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Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
Zentrum für Biosystemanalyse (ZBSA)(Center for Systems Biology)
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Eine im Rahmen der Ausschreibung“Lebenswissenschaftliche Zentren
Baden-Württemberg”geförderte zentrale Einrichtung der Universität
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
Systembiologie
Standardisierte Systeme
Quantitative, zeitauflösende Datenerhebung
Modellbildung
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
Systembiologie - Schwerpunkte ZBSA Freiburg
Standardisierte Systeme
Quantitative, zeitauflösende Datenerhebung
Modellbildung
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
Interaktionen im Freiburger Zentrenverbund
Z BSAZ e n tr um f ü r
B io s ys te m -
a n aly s e
Z fB IZ e n tr um f ü r
B ioin fo rm a t ikFDM ZBSA ZfBI
BiosystemanalyseDatenanalyse
undModellbildung
Bioinformatik
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
Center for Systems Biology - ZBSA
• Realisiert im Rahmen der Baden-Württemberischen Initiative “Lebenswissenschaftliche Zentren
• Das ZBSA ist interdisziplinär ausgerichtet.
• Räumliche Zusammenführung von Kernkompetenzen bei der Erhebung und dem Management komplexer biologischer Datensätze. • Genomics (Expressionsprofilierung u.a.)• Proteomics• Biological Imaging• Mögliche Anbindung der Mikrosystemtechnik könnte neuartige Ansätze der Datenerhebung realisieren.
• Räumliche Integration der mit bioinformatischen Ansätzen arbeitenden Arbeitsgruppen
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
Wissenschaftliche Organisation des
Zentrums für Biosystemanalyse
Projektbereiche und Kernkompetenzen im ZBSA-Gebäude (orange) und in affiliierten Arbeitsgruppen (gelb) etablieren die Biosystemanalyse in Freiburg.
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
Projektbereich A: Zelluläre Schaltsysteme
• Im Mittelpunkt steht die Zelle als unabhängige, funktionelle, biologische Einheit.
• Das Hauptaugenmerk liegt dabei auf der Analyse integraler Schaltsysteme der Zelle.
• Für definierte Schaltprozesse in der Zelle sollen relevante Systemeigenschaften erschlossen werden, die nicht nur für das jeweils betrachtete, spezielle zelluläre System von Bedeutung sind, sondern Modellcharakter für die Zelle als biologische Funktionseinheit besitzen.
Beispiel: Leberzelle
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
Projektbereich B: Regulatorische Netzwerke - Suprazelluläre Organisation
Ziel der Projekte dieses Bereiches ist es, die Gesamtheit der regulatorischen Einflüsse zu verstehen, die zur Differenzierung eines bestimmten Zelltypes, der Organisation von Zellen in Organe, und letztendlich zu komplexen Funktionen wie neuronalen Verschaltungen beitragen.
Beispiel: Aktivitätsmuster im Gehirn
Projektbereich C: MetabolomicsZiel ist die Erstellung von Modellen zu Metabolitflüssen durch Profiling niedermolekularer und sekundärer Stoffwechselendprodukte eingerichtet werden. (= Metabolomics, d. h. nach Möglichkeit die Erfassung aller Sekundärmetaboliten). Beispiel: Metabolitflüße Vitamin-Synthesen im Reis
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
Beiträge zum ZBSA: Life Sciences in FreiburgMPI
Biologie I, II, III
Forstwissenschaften
Anatomie
BiochemiePhysiologieChemie&PharmaziePhysik
Kliniken
InformatikMikrosystemtechnik
FDM
molekular-organismischeForschungsbereichemolekulare &molekularbiologischzellbiologische Forschungsbereicheklinische ForschungsbereicheInformatikMikrosystemtechnikDatenanalyse
ZBSA
Zentrum fürBiosytemanalyse
Biotech-Park
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
ZBSA
Baufertigstellung geplant Anfang 2005
Ca. 100 Mitarbeiter
Ca. 3000 qm
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg
Systems Biology Bioinformatik Modellbildung
Sozial-bereich
Labore S1 / S2: quantitative Datenerhebung
ZBSA: Integration von Datenerhebung und Theorie
OG1
OG2
Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg