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Täglich aktuell: www.laborwelt.de Nr. 4 / 2012 – 13. Jahrgang LABOR WELT Stammzellen Nicht-invasiver Nachweis transplantierter iPS-Zellen Bioanalytik Zytokinstürme in vitro erkennen mit RESTORE Bioinformatik Bioinformatik-Werkzeuge für die Bildverarbeitung

LABORWELT 04/2012

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Bioanalytik: Zytokinstürme in vitro erkennen mit RESTORE +++ Stammzellen: Nicht-invasiver Nachweis transplantierter iPS-Zellen +++ Bioinformatik: Bioinformatik-Werkzeuge für die Bildverarbeitung

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Täglich aktuell:

www.laborwelt.de

Nr. 4 / 2012 – 13. Jahrgang

LABORWELTStammzellenNicht-invasiver Nachweis transplantierter iPS-Zellen

BioanalytikZytokinstürme in vitro erkennen mit RESTORE

BioinformatikBioinformatik-Werkzeuge für die Bildverarbeitung

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Page 2: LABORWELT 04/2012

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Inhalt

TITEL: StammzellenEin regelrechter Hype um Stammzell-basierte, patientenspezifische Krankheitsmodelle ist in der Pharmaindustrie entbrannt. GMP-Produktion und Aufreinigung sind bereits möglich. An therapeutischen Anwendungen wird noch geforscht.

4 Nachrichten aus der Wissenschaft Europäer dominieren iGEM-Wettbewerb, Quetschtest entlarvt Krebs,

Neue Gentherapie-Vektoren, Stammzellskandal in Japan, eLife-Journal geht online, Wie T-Zellen sich vor HIV schützen, Pflanzenfalle

40 Labormarkt im Umbruch Roche Diagnostics: Korrektur, keine Krise

Bioanalytik

Wissenschaft Immunologie6 Sensitive T-Zellantworten im RESTORE-System Thomas Hünig, Julia Fischer, Universität Würzburg

Blitzlicht Diagnostik9 POCT in Diagnostik und personalisierter Medizin Frauke Adams, Anke Kopacek, DiagnostikNet-BB, Hennigsdorf

Blitzlicht Mediator-Sonden PCR10 Neuer Echtzeit-Nachweis von Nukleinsäuren Bernd Faltin, Robert Bosch GmbH; Felix von Stetten et al., Univ. Freiburg Blitzlicht Nanoporen-Analytik12 Nanoporen-gestützte Analytik auf Arrays Gerhard Baaken, Jan Behrends et al., Universität Freiburg Paperwelt Proteomics14 Molekulare Angel für sekretierte Proteine Jereon Krijgsveld, European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg

Expertenpanel Bioanalytik16 Biosensorik- und PCR-Innovationen Frank Bier, Fraunhofer-IBMT, Potsdam; Günter Roth, IMTEK Freiburg

Stammzellen

Blitzlicht Arzneimittelforschung18 Drug Testing mit Stammzellderivaten Hans Schöler, Susanne Höing, MPI für molekulare Biomedizin, Münster

Blitzlicht Großtiermodell22 Nichtinvasiver Nachweis transplantierter iPS-Zellen Christian Templin, Universitäts-Spital Zürich; Ulrich Martin, MH Hannover

Expertenpanel Stammzellen25 Neue Stammzelltechniken Manfred Köller, Bochum; Claudia Kleinhans, Stuttgart

Blitzlicht Automation26 Industrialisierung der Herstellung von iPS-Zellen Simone Haupt, Oliver Brüstle et al., Universität Bonn

Blitzlicht Markierung28 In vivo-Stammzelltracking mit Nanobeads Martin Hieronymus, Martin Zenke et al., RWTH Aachen

Bioinformatik

Blitzlicht Metabolomics30 Stoffwechselanalyse: Neue Wege im Labyrinth entdecken Ines Heiland und Christoph Kaleta, Friedrich Schiller-Universität Jena

Paperwelt Sequencing33 NGS-Patzer ausmerzen Martin Löwer et al., TrOn Mainz

Blitzlicht Genomics34 Datenbanktechnologie beflügelt personalisierte Medizin Matthieu-P. Schapranow et al., Hasso-Plattner-Institut, Potsdam

Blitzlicht Bildverarbeitung36 Fiji: eine offene Plattform für wissenschaftliche Bildanalysen Johannes Schindelin, MPI für molekulare Zellbiologie & Genetik, Dresden

Expertenpanel Bioinformatik38 Was die Zukunft bringt Burkhard Rost, TU München; Edgar Wingender, Universitätsmedizin Göttingen

39 Verbände

41 Termine

42 Ausblick/Impressum

LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 3

TITEL: BioanalytikNeue Analyseverfahren ebnen den Weg für neue medizinische Anwen-dungen. So lassen sich Immunreakti-onen auf Antikörper arzneien jetzt in vitro nachstellen und seltene Signal-proteine aus der Masse störender Eiweiße herausfischen.

