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Standard Curve
Log Concentration 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0
Cro
ss
ing
Po
int
40
35
30
25
20
15
10
LyoBead Probe MasterMix
• Genotypisierung
In-house TaqMan-Assay für Parvovirus B19. 3-fach Bestimmung auf Plasmid-Verdünnungsreihe (30-9045-01). Getestet wurden 109-100 Kopie/rxn.
Cp (Mittel) STABW
109 8,7 0,03
108 12,1 0,01
107 15,5 0,03
106 19,0 0,06
105 22,4 0,03
104 25,8 0,04
103 29,2 0,14
100 32,5 0,63
10 36,4 0,56
1 39,1 0,47
• lineare Amplifikation über mindestens 9 log-Stufen
Melting Peaks
Temperature (°C) 74 72 70 68 66 64 62 60 58 56 54 52 50 48 46 44 42 40
-(d
/dT
) F
luo
res
ce
nc
e (
49
8-6
40
)
1,025
0,925
0,825
0,725
0,625
0,525
0,425
0,325
0,225
0,125
0,025
-0,075
-0,175
Kontroll-DNA wild-typ Mutante
hetreozygot NTC
Getestet wurde auf die Mutation MCM6 C-13910T für Laktose toleranz/intoleranz mit dem LightMix® Kit Lactose Intolerance (40-0307-32) von TIB-Molbiol nach Manual vorgaben. Die Kontrollen sind Bestandteil des Kits, desweiteren wurden 8 DNA-Proben (2x wt, 3x mut, 3x het) getestet.
Melting Peaks
Temperature (°C) 74 72 70 68 66 64 62 60 58 56 54 52 50 48 46 44 42 40
-(d
/dT
) F
luo
res
ce
nc
e (
49
8-6
40
)
1,130
1,030
0,930
0,830
0,730
0,630
0,530
0,430
0,330
0,230
0,130
0,030
-0,070
-0,170
Amplification Curves
Cycles 45 40 35 30 25 20 15 10 5
Flu
ore
sc
en
ce
(4
65
-51
0)
35,849
32,349
28,849
25,349
21,849
18,349
14,849
11,349
7,849
4,349
0,849
Amplification Curves
Cycles 50 45 40 35 30 25 20 15 10 5
Flu
ore
sce
nc
e (
498-6
60
)
3,987
3,587
3,187
2,787
2,387
1,987
1,587
1,187
0,787
0,387
-0,013
Amplification Curves
Cycles 50 45 40 35 30 25 20 15 10 5
Flu
ore
sce
nc
e (
498-6
40
)
9,133
8,233
7,333
6,433
5,533
4,633
3,733
2,833
1,933
1,033
0,133
Amplification Curves
Cycles 50 45 40 35 30 25 20 15 10 5
Flu
ore
sce
nc
e (
498-6
40
)
9,042
8,142
7,242
6,342
5,442
4,542
3,642
2,742
1,842
0,942
0,042
LyoBead Probe MasterMix
• Hybridisierungssonden Assays (LC-Sonden)
A) Getestet wurde auf T. vaginalis mit dem LightMix® Kit Trichomonas vaginalis (40-0610-32) von TIB-Molbiol nach Manual vorgaben. Die Standard-Reihe zur quantitativen Probenbestimmung ist Bestandteil des Kits, desweiteren wurden 6 DNA-Proben getestet.
Amplification Curves
Cycles 45 40 35 30 25 20 15 10 5
Flu
ore
scen
ce (498-6
40)
5,285
4,785
4,285
3,785
3,285
2,785
2,285
1,785
1,285
0,785
0,285
b)
Amplification Curves
Cycles 50 40 30 20 10
Flu
ore
scen
ce (498-6
60)
2,733
2,533
2,333
2,133
1,933
1,733
1,533
1,333
1,133
0,933
0,733
0,533
0,333
0,133
-0,067
c)
Amplification Curves
Cycles 45 40 35 30 25 20 15 10 5
Flu
ore
scen
ce (498-6
40)
6,672
6,072
5,472
4,872
4,272
3,672
3,072
2,472
1,872
1,272
0,672
0,072
a)
a) Standard-Reihe 106-10 Kopien/rxn (LC640); b) T. vaginalis positive DNA-Proben (LC640); c) interne PCR Kontrolle (LC660)
B) Getestet wurde auf B. pertussis/B.parapertussis mit dem dual-color LightMix® Kit Bordetella pertussis and parapertussis (40-0575-32) von TIB-Molbiol nach Manual vorgaben. Die Standard-Reihen zur quantitativen Probenbestimmung sind Bestandteil des Kits, desweiteren wurden 6 DNA-Proben getestet (4x B.pert, 2x B.para).
