystèmes continentaux’’ Titre : Contrôle biologique (plante, microbe) de la dynamique des matières organiques des sols

25

Laboratoires impliqués : Unité d'agronomie INRA Clermont Ferrand, LEST-IRD, Laboratoire d'agronomie INRA Laon-Reims-Mons, UMR 7618 CNRS-Paris VI Projet dirigé par Sébastien Fontaine

2008-2011 ANR ‘‘Calcul Intensif et Simulation’’ Titre : 3worlds une plateforme de simulation multi-échelle pour l’écologie et les sciences de l’environnement Laboratoires impliqués : UMR BIOEMCO (CNRS, INRA Paris VI), UR GEODES (IRD), UMR LIMOS (CNRS, Université d’Auvergne) Projet dirigé par Jacques Gignoux

2009-2012 ANR ‘‘Jeune chercheur’’ Titre : Dispersion des vers de terre Laboratoires impliqués : UMR Bioemco (CNRS, IRD, Paris VI), laboratoire Ecodiv (Université de Rouen) Projet dirigé par Jérôme Mathieu

2011-2014 ANR ‘‘Changements Environnementaux Planétaires’’ Titre : PULSE (Lacs périurbains, société et environnement) Laboratoires impliqués : UMR Bioemco (IRD, CNRS, Paris 6, Paris 12; UMR 8079, Ecologie, Systématique et Evolution (CNRS, Paris 11) ; FRE 3206 (CNRS, MNHN) Projet dirigé par Gérard Lacroix, WP5 dirigé par S. Barot

2011- Projet EQUIPEX Planaqua Financement pour une plateforme expérimentale d’écologie aquatique Participation en tant que modélisateur Projet dirigé par Gérard Lacroix

2011 FRB Modelling and Scenarios of Biodiversity Obtention d’un financement d’un an pour finaliser un projet visant à déterminer et évaluer les grands scénarios d’évolution de la relation entre des villages sahéliens et leur environnement (scénario de biodiversité, évaluation des services écosystémiques, réponses possibles en termes d’ingénierie écologique) Projet dirigé par Manuel Blouin

2012-2015 ANR "Changements Environnementaux Planétaires" Titre : SAVARID (Effet de l'augmentation de l'aridité et de la fréquence des sécheresses sur les systèmes socio-écologiques de savane dépendant de la biodiversité : scénarios exploratoires pour une aire protégée contrainte par l'eau de surface) Laboratoires impliqués : CEFE, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, Bioemco Projet dirigé par Hervé Fritz

2012 CNRS ‘‘EC2CO’’, Titre : Influence des herbivores sur les graminées et le fonctionnement du sol au Birkina Faso.

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Laboratoire impliqué : Bioemco, Eco &Sol Projet dirigé par S. Barot

2014-2017 ANR ‘‘Agrobiosphère ‘’ Titre : WHEATAMIX (Augmenter la diversité génétique au sein des parcelles de blé pour renforcer la multifonctionnalité et la durabilité de la production dans le Bassin Parisien) Laboratoires impliqués : GV, SADAPT, LEM, IEES-Paris, CERSP, GDEC Projet dirigé par Jérôme Enjalbert, WP4 4 dirigé par S. Barot

2014-2017 ANR ‘‘Agrobiosphère’’ Titre : CERAO (Auto-adaptation des agro-socio-écosystèmes tropicaux face aux changements globaux ? Etude à long terme en vue d’une intensification écologique de la production de céréales dans les zones de savanes en Afrique de l’Ouest.) Laboratoires impliqués : Eco & Sols, LPED, SELMET Projet dirigé par Dominique Masse

2014-2015 CNRS ‘‘EC2CO’’ Titre : Impact de la diversité des graminées et ligneux de savane sur la diversité microbienne et le fonctionnement des sols Laboratoire impliqué : IEES-Paris, Agroécologie (Dijon) Projet dirigé par Jean-Christophe Lata

22 VIE ASSOCIATIVE

2008- Membre actif du Groupe d’Application de l’Ingénierie Ecologique : organisation de séminaire, organisation du congrès EECA, ateliers …

2011 Membre du CA et vice-président de la Société Française d’Ecologie

2012 Membre du CA et secrétaire du groupe GAIE transformé en association