LABORWELT 4 / 2012

TITEL: BioinformatikNeue Datenbanken und Algorithmen versprechen endlich Ordnung im Da-tendschungel. Aber dank bioinforma-tischer Methoden können auch völlig neue wissenschaftliche Erkenntnisse – wie zum Beispiel über biochemische Signalwege – gewonnen werden.

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Nachrichten Aktuelles

4 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Ë

Intro

Pharma braucht kreative Forschung

Neue Plattformen

Synthetische Biologie

Europa dominiert iGEM-FinaleË

Gentherapie

Nano-TaxisË

Biomarker

Krebs-Quetschtest

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Aktuelles Nachrichten

LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 5

Pflanzen rufen nach Hilfe bei Schädlingsattacken

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Stammzellforschung

Lüge stürzt ForscherË

HIV-Forschung

T-Zell-SchutzË

Open Access

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6 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Bioanalytik Immunologie

Sensitive T-Zellantworten im RESTORE-System

Bioanalytik

Von Immunologie bis Nanoporen

γ

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6_8_LW4_12_Huenig_intro_Bioanalytik_tg.indd 6 08.11.2012 12:02:14 Uhr

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Page 8: LABORWELT 04/2012

8 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Bioanalytik Immunologie

α

Das optimierte RESTORE-Protokoll

Literatur[1] Suntharalingam, G., Perry, M.R., Ward, S., et al., N. Engl. J. Med.

355 (2006), 1018-1028[2] Gogivhvili, T., Langerhorst, D., Lühder, F., et al., PLOS ONE 4

(2009), e4643[3] Eastwood, D., Findlay, L., Poole, S., et al., Br. J. Pharmacol. 161

(2010), 512-526[4] Römer, P.S., Berr, S. Avota, E., et al., Blood 118 (2011), 6772-82[5] Duff, G.W., et al., Norwich, UK: Stationary Offi ce (2006)[6] Dennehy, K.M., Elias, F., Na, S.Y., et al., J. Immunol. 178 (2007),

1363-1371[7] Levin, S.E., Zhang, C., Kadlecek, T.A., et al., J. Biol. Chem. 283

(2008), 15419-15430[8] !tefanová, I., Dorfman, J.R., Germain, R.N., Nature 420 (2002),

429-434[9] Eastwood, D., Findlay, L., Poole, S., et al., Br. J. Pharmacol. 161

(2010), 512-526

Hinweis: Die Rechte für die kommerzielle Anwendung des RESTORE Protokolls liegen bei der Firma TheraMab LLC. Kontakt: Dr. Sergey Chuvpilo ([email protected]).

Korrespondenzadresse

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LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 9

Diagnostik Bioanalytik

POCT in Diagnostik und personalisierter Medizin

Personalisierte Diagnostik im Aufwind

Kontakt

9_LW4_12_Kopacek_tg.indd 9 09.11.2012 11:49:50 Uhr

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10 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Functional Genomics Mediator-Sonden PCR

Neuer Echtzeit-Nachweis von Nukleinsäuren

Nachweis mit markierungsfreien Sonden und fl uorogenem Reporter

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Page 11: LABORWELT 04/2012

LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 11

Mediator-Sonden PCR Bioanalytik

Kostenvorteile durch Skaleneffekte

MP- versus Hydrolyse-Sonden-PCR

β

Literatur[1] Faltin, B., Wadle, S., Roth, G., Zengerle, R., von Stet-

ten, F., Clinical Chemistry (2012), doi: 10.1373/clin-chem.2012.186734

[2] Kaltenboeck, B., Wang, C.M., Advances in clinical che-mistry 40 (2005), 219-259

[3] Marras, S.A.E., Kramer, F.S., Tyagi, S., Nucleic Acids Research 30 (2002)

