Input 1:Gelspots (MALDI/TRAP)

I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: Übersicht

Input 2:Gelfrei (MALDI/TRAP)

mgf.-file mgf.-file

Aktualisieren der DB Spektren/ Spotdatenbank+

BLAST

Aktualisieren der DB Spektrendatenbank+ BLAST

X

Clustern/ PCA

Open:QuantifizierungEinbettungDatastorage

Suche mit X gegen:• NCBIall/Swissprot• Metagenom• Spektrendatenbank

Suche mit X gegen:• NCBIall/Swissprot• Metagenom• Spektrendatenbank• Spotdatenbank

Biogasdatenbank

I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: SUCHEN X

DB: Spotdatenbank

DB: Spektrendatenbank

DB: NCBI/ Swissprot

DB: Metagenome+ BLAST+ manuel

SUCHE: Ähnlichkeitssuche mit Spektren

SUCHE: Standardsuche/Cloudcomputing mit Sequence, OMSA, MASCOT oder

Pepnovo/BLAST (Auswahl)

SUCHE: Erhöhung des Scores für gelfreie

Experimente

BLAST+ Auswahl

I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: Einbettung

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