a) Standard-Reihe für B.pertussis 106-10 Kopien/rxn (LC640); b) B.pertussis positive DNA-Proben (LC640); c) Standard-Reihe für B.parapertussis 106-10 Kopien/rxn (LC660); d) B.parapertussis positive DNA-Proben (LC660)
d) c)
b) a)
Amplification Curves
Cycles 50 45 40 35 30 25 20 15 10 5
Flu
ore
sce
nc
e (
498-6
60
)
3,940
3,540
3,140
2,740
2,340
1,940
1,540
1,140
0,740
0,340
-0,060
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
618-6
60
)
10,969
9,969
8,969
7,969
6,969
5,969
4,969
3,969
2,969
1,969
0,969
-0,031
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
440-
488
)
84,032
76,032
68,032
60,032
52,032
44,032
36,032
28,032
20,032
12,032
4,032
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
440-4
88
)
77,039
70,039
63,039
56,039
49,039
42,039
35,039
28,039
21,039
14,039
7,039
0,039
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
533-5
80
)
72,332
65,332
58,332
51,332
44,332
37,332
30,332
23,332
16,332
9,332
2,332
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
533-5
80
)
52,350
47,350
42,350
37,350
32,350
27,350
22,350
17,350
12,350
7,350
2,350
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
533-5
80
)
64,549
58,549
52,549
46,549
40,549
34,549
28,549
22,549
16,549
10,549
4,549
LyoBead Probe MasterMix
• Hydrolysierungssonden Assays (TaqMan)
A) Getestet wurde auf T. vaginalis mit dem LightMix® Modular Trichomonas vaginalis RepeatDNA (n° 07 696 191 001) von Roche nach Manual vorgaben. Die Standard-Reihe wurde aus dem Plasmid 30-9472-02 von GenExpress erstellt, die Positiv-Kontrolle (schwarze Amplifikationskurve ist Bestandteil des Kits), desweiteren wurden 6 DNA-Proben getestet.
b)
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
618-6
60
)
15,622
14,122
12,622
11,122
9,622
8,122
6,622
5,122
3,622
2,122
0,622
c)
a) Standard-Reihe 106-10 Kopien/rxn; b) T. vaginalis positive DNA-Proben und positiv Kontrolle; c) DNA-Extraktionskontrolle PhHV
B) Getestet wurde auf B. pertussis/B.parapertussis im Tri-plex Ansatz mit den LightMix® Modular Bordetella pertussis (n° 07 730 543 001) und Bordetella parapertussis (n° 07 730 004 001) von Roche nach Manual vorgaben. Die Standard-Reihen wurden aus den Plasmiden 30-7099-01 (B.pert) und 30-8589-01 (B.para) von GenExpress erstellt, die Positiv-Kontrollen (schwarze Amplifikationskurve sind Bestandteil des Kits), desweiteren wurden 6 DNA-Proben getestet (4x B.pert, 2x B.para).
e) c)
b) a)
d)
a) Standard-Reihe für B.pertussis 106-10 Kopien/rxn; b) B.pertussis positive DNA-Proben und positiv Kontrolle; c) Standard-Reihe für B.parapertussis 106-10 Kopien/rxn ; d) B.parapertussis positive DNA-Proben und positiv Kontrolle; e) DNA-Extraktionskontrolle PhHV
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
533-5
80
)
61,324
55,324
49,324
43,324
37,324
31,324
25,324
19,324
13,324
7,324
1,324
a)
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
533-6
10
)
17,000
15,500
14,000
12,500
11,000
9,500
8,000
6,500
5,000
3,500
2,000
0,500
LyoBead Probe MasterMix
• Hydrolysierungssonden Assays (TaqMan)
C) Getestet wurde auf ESBL Carbapenemase im Hexa-plex Ansatz mit den LightMix® Modular VIM Carbapenemase (n° 07 042 370 001), NDM-1 Carbapenemase (n° 07 042 299 001), OXA-48 Carbapenemase (n° 07 042 302 001), KPC Carbapenemase (n° 07 042 272 001) und IMP Carbapenemase (n° 07 042 345 001) von Roche nach Manual vorgaben. Die Standard-Reihen wurden aus den Plasmiden 30-8896-02 (VIM), 30-8439-01 (NDM-1), 30-8823-01 (OXA-48), 30-8799-01 (KPC) und 30-8892-02 (IMP) von GenExpress erstellt.
a) Standard-Reihe für VIM 106-10 Kopien/rxn b) Standard-Reihe für NDM-1 106-10 Kopien/rxn c) Standard-Reihe für OXA-48 106-10 Kopien/rxn
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
440-4
88
)
58,502
53,502
48,502
43,502
38,502
33,502
28,502
23,502
18,502
13,502
8,502
3,502
-1,498
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
465-5
10
)
30,849
27,849
24,849
21,849
18,849
15,849
12,849
9,849
6,849
3,849
0,849
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
533-5
80
)
42,615
38,615
34,615
30,615
26,615
22,615
18,615
14,615
10,615
6,615
2,615
a) b)
c) d)
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
533-6
40
)
28,959
26,459
23,959
21,459
18,959
16,459
13,959
11,459
8,959
6,459
3,959
1,459
Amplification Curves
Cycles 40 30 20 10
Flu
ore
sce
nc
e (
618-6
60
)
10,002
9,002
8,002
7,002
6,002
5,002
4,002
3,002
2,002
1,002
0,002
e) f)
d) Standard-Reihe für KPC 106-10 Kopien/rxn e) Standard-Reihe für IMP 106-10 Kopien/rxn f) DNA-Extraktionskontrolle PhHV