[4] Kubista, M., Clinical Chemistry (2012), doi: 10.1373/clinchem.2012.194126

Korrespondenzadresse

Kosten pro Oligonukleotid (!)Anzahl der Targets 1 4 10

Hydrolyse-Sonden PCR 179 716 1790

MP PCR 475 650 1090UR 435 490 690

MP 40 160 400

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12 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Bioanalytik Nanoporen-Analytik

Nanoporen-gestützte Analytik auf Arrays

αDer Microelectrode Cavity Array (MECA)

α

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LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 13

Nanoporen-Analytik Bioanalytik

Automatisierte Herstellung von Bilipidschichten

Ausblick

Literatur[1] Gracheva, E. (Hrsg.) Nanopore-based technology (Methods in

Molecular Biology 870) Springer, New York, 2012 [2] Übersicht bei: Demarche et al. Analyst 6, 1077, 2011, Zagnoni,

M. Lab on a Chip, 12, 1026, 2012[3] Baaken, G. et al. ACS Nano, 2011, 5, 8080–8088; G. Baaken, J.

C. Behrends, BIO-Spektrum, 2011, 17, 769-772[4] Mueller, P. et al., Z. Kreislaufforschung, 1963, 52 (7) 534.[5] Montal, M.; Mueller, P., Proceedings of the National Academy

of Sciences, 1972 69, (12), 3561-3566[6] White, S.H. In: Miller, C. (Hrsg.) Ion Channel Reconstitution, p.

3-35, Plenum, New York (1986)

Korrespondenzadresse

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14 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Bioanalytik Paperwelt

Molekulare Angel für sekretierte Proteine

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LABORWELT

Paperwelt BioanalytikInserat NBNM Transkript 04.12_: 26.04.12 17:30 Seite 1

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16 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

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Page 17: LABORWELT 04/2012

Aktuelle NachrichtenNeuigkeiten aus dem Labor und der Welt

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Page 18: LABORWELT 04/2012

18 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Stammzellen Arzneimittelentwicklung

Drug Testing mit Stammzellderivaten

Stammzellen

Anwendungsfokus auf iPSCs

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Page 19: LABORWELT 04/2012

Arzneimittelentwicklung Stammzellen

Ergebnisse

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Page 20: LABORWELT 04/2012

LABORWELT

Ausblick

LiteraturDie Literaturliste findet sich unter www.laborwelt.de.

Korrespondenzadresse

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The European Biotechnology Network is dedicated to facilitating co-operati-on between professionals in biotech-nology and the life sciences all over Europe. The network is run by the Eu-ropean Biotechnology Foundation, a non-profi t organisation based in Brus-sels. Do you want to know more about the advantages of a (free) member-ship? Just have a look at our website: www.european-biotechnology.net

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Page 21: LABORWELT 04/2012

Why attend?The patent cliff and an increasingly payer-driven environment are problems for the life sciences industry. Specialised treat-ments have thus become a critical asset for pharma. Drug diagnostics combinations – so called companion diagnostics – offer companies the ability to develop targeted drugs with the potential for greater effi cacy, accelerated regulatory approval and better reimbursement. Thus, developing treatments without suitable diagnostics has become an expensive form of Russian roulette. But, this joint process is complex. The challenges have created new forms of cooperation between pharma, biotechs and diagnostics service companies and resources needed to cope with giant amounts of data. The reward is huge: analysts forecast new billion dollar markets.

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22 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Nichtinvasiver Nachweis transplantierter iPSCs

Verfahren zum Nachweis transplantierter Stammzellen

Stammzellen Großtiermodell

Methode

22-24_LW4_12_Templin_Martin_Stammz_tg.indd 22 08.11.2012 12:12:36 Uhr

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24 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Stammzellen Großtiermodell

Literatur[1] Weir RA, McMurray JJ., Curr Heart Fail Rep 2006;3:175-

80.[2] Weir RA, McMurray JJ, Velazquez EJ., Am J Cardiol

2006;97:13F-25F.[3] Templin C, Krankel N, Luscher TF, Landmesser U. ,Curr

Pharm Des 2011;17:3280-94.[4] Templin C, Luscher TF, Landmesser U., Herz 2010;35:445-

56.[5] Templin C, Luscher TF, Landmesser U., Int J Dev Biol

2011;55:407-17.[6] Zimmet H, Porapakkham P, Sata Y, et al., Eur J Heart Fail

2012;14:91-105.[7] Takahashi K, Yamanaka S., Cell 2006;126:663-76.[8] Takahashi K, Tanabe K, Ohnuki M, et al., Cell

2007;131:861-72.[9] Yu J, Vodyanik MA, Smuga-Otto K, et al., Science

2007;318:1917-20.[10] Mauritz C, Schwanke K, Reppel M, et al., Circulation

2008;118:507-17.[11] Haase A, Olmer R, Schwanke K, et al., Cell Stem Cell

2009;5:434-41.[12] Mauritz C, Martens A, Rojas SV, et al., Eur Heart J

2011;32:2634-41.[13] Yoshida Y, Yamanaka S. iPS cells: a source of cardiac

regeneration. J Mol Cell Cardiol 2011;50:327-32.[14] Muller-Ehmsen J, Krausgrill B, Burst V, et al., J Mol Cell

Cardiol 2006;41:876-84.[15] Templin C, Kotlarz D, Marquart F, et al., Basic Res Cardiol

2006;101:301-10.[16] Templin C, Kotlarz D, Faulhaber J, et al. , J Mol Cell Car-

diol 2008;45:394-403.[17] Gandolfi F, Vanelli A, Pennarossa G, Rahaman M, Acocel-

la F, Brevini TA., Theriogenology 2011;75:1416-25.[18] Bengel FM, Schachinger V, Dimmeler S. , Eur J Nucl Med

Mol Imaging 2005;32 Suppl 2:S404-16.[19] de Almeida PE, van Rappard JR, Wu JC., Am J Physiol

Heart Circ Physiol 2011;301:H663-71.[20] Wu JC, Abraham MR, Kraitchman DL., J Nucl Med

2010;51 Suppl 1:128S-136S.[21] Ruggiero A, Thorek DL, Guenoun J, Krestin GP, Bernsen

MR. , Eur Radiol 2012;22:189-204.[22] Dohan O, De la Vieja A, Paroder V, et al., Endocr Rev

2003;24:48-77.[23] Laflamme MA, Chen KY, Naumova AV, et al., Nat Bio-

technol 2007;25:1015-24.[24] Muller-Ehmsen J, Krausgrill B, Burst V, et al., Journal of

molecular and cellular cardiology 2006;41:876-84.[25] Teng CJ, Luo J, Chiu RC, Shum-Tim D., J thoracic & cardi-

ovascular surgery 2006;132:628-32.[26] Al Kindi A, Ge Y, Shum-Tim D, Chiu RC, Frontiers in bios-

cience 2008;13:2421-34.

Korrespondenzadressen

22-24_LW4_12_Templin_Martin_Stammz_tg.indd 24 07.11.2012 17:48:52 Uhr

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LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 25

Expertenpanel Stammzellen

Stammzell-Techniken

Claudia Kleinhans

Manfred Köller

25_LW4_12_Experten_rot.indd 25 08.11.2012 12:14:22 Uhr

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26 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Stammzellen Automation

Industrialisierung der Herstellung von iPSZ

iPS-Zellen – Herausforderung an die industrielle Produktionstechnologie

26-27_LW4_12_Bruestle_Stammz_tg.indd 26 08.11.2012 12:15:15 Uhr

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LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 27

Automation Stammzellen

Zelluläre Krankheitsmodelle für die Medikamentenentwicklung

β β

β ββ

ββ

β β

Stem Cell Factory

Literatur

[1] Steven D Schwartz,S.D., Hubschman, JP., Heilwell, G., Franco-Cardenas, V., Pan, C.K., Ostrick, R.M., Mickunas, E., Gay, R., Klimanskaya, I., Lanz, R., Lancet 379 (2012), 713–20.

[2] Takahashi K., Tanabe K., Ohnuki M., Narita M., Ichisaka T., Tomoda K., Yamanaka S., Cell 131(5) (2007), 861-72.

[3] Haupt, S.; Grützner, J.; Thier, M.; Kallweit, T.; Rath, B.; Laufen-berg, I.; Forgber, M.; Eberhardt, J.; Edenhofer, F.; Brüstle, O., Biotechnology and Applied Biochemistry (2012), DOI: 10.1002/bab.1014.

[4] Terstegge, S., Laufenberg, I., Pochert, J., Schenk, S., Itskovitz-Eldor, J., Endl, E., und Brüstle, O., Biotechnol Bioeng 96 (2007), 195-201.

[5] Webpage Tissue Factory: http://www.tissue-factory.com[6] Walles, H., Pickert, D., Kaufmann, M., GIT Labor-Fachzeitschrift

(2011), 552-554[7] Koch, P., Opitz, T., Steinbeck, J.A., Ladewig, J., Brüstle, O., Proc

Natl Acad Sci USA 106(9) (2009), 3225-30. [8] Koch, P., Breuer, P., Peitz, M., Jungverdorben, J., Kesavan, J.,

Poppe, D., Doerr, J., Ladewig, J., Mertens, J., Tüting, T., Hoffmann, P., Klockgether, T., Evert, B.O., Wüllner, U., Brüstle, O., Nature 480 (2011), 543–546.

[9] Koch, P., Tamboli, I. Y., Mertens, J., Wunderlich, P., Ladewig, J., Stuber, K., Esselmann, H., Wiltfang, J., Brustle, O., Walter, J., Am J Pathol 180(6) (2012), 2404-16.

[10] Ebert, A.D., and C.N. Svendsen. 2010. Allison D. Ebert1,2, Yu, Y., Rose, F.F., Mattis, V.B., Lorson, C.L., Thomson, J.A., and Svend-sen, C.N., Nature 457(2010), 277-280.

[11] Malan D, Friedrichs S, Fleischmann BK, Sasse P. Circ Res. 2011 Sep 30;109(8):841-7.

[12] Yazawa, M., Hsueh, B., Jia, X., Pasca, A.M., Bernstein, J.A., Hallmayer, J., and Ricardo E. Dolmetsch, Nature 471 (2011), 230.

Korrespondenzadressen

26-27_LW4_12_Bruestle_Stammz_tg.indd 27 09.11.2012 12:00:48 Uhr

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28 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Stammzellen Markierung

In vivo-Stammzelltracking mit Nanobeads

Suche nach dem idealen Kontrastmittel zur Zellmarkierung und zum Tracking

Auf dem Weg zu klinischen Studien des Stammzelltrackings mittels MNPs

Stammzellen in klinischen Studien Anzahl Studien davon Tracking mit MNP

Neuronale Stammzellen 858 1

Mesenchymale Stammzellen 2643 1

Hämatopoetische Stammzellen 660 1

Embryonale Stammzellen 24 –

Gesamt 4185 3

28-29_LW4_12_Hieronymus.indd 28 09.11.2012 12:01:30 Uhr

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LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 29

Markierung Stammzellen

Probleme und Perspektiven

Literatur[1] www.clinicaltrials.gov[2] Schwarz S., Wong J. E., Bornemann J., Hodenius M.,

Himmelreich U., Richtering W., Hoehn M., Zenke M., and Hieronymus T. (2012) Nanomedicine 8:682-691.

[3] Schwarz S., Fernandes F., Sanroman L., Hodenius M., Lang C., Himmelreich U., Schmitz-Rode T., Schueler D., Hoehn, M., Zenke, M., Hieronymus, T. (2009) J. Magn. Magn. Mater. 321:1533-1538

[4 Cromer Berman S. M., Walczak P., and Bulte J. W. M. (2011) Wiley Interdiscip. Rev. Nanomed. Nanobiotech-nol. 3: 343-355.

[5] Bernsen M. R., Moelker A. D., Wielopolski P. A., van Tiel S. T., and Krestin G. P. (2010) Eur Radiol. 20:255-74.

Korrespondenzadresse

28-29_LW4_12_Hieronymus.indd 29 08.11.2012 12:22:14 Uhr

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30 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Bioinformatik Metabolomics

Stoffwechselanalyse: Neue Wege im Labyrinth entdecken

Bioinformatik

Metabolomics, Genomics, …

30-32_LW4_12_Kaleta-Heiland_ml.indd 30 08.11.2012 12:22:59 Uhr

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LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 31

Metabolomics Bioinformatik

Neue Wege in der Krebstherapie

Auf der Suche nach NAD-Synthesewegen

Ordnung im biochemischen „Chaos“

30-32_LW4_12_Kaleta-Heiland_ml.indd 31 08.11.2012 12:23:26 Uhr

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32 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Bioinformatik Metabolomics

Der Schlüssel zum Labyrinth

Literatur[1] Beuster, G., K. Zarse, et al. (2011). „Inhibition of alanine

aminotransferase in silico and in vivo promotes mito-chondrial metabolism to impair malignant growth.“ J Biol Chem 286(25): 22323-22330.

[2] de Figueiredo, L. F., T. I. Gossmann, et al. (2011). „Pa-thway analysis of NAD+ metabolism.“ Biochem J 439(2): 341-348.

[3] Gossmann, T. I., M. Ziegler, et al. (2012). „NAD(+) biosynthesis and salvage--a phylogenetic perspective.“ FEBS J 279(18): 3355-3363.

[4] Kaleta, C., L. F. de Figueiredo, et al. (2011). „In silico evidence for gluconeogenesis from fatty acids in hu-mans.“ PLoS Comput Biol 7(7): e1002116.

[5] Nikiforov, A., C. Dolle, et al. (2011). „Pathways and subcellular compartmentation of NAD biosynthesis in human cells: from entry of extracellular precursors to mitochondrial NAD generation.“ J Biol Chem 286(24): 21767-21778.

[6] Rongvaux, A., F. Andris, et al. (2003). „Reconstructing eukaryotic NAD metabolism.“ Bioessays 25(7): 683-690.

[7] Schuster, S., D. A. Fell, et al. (2000). „A general defi ni-tion of metabolic pathways useful for systematic orga-nization and analysis of complex metabolic networks.“ Nat Biotechnol 18(3): 326-332.

Korrespondenzadressen

Was passiert, wenn sich das Labyrinth kontinuierlich verändert

30-32_LW4_12_Kaleta-Heiland_ml.indd 32 07.11.2012 18:00:25 Uhr

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Paperwelt Bioinformatik

LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 33

NGS-Patzer ausmerzen

Martin Löwer

33_LW4_12_BioInf_POM_Castle_ml.indd 33 07.11.2012 18:01:05 Uhr

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34 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Bioinformatik Bildverarbeitung

Fiji: eine offene Plattform für wissenschaftliche Bildanalysen

Vorhang auf für Fiji

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LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 35

Bildverarbeitung Bioinformatik

Die Alles-inklusive-Lösung

Warum Open Source?

Wohin geht die Reise?

Literatur[1] Der Name „Fiji“ ist eine Hommage an das GNU Projekt,

das die Programme rund um den Linux-Kernel entwickelte, die Linux erst zum Durchbruch verhalfen. Analog zu dem „G“ in der Abkürzung „GNU“ – GNU‘s Not Unix – steht der Buchstabe „F“ in Fiji ebenfalls für das Projekt selbst: Fiji Is Just ImageJ. Man möge dies als Hinweis werten, dass Fiji auch aus Freude am Detail entwickelt wird.

[2] Die Entscheidung, wann Datenmanipulation ethisch ver-tretbar ist, und wann sie Daten derart verfälscht, dass sie als unethisch gelten muss, ist oftmals eine Gratwanderung. Der folgende Abschnitt im Fiji Wiki mag hier als Hilfestel-lung dienen: http://fi ji.sc/Links#Image_Processing_and_Ethics

Korrespondenzadressen

34-36_LW4_12_Schindelin_ml.indd 35 08.11.2012 12:24:18 Uhr

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36 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Bioinformatik Genomics

Datenbanktechnologie beflügelt personalisierte Medizin

Umfassende Wissensdatenbank

36-37_LW4_12_Schapranow_ml.indd 36 08.11.2012 12:25:37 Uhr

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LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 37

Genomics Bioinformatik

Ergebnisse in Wimpernschlagdistanz

NCBI, UCSC etc.: Alles in einer Wolke

Literatur[1] http://epic.hpi.uni-potsdam.de/Home/HigProject

Korrespondenzadresse

36-37_LW4_12_Schapranow_ml.indd 37 08.11.2012 12:26:05 Uhr

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38 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Bioinformatik Expertenpanel

Burkhard Rost

Edgar Wingender

Was die Zukunft bringt

38_LW4_12_Bioinf_Experten_ml.indd 38 08.11.2012 12:27:39 Uhr

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LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 39

Seite bitte abtrennen – per Fax an 030-264921-11 Verbände Service

Dt. Ver. Gesell. f. Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin e.V. (DGKL)

Geschäftsstelle der DGKLFriesdorfer Str. 15353175 BonnTel.: +49-(0)-228-92-68-9522Fax: +49-(0)[email protected]

Deutsche Gesellschaft für Proteomforschung

c/o MPI für BiochemieAm Klopferspitz 18a82152 MartinsriedTel.: +49-(0)-89-1897-9007Fax: +49-(0)[email protected]

BIO Deutschland

Tegeler Weg 33/berlinbiotechpark10589 BerlinTel.: +49-(0)-30-3450593-30 Fax: +49-(0)-30-3450593-59 [email protected]

Deutsche Gesellschaft für Hygiene und Mikrobiologie (DGHM)

c/o Institut für Hygiene und Med. MikrobiologieCarl-Neuberg-Straße 130625 HannoverTel.: +49-(0)-511-532-4655Fax: +49-(0)-511-532-4355www.dghm.org

bts (Biotechnologische Studenten-initiative e.V.)

c/o BIOCOMLützowstraße 33–3610785 BerlinTel.: +49-(0)-30-2649-21-21Fax: +49-(0)-30-2649-21-11www.bts-ev.de

Gesellschaft für Genetik

c/o HZM – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit/Inst. of Develop-mental GeneticsTel.: +49-(0)-89-3187-2610Fax: +49-(0)-89-4620www.gfgenetik.de

Gesellschaft für Signaltransduktion

c/o Prof. Dr. Ralf HassMed. Hochschule HannoverAG Biochemie u. Tumorbiol.30625 HannoverTel.: +49-(0)-511-532-6070Fax: +49-(0)-511-532-6071www.sigtrans.de

Gesellschaft für Pharmakologie und Toxikologie

Geschäftsstelle der DGPTAchenbachstraße 4340237 DüsseldorfTel.: +49-(0)-211-600-692-77Fax: +49-(0)[email protected]

Nationales Genomforschungsnetz

c/o DKFZIm Neuenheimer Feld 58069120 HeidelbergTel.: +49-(0)-6221-424-743Fax: +49-(0)[email protected]

Deutsche Gesellschaft für Neurogenetik

Institut für Humangenetik Calwer Straße 772076 TübingenTel.: +49-(0)-7071-2977692Fax: +49-(0)[email protected]/dgng/

Netzwerk Nutrigenomik

Netzwerk NutrigenomikArthur-Scheunert-Allee 11414558 NuthetalTel.: +49-(0)-33200-88-301Fax: +49-(0)[email protected]

DiagnostikNet-BB

Netzwerk DiagnostikBerlin-Brandenburg e.V.Neundorfstraße 1716761 HenningsdorfTel.: +49-(0)-3302-55-199-14Fax: +49-(0)-3302-55-199-10f.adams@diagnostiknet-bb.dewww.diagnostiknet-bb.de

Verband der Diagnostica-Industrie e.V.

Verband derDiagnostica-Industrie e.V.Neustädtische Kirchstr. 810117 BerlinTel.: +49-(0)-30-200-599-40 Fax: +49-(0)[email protected]

ÖsterreichischeReinraumgesellschaft (ÖRRG)

ÖRRGNeudorf 41A-8262 Ilz Tel.: +43-(0)-3385-8117 Fax: +43-(0)-3385-8117offi [email protected] www.oerrg.at

Österreichische Ges. f. Laboratoriums-medizin & Klinische Chemie

ÖGLMKC GeschäftsstelleInfomedica-KEG, Xenius BehalTullnertalgasse 72A-1230 WienTel./Fax: +43-(0)-1889-6238 offi [email protected]

www.oeglmkc.at

Kontakt zu Verbänden

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40 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Branche Labormarkt im Umbruch

Roche Diagnostics: Korrektur, keine Krise

Zukunftsgebiet molekulare Diagnostik

Personalisierte Medizin im Blick

Roche Diagnostics in Zahlen:

Umsatz: 8 Mrd. Euro (nur Roche Dx)Gewinn (EBITDA): 1,9 Mrd. Euro (nur Roche Dx)Operative Marge: k. A.

Börsenwert (Roche gesamt): 106 Mrd. EuroMitarbeiter: 27.380 (nur Roche Dx) COO: Roland Diggelmann

Umsätze Life Sciences nach Regionen

l Europa, Mittlerer Osten, Afrika: 50%l Asien/Australien: 13%l Nordamerika: 25%l andere: 12%

Umsatz nach Sparten:

l Professional Diagnostics: 48%l Diabetes Care: 27%l Molecular Diagnostics: 11%l Applied Science: 8%l Tissue Diagnostics: 6%

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LABORWELT 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 | 41

Kalender Service

Veranstaltungskalender

Info: EMBL Heidelberg(Web: www.embl.de/training/events/2012/OMX12-01/index.html)

Info: Deutsche Bundesstiftung Umwelt(Web: www.dbu.de)

Info: Kathrin Schuberth, Bayern Innovativ(Web: www.bayern-innovativ.de/biopolymere2012)

Info: Esa Kokkonen, The Baltic Institute of Finland (Web: www.scanbaltforum.org)

Info: Dr. Almut Graebsch, BioM Biotech Cluster Development GmbH (Web: www.m4.de/mbc)

Info: Stephanie Giesen, Internationales Technologie- und Service-Center Baesweiler (its)(Web: www.its-center.de)

Info: Marine Lhomel, BioWin(Web: www.biowinday2012.org)

Info: Kristin Rafferty, Boehmert & Boehmert/FCBA/BIO Deutschland(Web: http://events.SignUp4.com/berlin2012)

Info: Fraunhofer-Inst. Zellth./Immunologie, Leipzig(Web: www.fs-leipzig.com)

Info: Dr. Frank Eiden, BioChemGate&ChemBioTec (Web: www.chembiotec.de)

Info: Dr. Marion Kwart, Klinkner & Partner(Web: www.klinkner.de)

Info: Dr. Tanja Jutzi, NGFN c/o DKFZ(Web: www.ngfn-meeting.de)

Info: btS e.V. (Web: www.sciecon.info)

Info: Uta Holmer, BIOCOM AG(Web: www.biocom.de/events)

Info: BayTech Akademie(Web: http://www.baytech.de/seminare.html)

Info: Renate Strauß, DECHEMA e. V.(Web: http://events.dechema.de)

Info: Sarah Pegden, Terrapinn(Web: www.terrapinn.com/2013/cellculture)

Info: (UBM Canon, Web: http://medteceurope.com)

Info: Humboldt-Universität Berlin (Web: www.dgms2013.hu-berlin.de)

10.-12. Dezember 2012, Saarbrücken

Labor-Akkreditierung

18.-19. Februar 2013, Freising

Grundlagen der Fermentation

22.-23. November 2012, München

Munich Biomarker Conference

41_LBW4_12_Termine_mak.indd 41 08.11.2012 12:33:18 Uhr

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42 | 13. Jahrgang | Nr. 4/2012 LABORWELT

Ausblick

Medikamentenforschung braucht neue Wege

Marktchance Orphan Drugs

LABORWELT (ISSN 1611-0854) erscheint vierteljährlich im Verlag der

BIOCOM AGLützowstraße 33–3610785 Berlin, GermanyTel.: 030/264921-0Fax: 030/[email protected]

RedaktionDipl.-Biol. Thomas GabrielczykTel.: 030/264921-50 Dr. Martin LaquaTel.: 030/264921-68

AnzeigenleitungOliver SchnellTel. 030/264921-45, [email protected]

LeserserviceAngelika Werner Tel. 030/264921-40

Graphik-DesignMichaela Reblin

Druck:Druckhaus Humburg GmbH28325 Bremen

Für einen regelmäßigen Bezug von LABORWELT ist eine kostenlose Registrierung unter www.biocom.de oder per Fax erforderlich.

Namentlich gekennzeichnete Beiträge stehen in der inhaltlichen Verantwortung der Autoren.Alle Beiträge sind urheberrechtlich geschützt. Ohne schriftliche Genehmigung des BIOCOM Verlages darf kein Teil in irgendeiner Form reproduziert oder mit elektronischen Systemen verarbeitet, vervielfältigt oder verbreitet werden.Titelbild: © IMBA, Wiien

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Thema Personalisierte Medizin

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PHUSION® is a registered trademark and property of Thermo Fisher Scientifi c. Phusion® DNA Polymerase was developed by Finnzymes Oy, now a part of Thermo Fisher Scientifi c. ACCUPRIME™ is a trademark of Life Technologies, Inc.PFUULTRA™ is a trademark of Agilent Technologies, Inc.LABCHIP® is a registered trademark of Caliper Life Sciences, part of Perkin Elmer, Inc.PLATINUM® is a registered trademark of Life Technologies, Inc.Q5™ is a trademark of New England Biolabs, Inc.

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